[发明专利]一种基于LFD-RMA法检测幽门螺杆菌的引物探针组在审

专利信息
申请号: 202110452393.X 申请日: 2021-04-26
公开(公告)号: CN113046455A 公开(公告)日: 2021-06-29
发明(设计)人: 陈龙;陈大为;张瑶 申请(专利权)人: 济南国益生物科技有限公司
主分类号: C12Q1/689 分类号: C12Q1/689;C12Q1/6844;C12Q1/04;C12N15/11
代理公司: 济南信在专利代理事务所(特殊普通合伙) 37271 代理人: 黄波
地址: 250100 山东省济南*** 国省代码: 山东;37
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摘要:
搜索关键词: 一种 基于 lfd rma 检测 幽门 螺杆 引物 探针
【说明书】:

本申请属于生物检测技术领域,具体为一种基于LFD‑RMA法检测幽门螺杆菌的引物探针组,包括检测幽门螺杆菌的引物对及对应的探针,所述下游引物的5’端用Biotin标记;探针的5’端用FAM标记,第31个碱基T替换为THF(dSpacer),3’末端被阻断基团C3‑spacer修饰;扩增产物大小不超过500bp。本发明的检测方法简单、无创、快速,准确度高,安全性好,可广泛应用于幽门螺杆菌的快速检测。

技术领域

本申请属于生物检测技术领域,具体为一种基于LFD-RMA法检测幽门螺杆菌的引物探针组。

背景技术

幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,HP)是一种革兰氏阴性杆菌,其生存能力极强,能够在胃中强酸性环境中生存,是目前发现的唯一能够在胃里面生存的细菌,人是它的唯一宿主和传染源。HP是消化性溃疡发生和治疗后复发的主要原因,它在十二指肠溃疡患者中检出率高达95%-100%,胃溃疡患者中的检出率在70%以上。同时,HP可以引起胃癌和胃黏膜相关淋巴组织淋巴瘤的发生,被世界卫生组织明确列为Ⅰ类致癌物。HP在全世界各地的感染率各异,主要取决于人种差异、居住环境、卫生条件、经济状况、受教育程度、高危职业(医护人员)等因素,但总体感染人数庞大。我国成人感染率统计数字不一,但普遍认为在50%以上。大部分感染者是无症状的,只有在体检时做相关检查才能发现;少部分人会表现为消化不良的症状;10%-20%的感染者会发生消化性溃疡;更少一些人会发生胃癌或胃黏膜相关淋巴组织淋巴瘤。因此快速准确地检测HP感染对大众健康具有重要意义。

目前幽门螺杆菌的检查主要有血清Hp抗体检测、尿素呼气实验、粪便幽门螺杆菌抗原检测和荧光定量PCR检测。其中血清抗体检验由于无法区分是既往感染还是正在感染,一般用于人群感染率的流行病学调查;粪便Hp抗原检测的普及度还不是很高;尿素呼气实验目前广泛用于临床上判断感染和治疗后的复查,但要检查前4周内停用或禁用抗生素、铋剂和抑酸药物,且易出现假阳性;荧光定量PCR方法灵敏高效,但费用高昂,不适合在基层医院推广普及。

而重组酶介导扩增(Recombinase Mediated Amplification,RMA)技术,是近年来发展出的一种敏感、特异、简便、快捷的等温核酸扩增技术,被认为是可替代PCR的核酸检测技术,主要依赖重组酶、单链DNA结合蛋白(SSB)和链置换DNA聚合酶三种酶。RMA反应可以在37-42℃进行,整个过程在30min内即可达到检测水平,可实现核酸的快速扩增。RMA技术可以与侧流免疫层析技术(LFD)相结合进行扩增产物的检测,既不要求特殊仪器设备,也无需复杂的样品处理,仅使用侧流层析试纸就可以通过肉眼观察结果,因此可实现幽门螺杆菌的快速检测。

发明内容

为了解决现有技术的问题,本申请提供了一种基于LFD-RMA法检测幽门螺杆菌的引物探针组,本申请是通过下述方案实现的:

一种基于LFD-RMA法检测幽门螺杆菌的引物探针组,包括检测幽门螺杆菌的引物对及对应的探针,其中,引物和探针序列为:

HP-F:

5’-GGCGTGCCTAATACATGCAAGTCGAACGATGAA-3’;

HP-R:

5’-[Biotin]ATTGAGCAATATTCCCTACTGCTGCCTCCCGTA-3’;

HP-P:

5’-[FAM]AGGCTATGACGGGTATCCGGCCTGAGAGGG[dSpacer]GAACGGACACACTGGA[C3-spacer]-3’。

优选的,所述下游引物的5’端用Biotin标记;探针的5’端用FAM标记,第31个碱基T替换为THF(dSpacer),3’末端被阻断基团C3-spacer修饰;扩增产物大小不超过500bp。

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