[发明专利]一种识别阿尔茨海默症相关生物标志物的相关性分析方法在审

专利信息
申请号: 202110459297.8 申请日: 2021-04-27
公开(公告)号: CN113130004A 公开(公告)日: 2021-07-16
发明(设计)人: 位凯;孔薇 申请(专利权)人: 上海海事大学
主分类号: G16B20/20 分类号: G16B20/20;G16B40/00;G06K9/32;G06T7/00
代理公司: 上海元好知识产权代理有限公司 31323 代理人: 张妍;张静洁
地址: 201306 上海市*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 一种 识别 阿尔茨海默症 相关 生物 标志 相关性 分析 方法
【权利要求书】:

1.一种识别阿尔茨海默症相关生物标志物的相关性分析方法,其特征在于,基于联合连通性的稀疏非负矩阵分解,将结构磁共振成像SMRI、单核苷酸多态性位点SNP和基因表达数据同时投影到一个公共特征空间中,还添加了大脑每个区域的连通性信息和遗传数据作为先验知识,以识别与阿尔茨海默病患者、早期认知障碍患者相关的感兴趣区域ROI,风险SNP位点和风险基因。

2.如权利要求1所述的识别阿尔茨海默症相关生物标志物的相关性分析方法,其特征在于,所述相关性分析方法的和目标函数如下:

令和为Wij≥0、(HI)ij≥0的拉格朗日乘数,

L关于W和HI的偏导数是:

基于Karush-Kuhn-Tucher条件,ΨijWij为0,且(HI)ij为0,得到Wij和(HI)ij

其中,X1代表输入的sMRI影像数据,X2代表SNP数据,X3代表基因表达数据;W是三种数据的基矩阵,Hi(i=1,2,3…)分别是三种数据的系数矩阵,Ai(i=1,2,3…)代表不同数据之间的邻接矩阵,Bi(i=1,2,3…)代表每种数据的拉普拉斯矩阵;λi、βi、γi(i=1,2,3…)是控制各约束项稀疏性的参数;i,j分别代表矩阵的第i行和第j列;k代表共表达模块数。

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