[发明专利]检测携带风险染色体的胚胎的引物组合物、产品及方法

说明书

本发明提供了一种检测携带风险染色体的胚胎的引物组合物、产品及方法，所述引物组合物包括致病基因NF1CDS区域及致病基因NF1上下游2M内的SNP位点的引物，本发明能够在检测SNP位点的同时检测胚胎中的致病位点，通过家系与胚胎中致病位点的连锁关系构建单体型从而进行胚胎植入前单基因遗传学检测，所述试剂盒对男方、女方和胚胎进行单体型分析和致病位点直接测序检测，测序得到携带致病位点的胚胎所对应的单体型为风险染色体，则另外一条为正常染色体，扩大了胚胎植入前单基因遗传学检测的应用范围，可以应用于由于新发突变或者其他原因无法获得完整家系的情况。

【技术领域】

本发明涉及胚胎移植检测技术领域，尤其涉及一种检测携带风险染色体的胚胎的引物组合物、产品及方法。

【背景技术】

单基因病是由一个或一对等位基因突变引起的疾病，其遗传方式及再发风险符合孟德尔规律。大部分单基因病目前没有有效的治疗方法。胚胎植入前单基因遗传学检测(Preimplantation Genetic Testing for Monogenic，PGT-M)通过对胚胎进行遗传学检测，选择正常胚胎移植从而避免因选择性流产给孕妇及家庭带来的伤害。

直接对胚胎致病位点进行检测，有可能因等位基因脱扣(Allele drop-out,ADO)而导致误诊。采用单核苷酸多态性(single-nucleotide polymorphism，SNP)连锁分析结合变异位点检测，可避免胚胎囊胚细胞单细胞扩增过程中的ADO。SNP是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性，是人类可遗传变异中最常见的一种。位于一条染色体特定区域的一组相互关联，并倾向于以整体遗传给后代的单核苷酸多态性的组合，被称作单体型(haplotype)。利用SNP位点构建家系单体型，通过连锁关系可以将致病基因所在的染色体与正常染色体区分开来，从而判断胚胎是否携带致病基因，可以避免胚胎直接检测中因等位基因脱扣而导致的误诊，提高异常胚胎的检出率，改善妊娠结局。

现有技术利用SNP连锁分析的方法进行胚胎植入前单基因遗传学检测需要完整的家系样本(例如男方、女方、先证者；或者男方、男方父母、女方、女方父母；或者男方、女方、其他家系成员等)通过连锁分析进行单体型构建、区分风险染色体，从而对胚胎进行单体型分析，选择不携带风险染色体的胚胎。不足之处是，当受检者没有完整家系时，无法通过连锁关系区分风险染色体。Ⅰ型神经纤维瘤是一种常染色体显性遗传病，其中约半数患者由于NF1基因的新发变异导致(GeneReviews，Last Revision:June 6,2019)，患病个体的后代有50％的风险遗传变异的NF1等位基因，新发变异家系无法通过家系连锁关系区分风险染色体。

因此，有必要研究一种检测携带风险染色体的胚胎的引物组合物、产品及方法来应对现有技术的不足，以解决或减轻上述一个或多个问题。

【发明内容】

有鉴于此，本发明提供了一种检测携带风险染色体的胚胎的引物组合物、产品及方法，能够在检测SNP位点的同时检测胚胎中的致病位点，通过家系与胚胎中致病位点的连锁关系构建单体型从而进行胚胎植入前单基因遗传学检测，所述试剂盒对男方、女方和胚胎进行单体型分析和致病位点直接测序检测，测序得到携带致病位点的胚胎所对应的单体型为风险染色体，则另外一条为正常染色体，扩大了胚胎植入前单基因遗传学检测的应用范围，可以应用于由于新发突变或者其他原因无法获得完整家系的情况。

一方面，本发明提供一种检测携带风险染色体的胚胎的引物组合物，所述引物组合物包括致病基因NF1 CDS区域及致病基因NF1上下游2M内的SNP位点的引物。

如上所述的方面和任一可能的实现方式，进一步提供一种实现方式，所述致病基因NF1为人类致病基因NF1。

如上所述的方面和任一可能的实现方式，进一步提供一种实现方式，所述致病基因NF1 CDS及内含子区域的序列为SEQID NO：143-338。