[发明专利]一种鸡胫长性状相关的SNP分子标记及其应用

说明书

本发明公开了一种鸡胫长性状相关的SNP分子标记及其应用。所述SNP分子标记位于galGal6版鸡基因组1号染色体的第135355110位核苷酸，对应于鸡TMEM182基因中的突变位点g.602GA，所述SNP分子标记的基因型为AA、GA和GG。其中AA基因型个体胫长和胫直径显著长于GA和GG基因型个体。本发明的SNP分子标记，即鸡TMEM182基因内含子1序列中的突变位点g.602GA与胫长性状相关，是一个新的分子标记，通过确定该鸡SNP位点的基因型对鸡胫长性状进行早期选择，可以节省生产成本并加快遗传进展，更好地应用于鸡选育中，具有很大的经济应用价值和科研价值。

技术领域

本发明涉及遗传工程技术领域，特别涉及一种鸡胫长性状相关的SNP分子标记及其应用。

背景技术

消费市场很大程度上决定了鸡的育种方向。在我国，因鸡爪富含胶原蛋白、磷脂、铜等营养物质，具有降脂降压、促进身体各组织系统发育修复等功效，同时风味独特、料理方式丰富，深受消费者(尤其是南方地区、东部沿海地区群众)喜爱。但由于国外家禽品种多为白羽快大型，其鸡爪大，胶原蛋白多，外观整洁、光亮，所以大中型批发市场上供应的鸡爪多为进口货，深受国内经销商及部分消费者的青睐，而国产鸡爪相比偏小，而胫长是影响消费者采购鸡爪的重要因素之一。

然而传统的育种方式是采用杂交育种的方式，将父母本杂交，形成不同的遗传多样性，再通过对杂交后代的筛选，获得胫长较优的后代。但是其育种过程缓慢，需要耗费大量时间。育种的结果复杂而不可预期，需要大量的选种、制种工作。

发明内容

本发明目的在于提供一种鸡胫长性状相关的SNP分子标记及其应用，以解决现有技术中所存在的一个或多个技术问题，至少提供一种有益的选择或创造条件。

本发明第一方面提供了一种SNP分子标记。所述SNP分子标记位于galGal6版鸡基因组1号染色体的第135355102位核苷酸，对应于鸡TMEM182基因内含子1序列中的突变位点g.594GA，所述SNP分子标记的基因型为AA、GA和GG。

本发明第二方面提供特异性扩增上述SNP分子标记的引物对，优选为上游引物PCR-F和下游引物PCR-R，具体为：

上游引物PCR-F：5′–ACAAGACGACCTTCAA–3′(SEQ ID No.1)，

下游引物PCR-R：5′–ACACCATTCCCACCT–3′(SEQ ID No.2)。

本发明第三方面提供所述SNP分子标记在鸡胫长性状相关育种中的应用。

具体的应用包括利用所述SNP分子标记的基因型对鸡胫长性状进行早期选择。

在本发明的一些应用实施方式中，所述方法包括如下步骤：

1)提取待测鸡的DNA；

2)以待测鸡的DNA为模板，利用核苷酸序列分别如SEQ ID No.1和SEQ ID No.2所示的上游引物、下游引物进行PCR扩增，获得含鸡TMEM182基因片段的PCR产物；

3)检测鸡TMEM182基因片段的突变位点g.594GA的基因型；

4)基于步骤3)检测所得的基因型对待测鸡的胫长性状进行早期选择，其中AA基因型个体胫长和胫直径显著长于GA和GG基因型个体。

在本发明的一些应用实施例中，步骤2)检测所得PCR产物的核苷酸序列如SEQ IDNo.3所示。该所述PCR产物的长度为762bp，所述SNP分子标记位于所述PCR产物的第153位碱基。

与现有技术相比，本发明具有以下有益效果：