[发明专利]一种基于分子动力学模拟油酸钠在一水硬铝石表面吸附性能的方法在审
申请号: | 202110483858.8 | 申请日: | 2021-04-30 |
公开(公告)号: | CN113191001A | 公开(公告)日: | 2021-07-30 |
发明(设计)人: | 欧乐明;王晨亮 | 申请(专利权)人: | 中南大学 |
主分类号: | G06F30/20 | 分类号: | G06F30/20;G16C10/00;G06F119/14 |
代理公司: | 长沙轩荣专利代理有限公司 43235 | 代理人: | 李崇章 |
地址: | 410000 湖南*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 分子 动力学 模拟 油酸 硬铝 表面 吸附 性能 方法 | ||
1.一种基于分子动力学模拟油酸钠在一水硬铝石表面吸附性能的方法,其特征在于,具体包括:
根据矿物结构库构建一水硬铝石超晶胞,并构建油酸根离子模型、钠离子模型和水分子模型,并按照预设的原料比构建油酸钠与一水硬铝石的吸附体系初始模型;
将所述吸附体系初始模型采用steep最陡下降法和cg共轭梯度法进行体系能量极小化处理,获得能量极小化体系;
将所述能量极小化体系采用NPT系综进行分子动力学模拟获得预平衡体系,并将所述预平衡体系采用NVT系综进行分子动力学模拟;并获取体系的作用结果快照和轨迹;
根据所述作用结果快照和轨迹,获得吸附体系及分子结构变化,并计算吸附体系各物质在模拟过程动力学信息。
2.根据权利要求1所述的基于分子动力学模拟油酸钠在一水硬铝石表面吸附性能的方法,其特征在于,所述一水硬铝石超晶胞为(5~30)×(5~30)×(1~4)。
3.根据权利要求1所述的基于分子动力学模拟油酸钠在一水硬铝石表面吸附性能的方法,其特征在于,所述按照预设的原料比构建油酸钠与一水硬铝石的吸附体系初始模型具体为:
将油酸根与水分子数量比例为5-50:5000-50000的数量比填充于两个一水硬铝石层之间。
4.根据权利要求1所述的基于分子动力学模拟油酸钠在一水硬铝石表面吸附性能的方法,其特征在于,所述能量极小化处理和分子动力学模拟过程中,所述一水硬铝石采用CLAYFF力场,所述油酸根离子及钠离子采用CHARMM力场,所述水分子采用SPC/E模型。
5.根据权利要求1所述的基于分子动力学模拟油酸钠在一水硬铝石表面吸附性能的方法,其特征在于,所述分子动力学模拟过程的温度控制采用V-rescale方法,模拟温度范围为273.15-333.15K。
6.根据权利要求1所述的基于分子动力学模拟油酸钠在一水硬铝石表面吸附性能的方法,其特征在于,所述分子动力学模拟过程的压力控制采用Berendsen方法,模拟压力范围为1.0-5.0bar。
7.根据权利要求1所述的基于分子动力学模拟油酸钠在一水硬铝石表面吸附性能的方法,其特征在于,所述NPT系综进行分子动力学模拟时间为0.2-3.0ns,所述NVT系综进行分子动力学模拟时间为20-100ns。
8.根据权利要求1所述的基于分子动力学模拟油酸钠在一水硬铝石表面吸附性能的方法,其特征在于,所述模拟过程动力学信息具体包括RMSD方均根偏差、密度分布、RDF径向分布函数、角度分布、簇分析、相互作用能。
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