[发明专利]一种基于循环肿瘤DNA预测非小细胞肺癌术后复发的NGS panel及其用途

权利要求书

1.同时检测下列769个基因突变的试剂在制备预测非小细胞肺癌术后复发的试剂盒中的用途，所述试剂是检测人血浆中ctDNA基因突变的试剂：

ABCA13、ABCA8、ABCB1、ABCC2、ABCC9、ABL1、ACADSB、ACOT13、ACRC、ADCY8、AGAP1、AK7、AKT1、AKT2、AKT3、ALDH5A1、ALK、ALOX12B、ALS2CR11、AMBRA1、AMER1、ANAPC7、ANKRD28、ANKRD46、ANO1、APAF1、APC、APOL2、APOPT1、AQR、ARAF、AR、ARHGAP26、ARHGAP4、ARHGAP6、ARHGEF12、ARHGEF3、ARID1A、ARID1B、ARID2、ARID4A、ARID5B、ARL13B、ARL4A、ARL6IP6、ARMC5、ASB11、ASH1L、ASPH、ASXL1、ASXL2、ATG3、ATG4C、ATIC、ATM、ATP6V0A1、ATP6V0A2、ATP6V0A4、ATP6V0E1、ATP8A1、ATR、ATRX、AURKA、AURKB、AXIN1、AXIN2、AXL、B2M、BAP1、BARD1、BCAS1、BCL2、BCL2L11、BCL2L1、BCL6、BCOR、BCR、BIRC3、BIVM-ERCC5、BLM、BMPR1A、BRAF、BRCA1、BRCA2、BRD4、BRIP1、BRMS1L、BRS3、BTF3、BTG1、BTK、C22orf23、C5orf15、C5orf42、C7orf66、C8orf34、CAB39、CACNA1E、CACNA2D1、CALD1、CALM2、CALR、CARD11、CASP8、CAST、CBFB、CBL、CBR3、CBR4、CCDC157、CCDC18、CCND1、CCND2、CCND3、CCNE1、CD274、CD40、CD74、CD79A、CD79B、CDA、CDC73、CDCA8、CDH1、CDK12、CDK4、CDK6、CDK8、CDKL3、CDKN1A、CDKN1B、CDKN2A、CDKN2B、CDKN2C、CDO1、CEBPA、CEP120、CEP290、CHD1、CHD2、CHEK1、CHEK2、CHRM3、CHURC1-FNTB、CIC、CLASP2、CLEC16A、CLEC9A、CNKSR3、CNOT8、COL15A1、COX18、CPS1、CREBBP、CRKL、CSF1R、CSF3R、CTAGE5、CTCF、CTLA4、CTNNB1、CTSC、CUL3、CXCR4、CYBA、CYFIP1、CYLD、CYP19A1、CYP2B6、CYP2C19、CYP2C8、CYP2D6、DARS2、DAXX、DCHS2、DDR1、DDR2、DDX19B、DDX58、DEPDC5、DHFR、DIAPH1、DIAPH2、DICER1、DIS3、DLC1、DMXL1、DNAJB1、DNAJC11、DNMT1、DNMT3A、DNMT3B、DOCK11、DOT1L、DPP6、DPYD、DSCAM、E2F3、EBP、EED、EGFR、EIF1AX、EIF4E、EIF4G3、ELFN1、ELMOD2、EML4、ENOSF1、ENSA、EP300、EPCAM、EPG5、EPHA3、EPHA5、EPHA7、EPHB1、EPYC、ERBB2、ERBB3、ERBB4、ERCC1、ERCC2、ERCC3、ERCC4、ERG、ERI1、ERRFI1、ESR1、ETV1、ETV4、ETV5、ETV6、EWSR1、EXOSC8、EZH2、EZR、FAM149A、FAM153B、FAM161A、FAM175A、FAM184B、FAM20A、FAM46C、FANCA、FANCC、FANCD2、FANCF、FANCG、FAS、FAT1、FBXO11、FBXW7、FGF10、FGF16、FGF19、FGF3、FGF4、FGF6、FGFR1、FGFR2、FGFR3、FGFR4、FH、FLCN、FLI1、FLOT1、FLT1、FLT3、FLT4、FMNL2、FMO1、FMR1、FNBP4、FOLH1B、FOXA1、FOXL2、FOXO1、FOXP1、FPGT-TNNI3K、FUBP1、FUS、FXR1、GABRP、GALNT12、GALNT14、GANC、GATA1、GATA2、GATA3、GIPC1、GLI1、GMEB1、GNA11、GNA13、GNAQ、GNAS、GPC4、GPM6A、GRB10、GREM1、GRIK2、GRIN2A、GSK3B、GSKIP、GSTA1、GSTM1、GSTP1、GUCY1A2、H3F3A、HAUS2、HAUS6、HCAR2、HDGFRP3、HERC6、HEY1、HGF、HIST1H1C、HIST1H3B、HLA-A、HLA-B、HLA-C、HMCN1、HNF1A、HNF4A、HOMER1、HRAS、HSD17B11、HSD3B1、HSPA1B、HSPA4、HSPA5、HSPH1、HTT、HYOU1、IARS、ICOSLG、ID2、ID3、IDH1、IDH2、IGF1、IGF1R、IGF2、IKBKE、IKZF1、IL10、IL13RA1、IL7R、IMPG1、INHBA、INPP4A、INPP4B、IRF4、IRF6、IRF8、IRS2、ITGAL、JAK1、JAK2、JAK3、JUN、KDM5A、KDM5C、KDM6A、KDR、KEAP1、KIAA1210、KIAA1841、KIT、KLF4、KMT2A、KMT2C、KMT2D、KPNA4、KPNB1、KRAS、KTN1、LAMA3、LATS1、LATS2、LEPR、LMO1、LNPEP、LONRF3、LRP2、LRRC16A、LRRC34、LYN、MALT1、MAP2K1、MAP2K2、MAP2K4、MAP3K13、MAP3K1、MAP3K4、MAP4K3、MAP4K5、MAPK1、MAPKAP1、MAPKBP1、MARK1、MARK3、MAX、MCL1、MDC1、MDM2、MDM4、MED12、MED12L、MED14、MED19、MEF2BNB-MEF2B、MEIS1、MEN1、MET、METTL9、MITF、MLH1、MLH3、MMP16、MMP3、MPL、MRE11A、MRPL19、MS4A13、MSANTD3-TMEFF1、MSH2、MSH3、MSH6、MTF1、MTF2、MTHFR、MTOR、MTR、MTRR、MUTYH、MYADM、MYB、MYC、MYCL、MYCN、MYD88、MYO10、MYOD1、MYOM1、MZT2A、NAB1、NAMPT、NAPG、NAV1、NBAS、NBEAL1、NBN、NCOA6、NCOR1、NEDD4L、NEO1、NF1、NF2、NFE2L2、NFKBIA、NFXL1、NKAP、NKX2-1、NLRP7、NOTCH1、NOTCH2、NOTCH3、NOTCH4、NPM1、NR1I3、NRAS、NRG1、NRG4、NSD1、NT5C2、NTHL1、NTRK1、NTRK2、NTRK3、NUDT13、NUP85、NUP93、OSBP、OTOGL、OTOS、PAK1、PAK7、PALB2、PAPOLG、PAQR8、PARD6B、PARK2、PARP1、PARP2、PARP3、PARP8、PAX3、PAX5、PBRM1、PDCD1、PDCD1LG2、PDE4D、PDGFRA、PDGFRB、PDPK1、PDS5A、PFKP、PGBD1、PGR、PGRMC2、PHF20、PIGF、PIK3C2G、PIK3C3、PIK3CA、PIK3CB、PIK3CD、PIK3CG、PIK3R1、PIK3R3、PIM1、PKHD1、PLCG2、PLEKHA1、PLEKHH2、PLXNC1、PMS1、PMS2、PNO1、POLA1、POLD1、POLE、POSTN、PPARG、PPP1R21、PPP2R1A、PRDM1、PREX2、PRKAR1A、PRKCI、PRKDC、PRPF39、PRPF4、PTCH1、PTEN、PTK2、PTPN11、PTPN4、PTPRD、PTPRJ、PTPRS、PTPRT、PURA、RAB2B、RABGAP1L、RAC1、RAD21、RAD50、RAD51B、RAD51C、RAD51D、RAD51、RAD52、RAD54L、RAF1、RALGAPB、RAP2B、RARA、RASA1、RB1、RBM10、RBM27、RECQL4、REL、RET、RFC1、RFWD2、RHOA、RHOT1、RICTOR、RIPK2、RIT1、RNF112、RNF19A、RNF43、ROBO1、ROS1、RPF2、RPRD1A、RPS6KB1、RPTOR、RRM1、RRP1B、RUNX1、RWDD1、RYBP、RYR2、SASH1、SCOC、SDHA、SDHAF2、SDHB、SDHC、SEL1L3、SEMA3C、SEMA3E、SERTAD4、SETD2、SF3B1、SFXN4、SH2D1A、SHQ1、SHROOM3、SIMC1、SIPA1L2、SKA3、SLC13A1、SLC22A2、SLC25A13、SLC30A5、SLC31A1、SLC35B1、SLC7A8、SLC9C2、SLCO1B1、SLCO1B3、SLIT1、SLX4、SMAD2、SMAD3、SMAD4、SMARCA4、SMARCB1、SMO、SNX6、SOCS1、SOD2、SOX17、SOX2、SOX9、SPEN、SPOP、SRC、SRSF3、SRY、STAB2、STAG2、STARD4、STAT3、STK11、STMN1、STRBP、STT3A、STYX、SUCLG1、SUFU、SUZ12、SYK、SYNE2、TAF15、TAOK3、TARBP1、TBC1D8B、TBCD、TBX3、TECPR2、TENM3、TERT、TET1、TET2、TFDP1、TFRC、TGFBR1、TGFBR2、TMEM126B、TMEM127、TMEM132D、TMEM67、TMPRSS15、TMPRSS2、TMTC4、TNFAIP3、TNFRSF14、TNFSF13B、TNIK、TNKS、TNRC18、TOP1、TOP2B、TP53、TP63、TPH1、TPM1、TRA2A、TRAF7、TRIM24、TRIM25、TSC1、TSC2、TSHR、TSN、TTC1、TTC6、TTN、TUBD1、TXNDC16、TXNRD1、U2AF1、UBAP2L、UBE2E3、UBE4A、UBN2、UBXN7、UGT1A1、ULK2、ULK4、UMPS、UPF2、USP11、USP34、USP9Y、UTS2、UTY、VEGFA、VHL、VSIG10、WDR5、WHSC1、WHSC1L1、WT1、XIAP、XPC、XPO1、XRCC1、XRCC2、YAP1、YLPM1、YWHAE、ZBBX、ZBTB40、ZDHHC17、ZDHHC20、ZMYM2、ZMYM4、ZNF195、ZNF280D、ZNF283、ZNF2、ZNF367、ZNF711、ZNF805、ZNF91、ZZZ3、ADGRG6、CFAP221、CFAP53、CXCL8、GPAT3、MALRD1、PRELID3B、RIC1、SUGCT、TERT-promoter、SDHD、PIK3R2、P2RY8、CRLF2、ALG9。