[发明专利]一种与绵羊产羔数相关的SNP遗传标记及其应用

说明书

本发明公开了一种与绵羊产羔数相关的SNP遗传标记及其应用。本发明提供了用于检测绵羊基因组中2号染色体上第8283097位脱氧核糖核苷酸是A还是T还是A和T的物质在鉴定绵羊产羔数性状、鉴定绵羊产羔数为多羔还是单羔、鉴定绵羊产羔数多少中的应用。本发明找到了与绵羊产羔相关的最显著遗传标记chr2：8283097，并建立了该标记一种简便的检测应用方法，从而提供一种在现实工作中快速、准确选育优良品种的方法。

技术领域

本发明涉及生物技术领域，具体涉及一种与绵羊产羔数相关的SNP遗传标记及其应用。

背景技术

随着分子生物学和生物信息学的发展，涌现出通过分子标记的方法来进行育种。DNA分子标记的优越性：大多数分子标记具有共显性，对隐形性状的选择有利；分子标记的数量几乎是无限的；检测手段简单、迅速等优点。DNA分子标记主要有限制性片断长度多态性(RestrictionFragmentLengthPolymorphism，RFLPs)标记、随机扩增多态性DNA(RandomAmplifiedPolymorphicDNA，RAPDs)标记、扩增片断长度多态性(AmplifiedFragmentLengthPolymorphisms，AFLPs)、简单重复序列(Simple Sequence Repeats，SSR)、单核苷酸多态性标记(SingleNucleotidePolymorphism，SNP)等。

单核苷酸多态性标记(SingleNucleotidePolymorphism，SNP)是指基于基因组水平上的由单个核苷酸引起的DNA序列多态性。SNP分型的方法主要有基于电泳的检测方法(PCR-RFLP、PCR-SSCP、AS-PCR)、基于荧光定量PCR的检测方法(TaqMan探针法、HRM)、直接测序法、其它检测方法(质谱分析、SNaPshot、LDR)。其中PCR-RFLP是SNP筛查中最经典的方法之一，利用限制性内切酶作用于DNA片段，如果存在SNP位点，酶切产物的长度和数量则会出现差异，通过琼脂糖凝胶电泳就可以判断SNP位点基因型，该方法检测迅速，价格低廉。

绵羊产羔数是重要的经济性状，东弗里升绵羊属于国外典型的高产绵羊品种，具有较高繁殖力。

发明内容

本发明要求保护一种与绵羊产羔数相关的SNP遗传标记及其应用。

第一方面，本发明要求保护一种用于检测绵羊基因组中2号染色体上第8283097位脱氧核糖核苷酸是A还是T还是A和T的物质在如下任一中的应用：

(A1)鉴定或辅助鉴定绵羊产羔数性状；

(A2)制备用于鉴定或辅助鉴定绵羊产羔数性状的产品；

(A3)鉴定或辅助鉴定绵羊产羔数为多羔还是单羔；

(A4)制备用于鉴定或辅助鉴定绵羊产羔数为多羔还是单羔的产品；

(A5)鉴定或者辅助鉴定绵羊产羔数多少；

(A6)制备用于鉴定或者辅助鉴定绵羊产羔数多少的产品。

其中，所述用于检测绵羊基因组中2号染色体上第8283097位脱氧核糖核苷酸是A还是T还是A和T的物质可为引物对或成套引物对或含有所述引物对或所述成套引物对的试剂或试剂盒。

所述引物对由上游引物和下游引物组成；所述上游引物可根据所述绵羊基因组中2号染色体上第8283097位脱氧核糖核苷酸的上游序列进行设计；所述下游引物可根据所述绵羊基因组中2号染色体上第8283097位脱氧核糖核苷酸的下游序列进行设计。

在本发明中，所述引物对为引物对A；所述引物对A由SEQ ID No.1所示的上游引物和SEQ ID No.2所示的下游引物组成。