[发明专利]一种基于可控相分离液滴对细胞内源基因转录过程的高效控制方法在审
申请号: | 202110544532.1 | 申请日: | 2021-05-19 |
公开(公告)号: | CN113337541A | 公开(公告)日: | 2021-09-03 |
发明(设计)人: | 孙育杰;张宏晨;邵世鹏 | 申请(专利权)人: | 北京大学 |
主分类号: | C12N15/85 | 分类号: | C12N15/85;C12N15/62;C12N15/67 |
代理公司: | 北京万象新悦知识产权代理有限公司 11360 | 代理人: | 李稚婷 |
地址: | 100871*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 可控 分离 细胞 内源 基因 转录 过程 高效 控制 方法 | ||
1.一种对细胞内源基因转录过程的控制方法,基于可控相分离液滴和CRISPR/dCas9技术,在细胞内表达模块化组合的转录因子dCas9-VPR-IDR,同时表达识别靶基因目标序列的sgRNA,在sgRNA的介导下使转录激活因子VPR和蛋白无结构区域IDR锚定到靶基因的启动子区域,并借助IDR间多价相互作用发生相分离形成凝聚体液滴,招募更多的转录机器至靶基因启动子区域,高效促进靶基因的转录。
2.如权利要求1所述的控制方法,其特征在于,通过下述步骤实现对细胞内源基因的高效转录激活:
1)利用分子克隆的办法,将具有相分离能力的蛋白无结构区域IDR与dCas9-VPR融合蛋白相融合,构建dCas9-VPR-IDR融合蛋白的表达载体;
2)设计与靶基因相匹配的sgRNA,并构建该sgRNA的表达载体;
3)将步骤1)和2)构建的表达载体一同转染进细胞;
4)筛选出转染成功的细胞;
5)利用sgRNA的指引,dCas9作为DNA锚定平台,将转录激活因子VPR与蛋白无结构区域IDR锚定到靶基因的启动子区域;
6)利用IDR间多价相互作用,提高靶基因启动子区域dCas9-VPR-IDR的浓度,并在达到一定浓度后自发在细胞内形成凝聚体液滴;
7)利用液滴的形成招募更多的转录机器至靶基因启动子区域中,高效促进靶基因的转录过程。
3.如权利要求2所述的控制方法,其特征在于,所述IDR的氨基酸序列选自序列表中SEQIDNo:1~10中的一种。
4.如权利要求2所述的控制方法,其特征在于,在步骤1)中,先使dCas9融合上转录激活因子VPR,再融合上蛋白无结构区域IDR,构建dCas9-VPR-IDR融合蛋白的表达载体。
5.如权利要求2所述的控制方法,其特征在于,在步骤1)构建的dCas9-VPR-IDR融合蛋白的表达载体中,dCas9-VPR-IDR融合蛋白基因采用组成型启动子或诱导型启动子。
6.如权利要求2所述的控制方法,其特征在于,在步骤2)构建的sgRNA的表达载体采用组成型启动子。
7.如权利要求2所述的控制方法,其特征在于,步骤3)采用脂质体转染的方法。
8.如权利要求7所述的控制方法,其特征在于,步骤3)所用脂质体为Lipo-2000。
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