[发明专利]一种基于单色多重荧光定量PCR的鉴别良恶性肺结节的方法在审

专利信息
申请号: 202110560335.9 申请日: 2021-05-21
公开(公告)号: CN113151482A 公开(公告)日: 2021-07-23
发明(设计)人: 严晓芹;胡新蕾;钟晟 申请(专利权)人: 深圳泰莱生物科技有限公司
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12Q1/6883;C12Q1/6851
代理公司: 深圳市优赛朝闻专利代理事务所(普通合伙) 44454 代理人: 谭育华
地址: 518000 广东省深圳市罗湖*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 基于 单色 多重 荧光 定量 pcr 鉴别 恶性 结节 方法
【权利要求书】:

1.一种基于单色多重荧光定量PCR的鉴别良恶性肺结节的方法,包括用于多重荧光PCR检测的上、下游引物以及探针;其特征在于,上、下游引物分别为ADGRB1-F/R、CNTNAP2-F/R、DIP2B-F/R、LONRF2-F/R,探针分别为ADGRB1-probe、CNTNAP2-probe、DIP2B-probe、LONRF2-probe,内参基因β-actin上、下游引物分别为β-actin-F/R,探针为β-actin-probe;

上、下游引物序列具体如下:

ADGRB1-F(SEQ ID No.1):5’-GACAGTGCACTTTCTTCC-3’

ADGRB1-R(SEQ ID No.2):5’-CAGGTTCCTGTAGAGCAC-3’

CNTNAP2-F(SEQ ID No.3):5’-GGCTAGGAAAGGGAAATC-3’

CNTNAP2-R(SEQ ID No.4):5’-GATGCAGAAGATGGATGA-3’

DIP2B-F(SEQ ID No.5):5’-GGAAGGGAAGAAAAGATAAATATC-3’

DIP2B-R(SEQ ID No.6):5’-GCTCTGCCTCAATCAGTA-3’

LONRF2-F(SEQ ID No.7):5’-CAGAGACAAGGAAACAGA-3’

LONRF2-R(SEQ ID No.8):5’-TGGCTTAAAACAACACATA-3’

β-actin-F(SEQ ID No.13):5’-TAGGCACACACTTCCAAG-3’

β-actin-R(SEQ ID No.14):5’-TGGCTCATGCCTGTAATC-3’

探针序列具体如下:

ADGRB1-probe(SEQ ID No.9):5’FAM-CACCACAAACACGGATGCTTCA-3’BHQ1

CNTNAP2-probe(SEQ ID No.10):5’FAM-AAGTACCTGGTTCATCGCACTG-3’BHQ1

DIP2B-probe(SEQ ID No.11):5’FAM-TTGCAGCCAGAATGTAGCCTT-3’BHQ1

LONRF2-probe(SEQ ID No.12):5’FAM-CACAACCTCCAAAGAGAAACGCAT-3’BHQ1

β-actin-probe(SEQ ID No.15):5TexasRed-AATTATCTGTAGAGGTATGGCTTCTCACC-3’BHQ2。

2.一种包括权利要求1所述的基于单色多重荧光定量PCR的鉴别良恶性肺结节的方法,其特征在于,检测步骤如下:

S1、提取血浆游离DNA;

S2、通过葡糖基转移酶T4-β-GT,将含叠氮修饰基团的糖UDP-6-N3-glucose的修饰基团转移到5-羟甲基胞嘧啶的羟甲基上;

S3、在叠氮基团标记的5-羟甲基胞嘧啶上添加一分子生物素二苯基环辛炔-四聚乙二醇-生物素;

S4、将含有5-羟甲基胞嘧啶标记的DNA片段结合在固相材料链霉素亲和素免疫磁珠上;

S5、利用缓冲液多次洗涤所述固相材料去除未结合的DNA片段;

S6、将结合在链霉亲和素免疫磁珠上的DNA洗脱下来,作为模板;

S7、对上述DNA进行多重荧光定量PCR扩增;

S8、收集荧光信号,选择上述荧光基团的荧光检测模式,选择内参基因β-actin为参照,对待测样品进行编板设置;

S9、待测样品荧光扩增曲线呈现良好的对数增长,进行结果分析。

3.根据权利要求2所述的一种基于多重荧光定量PCR技术的鉴别良恶性肺结节的方法,其特征在于,在S3中,通过点击化学方法在叠氮基团标记的5-羟甲基胞嘧啶上添加一分子生物素二苯基环辛炔-四聚乙二醇-生物素。

4.根据权利要求2所述的一种基于多重荧光定量PCR技术的鉴别良恶性肺结节的方法,其特征在于,在S4中,通过固相亲和反应将含有5-羟甲基胞嘧啶标记的DNA片段结合在固相材料链霉素亲和素免疫磁珠上。

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