[发明专利]一种基于单色多重荧光定量PCR的鉴别良恶性肺结节的方法在审
申请号: | 202110560335.9 | 申请日: | 2021-05-21 |
公开(公告)号: | CN113151482A | 公开(公告)日: | 2021-07-23 |
发明(设计)人: | 严晓芹;胡新蕾;钟晟 | 申请(专利权)人: | 深圳泰莱生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6883;C12Q1/6851 |
代理公司: | 深圳市优赛朝闻专利代理事务所(普通合伙) 44454 | 代理人: | 谭育华 |
地址: | 518000 广东省深圳市罗湖*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 单色 多重 荧光 定量 pcr 鉴别 恶性 结节 方法 | ||
1.一种基于单色多重荧光定量PCR的鉴别良恶性肺结节的方法,包括用于多重荧光PCR检测的上、下游引物以及探针;其特征在于,上、下游引物分别为ADGRB1-F/R、CNTNAP2-F/R、DIP2B-F/R、LONRF2-F/R,探针分别为ADGRB1-probe、CNTNAP2-probe、DIP2B-probe、LONRF2-probe,内参基因β-actin上、下游引物分别为β-actin-F/R,探针为β-actin-probe;
上、下游引物序列具体如下:
ADGRB1-F(SEQ ID No.1):5’-GACAGTGCACTTTCTTCC-3’
ADGRB1-R(SEQ ID No.2):5’-CAGGTTCCTGTAGAGCAC-3’
CNTNAP2-F(SEQ ID No.3):5’-GGCTAGGAAAGGGAAATC-3’
CNTNAP2-R(SEQ ID No.4):5’-GATGCAGAAGATGGATGA-3’
DIP2B-F(SEQ ID No.5):5’-GGAAGGGAAGAAAAGATAAATATC-3’
DIP2B-R(SEQ ID No.6):5’-GCTCTGCCTCAATCAGTA-3’
LONRF2-F(SEQ ID No.7):5’-CAGAGACAAGGAAACAGA-3’
LONRF2-R(SEQ ID No.8):5’-TGGCTTAAAACAACACATA-3’
β-actin-F(SEQ ID No.13):5’-TAGGCACACACTTCCAAG-3’
β-actin-R(SEQ ID No.14):5’-TGGCTCATGCCTGTAATC-3’
探针序列具体如下:
ADGRB1-probe(SEQ ID No.9):5’FAM-CACCACAAACACGGATGCTTCA-3’BHQ1
CNTNAP2-probe(SEQ ID No.10):5’FAM-AAGTACCTGGTTCATCGCACTG-3’BHQ1
DIP2B-probe(SEQ ID No.11):5’FAM-TTGCAGCCAGAATGTAGCCTT-3’BHQ1
LONRF2-probe(SEQ ID No.12):5’FAM-CACAACCTCCAAAGAGAAACGCAT-3’BHQ1
β-actin-probe(SEQ ID No.15):5TexasRed-AATTATCTGTAGAGGTATGGCTTCTCACC-3’BHQ2。
2.一种包括权利要求1所述的基于单色多重荧光定量PCR的鉴别良恶性肺结节的方法,其特征在于,检测步骤如下:
S1、提取血浆游离DNA;
S2、通过葡糖基转移酶T4-β-GT,将含叠氮修饰基团的糖UDP-6-N3-glucose的修饰基团转移到5-羟甲基胞嘧啶的羟甲基上;
S3、在叠氮基团标记的5-羟甲基胞嘧啶上添加一分子生物素二苯基环辛炔-四聚乙二醇-生物素;
S4、将含有5-羟甲基胞嘧啶标记的DNA片段结合在固相材料链霉素亲和素免疫磁珠上;
S5、利用缓冲液多次洗涤所述固相材料去除未结合的DNA片段;
S6、将结合在链霉亲和素免疫磁珠上的DNA洗脱下来,作为模板;
S7、对上述DNA进行多重荧光定量PCR扩增;
S8、收集荧光信号,选择上述荧光基团的荧光检测模式,选择内参基因β-actin为参照,对待测样品进行编板设置;
S9、待测样品荧光扩增曲线呈现良好的对数增长,进行结果分析。
3.根据权利要求2所述的一种基于多重荧光定量PCR技术的鉴别良恶性肺结节的方法,其特征在于,在S3中,通过点击化学方法在叠氮基团标记的5-羟甲基胞嘧啶上添加一分子生物素二苯基环辛炔-四聚乙二醇-生物素。
4.根据权利要求2所述的一种基于多重荧光定量PCR技术的鉴别良恶性肺结节的方法,其特征在于,在S4中,通过固相亲和反应将含有5-羟甲基胞嘧啶标记的DNA片段结合在固相材料链霉素亲和素免疫磁珠上。
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