[发明专利]一种混合DNA分型亲缘关系确定方法及系统在审
申请号: | 202110569291.6 | 申请日: | 2021-05-25 |
公开(公告)号: | CN113160892A | 公开(公告)日: | 2021-07-23 |
发明(设计)人: | 王洪友 | 申请(专利权)人: | 北京众诚天合系统集成科技有限公司 |
主分类号: | G16B30/10 | 分类号: | G16B30/10 |
代理公司: | 北京化育知识产权代理有限公司 11833 | 代理人: | 尹均利 |
地址: | 100080 北京市海淀区人*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 混合 dna 亲缘 关系 确定 方法 系统 | ||
1.一种混合DNA分型亲缘关系确定方法,其特征在于,所述方法包括:
对混合DNA分型各个基因座中的基因进行组合,得到基因组合结果;
根据所述基因组合结果和比对人的STR基因座值计算每一种基因组合的亲缘关系PI值;
根据所述每一种基因组合的亲缘关系PI值计算平均PI值;
根据所述平均PI值计算亲缘关系RCP值;
根据所述亲缘关系RCP值确定亲缘关系。
2.根据权利要求1所述的混合DNA分型亲缘关系确定方法,其特征在于,所述根据所述基因组合结果和比对人的STR基因座值计算每一种基因组合的亲缘关系PI值,具体包括:
依次假定两人为各种亲缘关系;
利用各种亲缘关系PI值公式表依次计算各种亲缘关系的PI值。
3.根据权利要求2所述的混合DNA分型亲缘关系确定方法,其特征在于,所述各种亲缘关系PI值公式表如下:
其中Pi、Pj指当前基因座人群基因频率,Ai,Aj是指不同分型的情况,i、j、k和r指的是将基因分型的可能出现的情况全部列出,是为了区分不同的等位基因。
4.根据权利要求1所述的混合DNA分型亲缘关系确定方法,其特征在于,所述根据所述每一种基因组合的亲缘关系PI值计算平均PI值,具体包括:
根据平均PI值计算公式计算平均PI值,所述平均PI值计算公式为:式中,PI表示平均PI值,n、m和o分别表示每个基因座中的基因组合个数,PIn、PIm和PIo分别表示每一种基因组合的亲缘关系PI值,k表示基因座个数。
5.根据权利要求1所述的混合DNA分型亲缘关系确定方法,其特征在于,所述根据所述每一种基因组合的亲缘关系PI值计算平均PI值之前,还包括:
根据所述混合DNA分型中的基因座等位基因数量判断所述混合DNA分型的混合人数;
根据所述混合人数将STR值完全不匹配的基因组合的PI值丢弃。
6.根据权利要求1所述的混合DNA分型亲缘关系确定方法,其特征在于,所述根据所述平均PI值计算亲缘关系RCP值,具体包括:
利用亲缘关系RCP值计算公式计算所述亲缘关系RCP值,所述亲缘关系RCP值计算公式为:RCP=PI/(PI+1),式中,RCP表示亲缘关系RCP值,PI表示平均PI值。
7.根据权利要求1所述的混合DNA分型亲缘关系确定方法,其特征在于,所述根据所述亲缘关系RCP值确定亲缘关系,具体包括:
利用RCP分布表得出各种亲缘关系的概率;
当RCP全同胞概率大于99.99%时,全同胞占66.48%,无关个体占0%,具有显著差异,推断为全同胞关系;
当RCP半同胞概率大于99.99%时,半同胞占1.52%,无关个体占0%,具有显著差异,推断为半同胞关系;
当RCP一代堂表兄概率在10%~90%范围内时,一代堂表兄弟占82.87%,无关个体占90%,差异不明显,无法推断;
当RCP二代堂表兄概率在10%~90%范围内时,二代堂表兄弟占99.84%,无关个体占99.98%,差异不明显,无法推断。
8.根据权利要求7所述的混合DNA分型亲缘关系确定方法,其特征在于,所述RCP分布表为:
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