[发明专利]一种混合DNA分型亲缘关系确定方法及系统在审

专利信息
申请号: 202110569291.6 申请日: 2021-05-25
公开(公告)号: CN113160892A 公开(公告)日: 2021-07-23
发明(设计)人: 王洪友 申请(专利权)人: 北京众诚天合系统集成科技有限公司
主分类号: G16B30/10 分类号: G16B30/10
代理公司: 北京化育知识产权代理有限公司 11833 代理人: 尹均利
地址: 100080 北京市海淀区人*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 一种 混合 dna 亲缘 关系 确定 方法 系统
【权利要求书】:

1.一种混合DNA分型亲缘关系确定方法,其特征在于,所述方法包括:

对混合DNA分型各个基因座中的基因进行组合,得到基因组合结果;

根据所述基因组合结果和比对人的STR基因座值计算每一种基因组合的亲缘关系PI值;

根据所述每一种基因组合的亲缘关系PI值计算平均PI值;

根据所述平均PI值计算亲缘关系RCP值;

根据所述亲缘关系RCP值确定亲缘关系。

2.根据权利要求1所述的混合DNA分型亲缘关系确定方法,其特征在于,所述根据所述基因组合结果和比对人的STR基因座值计算每一种基因组合的亲缘关系PI值,具体包括:

依次假定两人为各种亲缘关系;

利用各种亲缘关系PI值公式表依次计算各种亲缘关系的PI值。

3.根据权利要求2所述的混合DNA分型亲缘关系确定方法,其特征在于,所述各种亲缘关系PI值公式表如下:

其中Pi、Pj指当前基因座人群基因频率,Ai,Aj是指不同分型的情况,i、j、k和r指的是将基因分型的可能出现的情况全部列出,是为了区分不同的等位基因。

4.根据权利要求1所述的混合DNA分型亲缘关系确定方法,其特征在于,所述根据所述每一种基因组合的亲缘关系PI值计算平均PI值,具体包括:

根据平均PI值计算公式计算平均PI值,所述平均PI值计算公式为:式中,PI表示平均PI值,n、m和o分别表示每个基因座中的基因组合个数,PIn、PIm和PIo分别表示每一种基因组合的亲缘关系PI值,k表示基因座个数。

5.根据权利要求1所述的混合DNA分型亲缘关系确定方法,其特征在于,所述根据所述每一种基因组合的亲缘关系PI值计算平均PI值之前,还包括:

根据所述混合DNA分型中的基因座等位基因数量判断所述混合DNA分型的混合人数;

根据所述混合人数将STR值完全不匹配的基因组合的PI值丢弃。

6.根据权利要求1所述的混合DNA分型亲缘关系确定方法,其特征在于,所述根据所述平均PI值计算亲缘关系RCP值,具体包括:

利用亲缘关系RCP值计算公式计算所述亲缘关系RCP值,所述亲缘关系RCP值计算公式为:RCP=PI/(PI+1),式中,RCP表示亲缘关系RCP值,PI表示平均PI值。

7.根据权利要求1所述的混合DNA分型亲缘关系确定方法,其特征在于,所述根据所述亲缘关系RCP值确定亲缘关系,具体包括:

利用RCP分布表得出各种亲缘关系的概率;

当RCP全同胞概率大于99.99%时,全同胞占66.48%,无关个体占0%,具有显著差异,推断为全同胞关系;

当RCP半同胞概率大于99.99%时,半同胞占1.52%,无关个体占0%,具有显著差异,推断为半同胞关系;

当RCP一代堂表兄概率在10%~90%范围内时,一代堂表兄弟占82.87%,无关个体占90%,差异不明显,无法推断;

当RCP二代堂表兄概率在10%~90%范围内时,二代堂表兄弟占99.84%,无关个体占99.98%,差异不明显,无法推断。

8.根据权利要求7所述的混合DNA分型亲缘关系确定方法,其特征在于,所述RCP分布表为:

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