[发明专利]结直肠癌代谢基因预后预测模型有效
申请号: | 202110581928.3 | 申请日: | 2021-05-25 |
公开(公告)号: | CN113151483B | 公开(公告)日: | 2022-08-12 |
发明(设计)人: | 甘露;袁艺洮;孙珣;刘梦玲;刘天舒 | 申请(专利权)人: | 复旦大学附属中山医院 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886 |
代理公司: | 上海卓阳知识产权代理事务所(普通合伙) 31262 | 代理人: | 周春洪 |
地址: | 200032 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 直肠癌 代谢 基因 预后 预测 模型 | ||
本发明涉及一种结直肠癌代谢基因预后预测模型,涉及生物标志物UGT2A、ACAA2、PKM、GPX3、PAFAH1B3、SOX9,本发明还包括检测所述标志物表达量的试剂在制备评估结直肠癌预后生存的试剂盒中的应用。本发明基于该诊断标志物以及相应的预测模型(即根据6个代谢相关基因的表达量与其系数的乘积之和,同时合并患者的临床特征,)来判断患者的预后性,具有高效、精准预测结直肠癌患者预后的优点,为临床医师对结直肠癌患者的治疗决策提供有效的指导意见,减少无效治疗的发生,从而降低患者的治疗成本和不适体验。
技术领域
本发明涉及生物医学技术领域,具体地说,是结直肠癌代谢基因预后预测模型。
背景技术
结直肠癌是发生在结肠和直肠的恶性肿瘤,早期无症状,或症状不明显,仅感不适、消化不良、大便潜血等。随着癌肿发展,症状逐渐出现,表现为大便习惯改变、腹痛、便血、腹部包块、肠梗阻等,伴或不伴贫血、发热和消瘦等全身症状。肿瘤因转移、浸润可引起受累器官的改变。因其发部位不同而表现出不同的临床症状及体征。检查方式通常包括:实验室检查(如血常规、生化全项等)、内镜检查以及活体组织检查和脱落细胞学检查,治疗方式一般包括:手术治疗、综合治疗以及放射治疗等。
目前CRC患者的预后预测主要依赖于TNM分期系统,但这仍有一定的局限性,即使TNM分期相同的CRC患者,其预后差异也很大。不少研究证实利用基因表达谱可用来对肿瘤进行精确分子分类、预测肿瘤进展,肿瘤转移、复发及预后等多个方面。代谢重编程是癌症中被广泛观察到一个重要标志,虽然已有数百个代谢基因的改变与肿瘤的发生和发展有关,但这些代谢基因的重要预后作用仍不清楚。同时,现有研究大部分仅限于单个基因层面,对结直肠癌代谢相关的基因特征缺少整体认识。
考虑到上述缺陷,本发明重在探究肿瘤代谢相关的基因特征与患者预后的相关性,为临床上对患者预后预测提供依据。关于本发明结直肠癌代谢基因预后预测模型目前还未见报道。
发明内容
本发明的目的是针对现有技术的不足,提供一种结直肠癌代谢基因预后预测模型及其应用。
为实现上述目的,本发明采取的技术方案是:
第一方面,本发明提供了诊断标志物组合在构建结直肠癌预后预测模型中的应用,所述诊断标志物组合为UGT2A、ACAA2、PKM、GPX3、PAFAH1B3和SOX9。
优选地,所述预测模型还包括检测UGT2A、ACAA2、PKM、GPX3、PAFAH1B3和SOX9表达量的试剂。
优选地,所述模型包括如下内容:Risk score=(-0.0238858734550774*UGT2Aexpression)+(-0.0202490519677621*ACAA2 expression)+(0.00249902116300055*PKM expression)+(0.016732446126655*GPX3 expression)+(-0.0169630246913455*PAFAH1B3expression)+(-0.00816612242034761*SOX9 expression),当Risk score-0.76时,判断为高风险状态,高风险组的患者预后比低风险组患者的预后差,同时根据给出的列线图,通过对患者Risk score,TNM分期,与风险评分进行积分量表评分,进一步计算样本的总评分,并使用转换函数估计每个患者在三个时间点(1年,3年和5年)的生存概率。
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