[发明专利]一种基于外周血内基因甲基化的肺癌诊断试剂盒有效
申请号: | 202110587831.3 | 申请日: | 2021-05-27 |
公开(公告)号: | CN113278697B | 公开(公告)日: | 2022-05-27 |
发明(设计)人: | 李镭;李为民 | 申请(专利权)人: | 四川大学华西医院 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12N15/11 |
代理公司: | 成都高远知识产权代理事务所(普通合伙) 51222 | 代理人: | 李高峡;张娟 |
地址: | 610000 四*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 外周血内 基因 甲基化 肺癌 诊断 试剂盒 | ||
1.检测外周血内基因的甲基化水平的试剂在制备肺癌诊断试剂中的用途,其特征在于:所述基因为TBCEL、GPI、UBE2S、TOX、PPL、H2AFX、FOXA1、TTC7B、ZNF799、WNT10B、KCNQ3、GFI1、CCDC170、RAET1G和EFNB2。
2.如权利要求1所述的用途,其特征在于:所述检测外周血内基因的甲基化水平的试剂为甲基化测序试剂;所述甲基化测序试剂包括重亚硫酸盐试剂、测序建库试剂和PCR扩增试剂。
3.如权利要求2所述的用途,其特征在于:所述PCR扩增试剂包括引物对,引物对序列如SEQ ID NO.1~30所示。
4.如权利要求1所述的用途,其特征在于:所述检测外周血内基因的甲基化水平的试剂为甲基化特异性PCR试剂、甲基化敏感性单核苷酸引物延伸试剂、甲基化敏感性单链构象分析试剂或甲基化敏感性变性梯度凝胶电泳试剂。
5.一种肺癌诊断试剂盒,其特征在于:所述试剂盒包括检测外周血中基因TBCEL、GPI、UBE2S、TOX、PPL、H2AFX、FOXA1、TTC7B、ZNF799、WNT10B、KCNQ3、GFI1、CCDC170、RAET1G和EFNB2甲基化水平的试剂;所述试剂包括引物对,引物对序列如SEQ ID NO.1~30所示。
6.一种区分良性肺疾病和肺癌的诊断系统,其特征在于:包括模型训练模块和预测模块;所述模型训练模块用于对已确诊为良性肺疾病或肺癌患者的外周血中基因TBCEL、GPI、UBE2S、TOX、PPL、H2AFX、FOXA1、TTC7B、ZNF799、WNT10B、KCNQ3、GFI1、CCDC170、RAET1G和EFNB2甲基化水平进行机器学习训练,得到区分良性肺疾病和肺癌患者的二分类模型;
所述预测模块用于将待检测患者的外周血中基因TBCEL、GPI、UBE2S、TOX、PPL、H2AFX、FOXA1、TTC7B、ZNF799、WNT10B、KCNQ3、GFI1、CCDC170、RAET1G和EFNB2甲基化水平输入前述二分类模型,得出患者为良性肺疾病或肺癌患者的诊断结果。
7.如权利要求6所述的诊断系统,其特征在于:所述机器学习训练为采用LASSO回归模型进行训练。
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