[发明专利]基于自监督密集卷积神经网络的肝脏肿瘤识别方法在审
申请号: | 202110593311.3 | 申请日: | 2021-05-28 |
公开(公告)号: | CN113362295A | 公开(公告)日: | 2021-09-07 |
发明(设计)人: | 潘奇;李凯旋;杜佳忆;任芳;杨自华;李鹏;杨延延;王梦祥 | 申请(专利权)人: | 西安医学院第二附属医院 |
主分类号: | G06T7/00 | 分类号: | G06T7/00;G06T7/11;G06K9/38;G06K9/46;G06K9/62;G06N3/04;G06N3/08 |
代理公司: | 西安千沃知识产权代理事务所(普通合伙) 61262 | 代理人: | 徐选怀 |
地址: | 710038 陕*** | 国省代码: | 陕西;61 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 监督 密集 卷积 神经网络 肝脏 肿瘤 识别 方法 | ||
1.一种基于自监督密集卷积神经网络的肝脏肿瘤识别方法,其特征在于,包括以下步骤:
步骤1、根据患者的磁共振图像,从多个交叉方向进行切片得到切片数据集{A};
步骤2、对切片数据集{A}进行预处理,对切片数据集中的部分图片进行病灶标注,得到有标注数据集{X}和无标注数据集{Y};
步骤3、构建Densenet网络并训练,Densenet网络包括依次连接的特征提取模块、全连接层和Softmax函数,将切片数据集{A}中的每个图片分割为多个图块,并对每个图块进行序号标注,将分割后的图块打乱顺序输入至Densenet网络对其进行训练,Densenet网络输出每个图块在原始图像中的位置信息;
步骤4、构建密集卷积神经网络,包括编码模块和解码模块,将训练好的DenseNet网络作为编码模块用于特征提取,解码模块为Up-sampling模块和Denseblock模块的三次堆叠,Up-sampling模块和Denseblock模块与解码模块的特征提取部分密集连接,并在最后的Denseblock模块上连接卷积层和Softmax函数;
步骤5、将有标注数据集{X}中的每个图像分割为多个图块后作为密集卷积神经网络的输入,对密集卷积神经网络进行训练,编码模块对图块进行整体分类,含有病灶像素的图块进行解码模块的计算,经过Softmax函数进行像素级别的二分类判断实现对图像的语义分割,得到该块图像的语义分割结果,不含有标注的病灶像素的图块不进行解码计算直接输出该块图像,解码模块最终将多块图像的输出结果按分割顺序还原,得到标注有病灶位置区域的原始图像。
2.根据权利要求1所述的一种基于自监督密集卷积神经网络的肝脏肿瘤识别方法,其特征在于,步骤1中采用两个交叉方向进行切片,并且两个方向相互垂直。
3.根据权利要求1所述的一种基于自监督密集卷积神经网络的肝脏肿瘤识别方法,其特征在于,步骤2中对切片数据集{A}进行预处理为图像标准化处理处理,图像标准化处理方法如下:
其中,表示未标准化处理前的切片数据集的所有图像数据矩阵,下标i和j表示图像数据矩阵的行和列,下标k表示不同的图像,I和J表示矩阵在行和列的像素个数,K表示图像的总数量,MaxP表示所有像素的最大值,MinP表示所有像素的最小值,Pi,j,k表示标准化处理后的切片数据集的所有图像数据矩阵。
4.根据权利要求1所述的一种基于自监督密集卷积神经网络的肝脏肿瘤识别方法,其特征在于,步骤3中所述特征提取模块包括卷积层、多个交替连接的Denseblock模块和Transition模块,卷积层与第一个Denseblock模块连接,最后一个Denseblock模块上再连接一个卷积层。
5.根据权利要求4所述的一种基于自监督密集卷积神经网络的肝脏肿瘤识别方法,其特征在于,步骤3中密集卷积网络采用SGD梯度下降优化算法,使用交叉熵函数计算损失函数,训练过程中采用自适应更新网络学习率的策略。
6.根据权利要求5所述的一种基于自监督密集卷积神经网络的肝脏肿瘤识别方法,其特征在于,所述损失函数的计算方法如下:
其中,m为图像分割后的数量,labeli,j表示图像块j所属类别i,predicti,j表示图像块j属于类别i的预测概率。
7.根据权利要求1所述的一种基于自监督密集卷积神经网络的肝脏肿瘤识别方法,其特征在于,所述密集卷积神经网络使用SGD梯度下降优化算法,使用交叉熵函数计算损失函数,训练过程中采用自适应更新网络学习率的策略,自监督学习网络的损失函数包括整体判断的分类损失函数L1和像素判断的损失函数L2,训练时监测两者的变化。
8.根据权利要求1所述的一种基于自监督密集卷积神经网络的肝脏肿瘤识别方法,其特征在于,所整体判断的分类损失函数L1的计算式如下:
L1=-[label·log(predict)+(1-label)·log(1-predict)]
其中,predict是预测图像存在病灶区域标注的概率,label是样本标签;
每一图块的像素判断的损失函数L2方法为单个像素点的损失函数求和,其公式如下:
其中,n表示图像的总像素点个数,predicti是模型预测图像第i个像素点属于癌细胞的概率,labeli是第i个像素点的样本标签。
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