[发明专利]一种鉴定小麦叶片绒毛基因的分子标记、引物组和应用

说明书

本发明提供了一种鉴定小麦叶片绒毛基因的分子标记、引物组和应用。该基因为一个新基因，被定位在小麦地方品种白毛麦的7BS染色体上，命名为QLP.saas‑7BS；其被定位于SNP芯片探针AX‑86175290和AX‑86172908之间，根据探针序列分别开发了KASP标记，分别命名为KASP‑AX‑86175290和KASP‑AX‑86172908。本发明用新开发的KASP分子标记能有效检测和筛选小麦绒毛性状，将分子标记技术应用在选育小麦具有叶片绒毛表型性状品种中，节约了生产成本、提高了选择效率，缩短小麦品种的育种周期；且其检测方便快速，不受环境影响。

技术领域

本发明涉及分子生物学领域，具体涉及一种鉴定小麦叶片绒毛新基因的分子标记、引物组和应用。

背景技术

小麦叶片的主要功能是进行光合作用，制造有机物，同时也是小麦呼吸和蒸腾的重要器官。小麦的叶片有5种，有盾片（退化叶）、胚芽鞘（不完全叶）、分蘖鞘（不完全叶）、壳（变态叶）和绿叶（完全叶）。我们通常说的叶片是指发育完全的绿叶。这种叶由叶身（叶片）、叶枕、叶鞘、叶耳和叶舌组成。叶片与叶鞘的连接处叫叶枕。叶鞘着生在茎节上，包围节间的全部或一部分，主要功能是加强茎秆强度，也可进行光合作用。叶舌位于叶片与叶鞘的交界处，主要功能是防止雨水、灰尘和害虫侵入叶鞘；叶耳很小，着生在叶片基部左右两侧，环抱茎秆，有的品种没有叶耳。叶耳有红、紫、绿等不同颜色，可作为鉴定品种的标志。小麦叶片数因品种和环境及栽培措施有一定变化，但在一定地区都有其最适的主茎叶数，并且相对而言比较稳定。有的品种叶片上有绒毛，小麦叶片绒毛是一个重要的与抗逆相关的表型性状，有叶片绒毛的小麦材料具有很多抗逆性，比如抗旱，抗虫，抗紫外线损伤等。目前，栽培小麦品种的叶片绒毛很少，几乎没有绒毛。

现有技术中对叶片绒毛基因的分子遗传机理研究较少,特别是有关基因的定位等分子基础研究尚不深入；关于鉴定小麦绒毛基因的分子标记尚未见报道，也没有利用分子标记辅助选择对小麦绒毛的育种选择也未见报道。

发明内容

本发明的目的在于提供一种鉴定小麦叶片绒毛新基因的分子标记、引物组和应用。

为实现上述目的，本发明提供了以下技术方案：

本发明提供的一种鉴定小麦叶片绒毛基因的分子标记，该基因定位在地方品种白毛麦的7BS染色体上，命名为QLP.saas-7BS，是一个小麦叶片绒毛相关的新基因位点；根据中国春参考基因组（IWGSC RefSeq v2.1）比对分析，所述QLP.saas-7BS定位区间为AX-86175290（物理位置为61106266-61106336b）和AX-86172908（物理位置为60629908-60629979b）之间的0.48Mb区间内；利用QLP.saas-7BS位点侧翼探针AX-86175290和AX-86172908开发两对KASP特异连锁标记，所述连锁标记为KASP-AX-86175290的KASP标记和KASP-AX-86172908的KASP标记；所述标记KASP-AX-86175290和KASP-AX-86172908 的核苷酸序列分别为，

KASP-AX-86172908：

FAM：GAAGGTGACCAAGTTCATGCTTGCACAACCAGTCAGCAGAAA

HEX：GAAGGTCGGAGTCAACGGATTTGCACAACCAGTCAGCAGAAG

COM：TCGGGATATTGAATTCTTGAGCTAC；

KASP-AX-86175290：

FAM: GAAGGTGACCAAGTTCATGCT TGCAGTGAAGTTATTAACACC，

HEX：GAAGGTCGGAGTCAACGGATT TGCAGTGAAGTTATTAACACT，

COM：ATATGCAGTACAGATCTTTCACAG。