[发明专利]一种检测妥布霉素的生物传感器及检测方法有效
申请号: | 202110613808.7 | 申请日: | 2021-06-02 |
公开(公告)号: | CN113341128B | 公开(公告)日: | 2023-05-16 |
发明(设计)人: | 吕蓓;李大为;周兵 | 申请(专利权)人: | 江苏第二师范学院 |
主分类号: | G01N33/53 | 分类号: | G01N33/53;C12Q1/6825;C12Q1/682 |
代理公司: | 南京业腾知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 32321 | 代理人: | 李静 |
地址: | 211200 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 霉素 生物 传感器 方法 | ||
1.一种检测妥布霉素的生物传感器,其特征在于,包括适配体探针、发夹探针H1、发夹探针H2、Klenow Fragment聚合酶、Nt. BbvCI核酸内切酶、缓冲液和氧化石墨烯;
所述适配体探针的核苷酸序列如SEQ ID No:1所示,适配体探针为适配体Aptamer和扩增模板T杂交而成,所述适配体Aptamer的核苷酸序列如SEQ ID No:2所示,所述扩增模板T的核苷酸序列如SEQ ID No:3所示;
所述发夹探针H1的核苷酸序列如SEQ ID No:4所示;
所述发夹探针H2的核苷酸序列如SEQ ID No:5所示。
2.权利要求1所述生物传感器检测妥布霉素的方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)将适配体Aptamer和扩增模板T杂交为适配体探针,加入水和缓冲液,95℃金属浴中孵育3-5min,然后冷却,得到适配体发夹结构产物;
(2)将发夹探针H1、发夹探针H2、水和缓冲液混合后在95℃金属浴中孵育3-5min,冷却后得到发夹结构产物;
(3)将适配体发夹结构产物、妥布霉素检测物、10 x smart cut buffer ,dNTP, Nt.BbvCI核酸内切酶和Klenow Fragment聚合酶混合均匀后金属浴中孵育,然后加入步骤(2)制得的发夹结构产物,混合均匀,得到链置换反应溶液;
(4)往链置换反应溶液中加入氧化石墨烯溶液,金属浴中孵育后,利用荧光分光光度计测量荧光信号。
3.如权利要求2所述生物传感器检测妥布霉素的方法,其特征在于,步骤(1)中,所述适配体探针用量为1 uL、100 μM,水的用量为61.5 uL ,缓冲液为2 x T-100 Na,用量为62.5uL,所述缓冲液 2 x T-100 Na配方:25mM Tris, 100mM NaCl, pH 7.3。
4.如权利要求2所述生物传感器检测妥布霉素的方法,其特征在于,步骤(2)中,所述发夹探针H1和H2的摩尔比为1:1,发夹探针H1和H2的总用量为1 uL、100 μM,水的用量为79 uL,缓冲液为5 x T-500 Na,用量为20 uL,所述缓冲液5 x T-500 Na配方:25 mM Tris, 500mM NaCl, pH 7.3。
5.如权利要求2所述生物传感器检测妥布霉素的方法,其特征在于,步骤(3)中,适配体发夹结构产物用量为1.5 uL、800 nM,妥布霉素检测物为3 uL,10 x smart cut buffer用量为3 uL,dNTP为1 uL 、10 mM, Nt. BbvCI核酸内切酶为2 U,Klenow Fragment聚合酶为0.5 U;所述10 x smart cut buffer配方为:50 mM 乙酸钾,20 mM 三羟基氨甲烷醋酸盐,10 mM 醋酸镁,100 μg/mL 牛血清蛋白,pH 7.9。
6.如权利要求2所述生物传感器检测妥布霉素的方法,其特征在于,步骤(3)中,孵育温度为37 ℃,时间为1-2 h。
7.如权利要求2所述生物传感器检测妥布霉素的方法,其特征在于,步骤(4)中,加入氧化石墨烯溶液后,氧化石墨烯在链置换反应溶液中的终浓度为25 μg / mL。
8.如权利要求2所述生物传感器检测妥布霉素的方法,其特征在于,步骤(4)中,孵育温度为37 ℃,时间为1-2 h。
9.如权利要求2至8任一项所述生物传感器检测妥布霉素的方法,其特征在于,步骤(4)中,设置荧光分光光度计激发波长为480 nm,扫描范围为500 - 650 nm。
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