[发明专利]一种多重目标核酸的微滴式数字检测方法在审
申请号: | 202110641186.9 | 申请日: | 2021-06-09 |
公开(公告)号: | CN113337583A | 公开(公告)日: | 2021-09-03 |
发明(设计)人: | 蒋健晖;楚霞;唐昊;唐丽娟 | 申请(专利权)人: | 湖南大学 |
主分类号: | C12Q1/6844 | 分类号: | C12Q1/6844 |
代理公司: | 北京泛华伟业知识产权代理有限公司 11280 | 代理人: | 李渤;郭广迅 |
地址: | 410082 湖*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 多重 目标 核酸 微滴式 数字 检测 方法 | ||
1.一种多重目标核酸的微滴式数字检测方法,所述方法包括以下步骤:
(1)根据多重目标核酸制备环介导等温扩增反应所需的混合物;
其中所述混合物包括分别针对多重目标核酸设计的引物和探针组,所述引物和探针组中的每组包括2条外引物F3和B3、2条内引物FIP和BIP、环引物和蝎状引物探针;待检测的核酸;
(2)将步骤(1)获得的反应混合物作为分散相,将油相作为连续相,分别注入微流控芯片生成单分散的液滴;
(3)将步骤(2)所述的微流控芯片置于恒定温度下进行扩增反应;
(4)对步骤(3)所述反应后的微流控芯片中的液滴进行荧光信号检测及分析。
2.如权利要求1所述的方法,其中,在步骤(1)中,所述蝎状引物探针的上游区域包含发夹结构,下游区域包含与环引物特异性互补的片段,所述互补的片段长度优选与环引物长度相同;并且,所述蝎状引物探针的5’端碱基上标记荧光基团,与其互补配对的对应碱基上标记淬灭基团。
3.如权利要求1或2所述的方法,其中,在步骤(1)中,所述引物和探针组中的每组的蝎状引物探针所标记的荧光基团不同;
优选地,所述蝎状引物探针的径区包含7~8个碱基,环区包含7~8个碱基;
优选地,所述荧光基团选自FAM、TAMRA和/或Cy5,淬灭基团选自BHQ1和/或BHQ2。
4.如权利要求1至3中任一项所述的方法,其中,在步骤(1)中,所述反应混合物还包含dNTP和聚合酶,优选为Bst 2.0 WarmStartTM聚合酶;
当所述待检测的核酸包含RNA时,所述混合物还包含逆转录酶;优选为AMV逆转录酶;
优选地,所述反应混合物还包含荧光素钠、异硫氰酸荧光素或四乙基罗丹明中的一种或多种,更优选包含荧光素钠;
优选地,所述反应混合物进一步包含一种或多种选自下组的成分:Mg2+、K+、NH4+、H+、Cl-、SO42-、Tris-HCl和细胞表面活性剂;
更优选地,所述反应混合物包含Tris-HCl、KCl、(NH4)2SO4、MgSO4、X-100。
5.如权利要求1至4中任一项所述的方法,其中,在步骤(2)中,所述分散相以微小体积单元的形式分散于连续相中;优选地,所述微小体积单元为10-12~10-15L;
优选地,所述油相为氟化油、矿物油、硅油和/或食用油中的一种或其混合;
优选地,所述油包含表面活性剂;
更优选地,所述油相为含Pico-SurfTM1表面活性剂的氟化油;
优选地,所述微流控芯片为流动聚焦结构,包括:
油相入口,用于注入连续相;
水相入口,用于注入分散相;以及
出口,用于液滴收集。
6.如权利要求1至5中任一项所述的方法,其中,在步骤(3)中,所述反应的温度为60-65℃,优选地为63-64℃。
7.如权利要求1至6中任一项所述的方法,其中,在步骤(4)中,所述检测使用荧光显微镜进行。
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