[发明专利]一种诊断草酸钙结石的肠道菌群标志物及其应用

说明书

本发明公开了一种诊断草酸钙结石的肠道菌群标志物及其应用。检测Burkholderiapseudomallei和/或Bacteroides sp.CAG:443丰度的试剂在制备诊断草酸钙结石的试剂中的应用。本发明首次发现了Burkholderia pseudomallei和Bacteroides sp.CAG:443与草酸钙结石相关，其丰度在草酸钙结石患者和健康人群中呈现显著性差异，ROC曲线分析其作为检测变量具有较高的特异性和敏感性，因此，可以将Burkholderia pseudomallei和/或Bacteroides sp.CAG:443作为检测标志物应用于草酸钙结石患者的诊断。以Burkholderia pseudomallei和/或Bacteroides sp.CAG:443作为检测标志物，完全无创，准确性高。

技术领域：

本发明属于生物医药领域，具体涉及一种诊断草酸钙结石的肠道菌群标志物及其应用。

背景技术：

泌尿系结石是泌尿外科的常见疾病，在住院患者中居首位(《中国泌尿外科和男科疾病诊断治疗指南》(2019版))。影响结石形成的因素有很多，包括年龄、性别、种族、遗传、环境、饮食习惯和职业等，重视结石形成的因素能够减少结石的形成和复发。其中，与结石成分有关的代谢异常越来越受到人们的关注。流行病学的调查结果显示，80％以上的结石都是草酸钙结石。

作为一种多病因所引起的疾病，草酸钙结石的发病机制尚不明确。目前发现微生物可能在肾结石的发病机制和预防中起到重要作用，因此肠道菌群与肾脏疾病的关系是近年来研究的一项热点。研究肠道菌群与草酸钙结石形成的关系，对于揭示草酸钙结石的发病机制以及防治草酸钙结石具有重要的意义。

发明内容

本发明的第一个目的是提供一种诊断草酸钙结石的肠道菌群标志物。

本发明通过收集草酸钙结石患者和健康人的样本，进行全基因组测序以及使用生物信息学进行测序数据的统计，首次发现了Burkholderia pseudomallei和/或Bacteroides sp.CAG:443在草酸钙结石患者和健康人中呈现显著性差异，说明Burkholderia pseudomallei或Bacteroides sp.CAG:443可作为草酸钙结石的预测因子。

因此，本发明提供了一种诊断草酸钙结石的肠道菌群标志物，其为Burkholderiapseudomallei和/或Bacteroides sp.CAG:443。

本发明的第二个目的是提供Burkholderia pseudomallei和/或Bacteroidessp.CAG:443在作为诊断草酸钙结石的标志物中的应用。

本发明的第三个目的是检测Burkholderia pseudomallei和/或Bacteroidessp.CAG:443丰度的试剂在制备诊断草酸钙结石的试剂中的应用。

优选，是检测肠道菌群中Burkholderia pseudomallei和/或Bacteroidessp.CAG:443丰度的试剂在制备诊断草酸钙结石的试剂中的应用。

优选，所述的检测Burkholderia pseudomallei和/或Bacteroides sp.CAG:443丰度的试剂可以是能检测Burkholderia pseudomallei和/或Bacteroides sp.CAG:443丰度的特异性的引物、探针或反义寡核苷酸。

优选，所述的检测肠道菌群是以粪便为样本。

优选，所述的试剂还包括提取微生物基因组DNA的试剂。