[发明专利]基于陆生环境DNA检测斑翅果蝇的试剂盒及其应用有效
申请号: | 202110657622.1 | 申请日: | 2021-06-13 |
公开(公告)号: | CN113151511B | 公开(公告)日: | 2022-03-01 |
发明(设计)人: | 莫晶;张翼飞;刘雨芳;欧雪儿;许铭元;黄汇 | 申请(专利权)人: | 湖南科技大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6851 |
代理公司: | 张家界市慧诚商标专利事务所 43209 | 代理人: | 高红旺 |
地址: | 411201*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 陆生 环境 dna 检测 翅果 试剂盒 及其 应用 | ||
1.一种根据斑翅果蝇基因组特异性DNA序列设计的引物对和Taqman荧光探针在制备基于陆生环境DNA检测斑翅果蝇的试剂盒中的应用,其特征在于,所述斑翅果蝇的基因组特异性DNA序列如SEQ ID NO.1所示。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述引物对包括BCGY4-F和BCGY4-R,所述BCGY4-F的DNA序列如SEQ ID NO.2所示,所述BCGY4-R的DNA序列如SEQ ID NO.3所示;所述Taqman荧光探针的DNA序列如SEQ ID NO.4所示。
3.根据权利要求1或2所述的应用,其特征在于,所述试剂盒还包括缓冲试剂。
4.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,所述应用的方法为:
S1、取果树样本在去离子水中震荡漂洗得到漂洗液;
S2、用卡默尔蠕动泵和直径47mm、孔径10um的Millipore聚碳酸酯蚀滤膜过滤所述漂洗液,使eDNA富集在所述聚碳酸酯蚀滤膜上;
S3、收集所述eDNA,用权利要求1或2中所述的试剂盒进行qPCR反应,根据实验组Cq值与NTC组Cq值的大小关系判断环境中是否含有斑翅果蝇;当实验组Cq值大于NTC组Cq值,说明环境中含有斑翅果蝇。
5.根据权利要求4所述的应用,其特征在于,所述应用还包括定量检测方法,具体为:
S4、提取斑翅果蝇的基因组DNA,测试所述基因组DNA初始浓度,将所述基因组DNA进行梯度稀释;
S5、用权利要求1或2中所述的试剂盒进行qPCR反应,根据不同浓度基因组DNA反应所得的Cq值与基因组DNA浓度建立标准曲线;
S6、将待测eDNA的Cq值代入所述标准曲线中进行计算,获得eDNA含量。
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