[发明专利]一种生物芯片的带有复合标签序列的探针及生物芯片

权利要求书

1.一种带有复合标签序列的探针的设计方法，其特征在于，所述探针的一端连接于所述复合标签序列，所述复合标签序列包括至少2段标签序列，所述复合标签序列中的每一段标签序列能够同时分别与其互补的解码序列发生杂交反应，每段标签序列的长度为8-45mer，每段标签序列均符合以下预设原则：连续的相同碱基不超过8个，GC含量为30%~60%，发夹结构长度不超过8个碱基，自互补片段不超过16个碱基，并且所述复合标签序列与目标基因组不相似，所述不相似是指使用BLAST在目标基因组中找不到与该标签序列E值小于0.05的匹配结果；

所述标签序列由至少2条依次首尾拼接的唯一子序列组成，并且所述唯一子序列和所述标签序列均符合所述预设原则，所述标签序列的生成方法包括：

步骤S1：设定所述唯一子序列的长度为n、所述标签序列的长度为m，m和n分别为构成所述唯一子序列的基本单元的数量，m和n均为正整数且m﹥n，按照预设原则生成所有的长度为n的唯一子序列，即得所述唯一子序列集合；

步骤S2：从所述唯一子序列的集合中随机抽取第一唯一子序列，然后再随机抽取第二唯一子序列，将所述第二唯一子序列拼接到所述第一唯一子序列以得到拼接序列，检查所述拼接序列是否符合所述预设原则；以及

步骤S3：若符合，则继续逐一随机抽取后续唯一子序列并逐一拼接以得到长度不断增加的新的拼接序列，并逐一检查新的拼接序列是否符合所述预设原则以及新的拼接序列的长度是否达到m，当所述新的拼接序列符合所述预设原则且其长度为m时，则将其保存以作为一条所述标签序列。

2.如权利要求1所述的带有复合标签序列的探针的设计方法，其特征在于，所述标签序列的数量为2-5段。

3.如权利要求1所述的带有复合标签序列的探针的设计方法，其特征在于，步骤S2进一步包括步骤：若不符合，则从所述拼接序列中删除所述第二唯一子序列，然后从所述唯一子序列集合中随机抽取另一唯一子序列以作为新的第二唯一子序列，直到所述拼接序列符合所述预设原则为止。

4.如权利要求1所述的带有复合标签序列的探针的设计方法，其特征在于，步骤S3进一步包括步骤：将与所述标签序列中的所有的长度为n的子序列相同和互补的唯一子序列从所述唯一子序列集合中删除以使它们不再参与后续的抽取和拼接。

5.如权利要求1所述的带有复合标签序列的探针的设计方法，其特征在于，所述标签序列的生成方法进一步包括：

步骤S4：重复步骤S2至S3，直到将所述唯一子序列的集合用尽或者生成的所述标签序列的数量达到要求，以得到所述标签序列的集合。

6.如权利要求1所述的带有复合标签序列的探针的设计方法，其特征在于，在预设原则中，连续的相同碱基不超过3个，发夹结构长度不超过3个碱基，自互补片段不超过6个碱基。

7.权利要求1-6任一项所述的带有复合标签序列的探针的设计方法在制备生物芯片中的应用，所述生物芯片为基因芯片或蛋白质芯片。

8.采用权利要求1-6任一项所述的带有复合标签序列的探针的设计方法制备得到的带有复合标签序列的探针，其特征在于，所述复合标签序列选自如SEQ ID NO.1～SEQ IDNO.8中的任两项或两项以上所示的序列。