[发明专利]一组标志物组合及其在预测AML病患预后中的应用

说明书

本发明提供了一组标志物组合及其应用。所述标志物组合包括ERRFI1、EGFR、SDC2、PPP1R3C、PYGM和GPC3基因；优选地，所述标志物组合是EGFR、PYGM和GPC3的组合。所述标志物组合可以应用于预测白血病患者的预后；优选地，所述白血病是急性髓细胞白血病。

技术领域

本发明涉及生物技术领域，具体涉及一组标志物组合及其在预测AML病患预后中的应用。

背景技术

急性髓细胞性白血病(Acute myeloid leukemia，LAML，AML)，被定义为通过造血系统增殖，克隆，异常分化和偶尔分化差的治疗细胞渗透到骨髓，血液和其他组织中的一类癌症。AML是成人中最常见的急性白血病类型，约占病例的70％。超过四十年来，LAML的治疗标准并未发生显著变化，仍由阿糖胞苷加蒽环类药物作为基础药物的强化联合化疗组成。尽管大多数患者已实现缓解，但由于复发性疾病，高达70％的成年人和30％的儿童在最初临床治疗后的5年内将无法生存。这突显了对新治疗手段的迫切及其预后预测的需求，以使LAML患者能够持续康复。

众所周知，在实体瘤中，肿瘤细胞的过度增殖会导致严重的缺氧，这可能影响肿瘤进展。同样，在血液系统恶性肿瘤中，有人认为细胞的异常增殖和积累会导致骨髓微环境中的低氧环境。有研究表明，低氧条件可触发白血病细胞走向分化，分化伴随着缺氧诱导因子蛋白表达水平及与DNA结合活性的增高，这种现象不依赖LAML亚型而广泛存在。

目前，肿瘤缺氧的研究方法还很有限，且尚未在LAML中进行系统的缺氧基因的研究。这项研究首次使用了足量RNA-Seq分析数据来开发低氧风险模型，作为预测LAML组的预后生物标志物。这种方法可能会帮助临床医生做出重要的治疗决策。

在本研究中，我们下载了TCGA数据库中LAML的RNA-Seq数据和临床数据。通过GSEA(hallmark-hypoxia)获得200个缺氧基因。TCGA数据库中LAML的RNA-Seq数据7:3分为训练集和验证集，对训练集利用单因素、多因素Cox回归分析筛选预后缺氧基因，并构建缺氧风险模型，检测其对LAML预后价值。最后我们采用验证集数据对缺氧风险模型进行验证，进一步确定缺氧风险模型的有效性。联合临床病理特征的关系验证其独立预后价值。

发明内容

本发明提供了一组标志物组合及其应用。

标志物组合

一方面本发明提供了一种预测疾病预后的标志物组合，所述标志物组合包括ERRFI1、EGFR、SDC2、PPP1R3C、PYGM或GPC3基因。

优选地，所述标志物组合包括EGFR、PYGM和GPC3。

优选地，所述标志物组合是EGFR、PYGM和GPC3的组合。

优选地，所述EGFR是与人第7号染色体的第55,019,017～55,211,628位的序列有至少90％同源性的序列。

优选地，所述PYGM是与人第11号染色体的第64,746,389～64,760,715位的序列有至少90％同源性的序列。

优选地，所述GPC3是与人X染色体的第133,535,745～133,985,616位的序列有至少90％同源性的序列。

优选地，所述至少90％是指90％，91％，92％，93％，94％，95％，96％，97％，98％，99％和100％。

所述标志物组合中的EGFR的基因序列是人第7号染色体的第55,019,017-55,211,628位。

所述标志物组合中的PYGM的基因序列是人第11号染色体的第64,746,389-64,760,715位。