[发明专利]玉米糯性基因的KASP分子标记的开发方法及应用在审
申请号: | 202110703223.4 | 申请日: | 2021-06-24 |
公开(公告)号: | CN113528696A | 公开(公告)日: | 2021-10-22 |
发明(设计)人: | 徐扬;焦宇馨;李成;于广宁;周恺;杨文艳;王欣;杨泽峰;徐辰武 | 申请(专利权)人: | 扬州大学 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 上海怡恩专利代理事务所(普通合伙) 31336 | 代理人: | 牟俊玲 |
地址: | 225009 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 玉米 基因 kasp 分子 标记 开发 方法 应用 | ||
1.玉米糯性基因的KASP分子标记开发方法,其特征在于:包括检测待测玉米的基因型,根据待测玉米的基因型鉴定或辅助鉴定玉米糯性;所述待测玉米的基因型为玉米基因组中KASP_zmwx位点的基因型;所述KASP_zmwx位点是玉米基因组中的一个InDel位点,位于玉米9号染色体25128934-25128963位,为SEQ ID No.4的第51-80位核苷酸,其核苷酸种类为GCGTTGTTCAGTTCAGAGAAGGCAACCTTT(下文均用“+”表示)或缺失(下文均用“-”表示);
KASP_zmwx位点的基因型为++基因型或+-基因型,待测玉米的糯性低于或者候选低于KASP_zmwx位点的基因型为--基因型的待测玉米;KASP_zmwx位点的基因型为+-基因型的待测玉米与KASP_zmwx位点的基因型为++基因型的待测玉米在糯性上无显著差异;其中,++基因型表示玉米基因组中所述KASP_zmwx位点的核苷酸种类为+的纯合型;--基因型表示玉米基因组中KASP_zmwx位点的核苷酸种类为-的纯合型;+-基因型表示玉米基因组中KASP_zmwx位点的核苷酸种类为+和-的杂合型。
2.根据权利要求1所述的玉米糯性基因的KASP分子标记的开发方法而提出的应用,其特征在于,所述应用包括以下几个方面:
S1、KASP_zmwx位点的多态性或基因型的物质在鉴定或辅助鉴定玉米糯性中的应用;
S2、KASP_zmwx位点的多态性或基因型的物质在制备鉴定或辅助制备鉴定玉米糯性产品中的应用;
S3、KASP_zmwx位点的多态性或基因型的物质在玉米辅助育种或制备玉米辅助育种产品中的应用。
3.根据权利要求1所述的玉米糯性基因的KASP分子标记的开发方法而提出玉米育种的方法,其特征在于,包括以下步骤:
选择所述KASP_zmwx位点的基因型为--的玉米作为亲本进行育种,--基因型表示玉米基因组中KASP_zmwx位点的核苷酸种类为-的纯合型;玉米育种为培育高糯性玉米。
4.根据权利要求1所述的玉米糯性基因的KASP分子标记的开发方法而生产出的产品,其特征在于,主要包括以下几种产品:
s1、检测与玉米糯性相关的单核苷酸多态性或基因型的产品;
s2、鉴定或辅助鉴定玉米糯性的产品;
s3、用于玉米辅助育种的产品。
5.根据权利要求2任一一项所述玉米糯性基因的KASP分子标记的开发方法而提出的应用或权利要求7所述玉米糯性基因的KASP分子标记的开发方法而生产出的产品,其特征在于:检测权利要求1中KASP_zmwx位点的多态性或基因型的物质为如下D1)、D2)或D3):
D1)所述检测权利要求1中KASP_zmwx位点的多态性或基因型的物质含有扩增包括所述KASP_zmwx位点在内的玉米基因组DNA片段的PCR引物;
D2)所述检测权利要求1中KASP_zmwx位点的多态性或基因型的物质为含有所述PCR引物的PCR试剂;
D3)含有D1)所述PCR引物或D2)所述PCR试剂的试剂盒。
6.根据权利要求5所述的应用或产品,其特征在于:所述PCR引物为由核苷酸序列是序列表中SEQ ID No.1的第22-39位的单链DNA、核苷酸序列是序列表中SEQ ID No.2的第22-37位的单链DNA和核苷酸序列是序列表中SEQ ID No.3的单链DNA组成的引物组。
7.根据权利要求5或6任意一种所述的应用或产品,其特征在于:所述PCR引物为由序列表中SEQ ID No.1所示的单链DNA、序列表中SEQ ID No.2所示的单链DNA和由序列表中SEQID No.3所示的单链DNA的引物组。
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