[发明专利]一种DNA样品中不同长度DNA的条数分布的分析方法在审
申请号: | 202110720184.9 | 申请日: | 2021-06-28 |
公开(公告)号: | CN113539373A | 公开(公告)日: | 2021-10-22 |
发明(设计)人: | 吴淑一;陈泽宇;邱仁辉;林宇超;林盛涛;刘文地;朱阅;付腾飞;冯超;徐建刚 | 申请(专利权)人: | 福建农林大学 |
主分类号: | G16B40/00 | 分类号: | G16B40/00;G16B15/00 |
代理公司: | 厦门智慧呈睿知识产权代理事务所(普通合伙) 35222 | 代理人: | 杨唯 |
地址: | 350000 福*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 dna 样品 不同 长度 分布 分析 方法 | ||
1.一种DNA样品中不同长度DNA的条数分布的分析方法,其特征在于,包括:
将待测DNA样品与DNA标记物进行长度筛分,从DNA长度筛分结果中提取和拟合参数关系,根据提取和拟合的参数关系推导得出DNA样品中不同长度的DNA的条数分布情况;
所述DNA标记物是由几种不同长度的DNA片段混合组成,且各DNA片段的长度和总质量均已知。
2.根据权利要求1所述的一种DNA样品中不同长度DNA的条数分布的分析方法,其特征在于,长度筛分方法包括凝胶电泳、毛细管电泳及微流芯片筛分方法中的任意一种或多种。
3.根据权利要求2所述的一种DNA样品中不同长度DNA的条数分布的分析方法,其特征在于,所述凝胶电泳筛分方法包括:
向待检测DNA样品与DNA标记物中添加缓冲液;
将待检测DNA样品混合物、荧光染料及DNA标记物加载到琼脂糖凝胶中,用凝胶电泳装置进行长度筛分;
其中,荧光染料直接加入到琼脂糖凝胶中或添加到待检测DNA样品中后再将待检测DNA样品混合物加载到琼脂糖凝胶中。
4.根据权利要求3所述的一种DNA样品中不同长度DNA的条数分布的分析方法,其特征在于,所述缓冲液选用TAE、TBE、TPE电泳缓冲液中的一种或多种。
5.根据权利要求1或3所述的一种DNA样品中不同长度DNA的条数分布的分析方法,其特征在于,从DNA长度筛分结果中提取和拟合的参数关系包括:
DNA分子迁移位置MD和迁移位置处荧光强度FI|MD的关系:FI|MD=f1(MD);
迁移位置MD与该处DNA分子的长度FL之间的关系:MD=f2(FL);
给定迁移位置处的单位质量的DNA产生的荧光强度与该迁移位置处DNA片段长度FL之间的关系:
给定迁移位置处DNA的总碱基数Nbp|MD与该迁移位置处的荧光强度FI|MD之间的关系:
6.根据权利要求5所述的一种DNA样品中不同长度DNA的条数分布的分析方法,其特征在于,根据提取和拟合的参数关系进行推导可得出长度为FL的DNA分子的条数关系:
基于此得出DNA条数分布。
7.根据权利要求5所述的一种DNA样品中不同长度DNA的条数分布的分析方法,其特征在于,DNA分子迁移位置MD与迁移位置处荧光强度FI|MD之间的关系,通过分析处理软件对荧光强度条带图进行数据分析处理获得。
8.根据权利要求5所述的一种DNA样品中不同长度DNA的条数分布的分析方法,其特征在于,从已知DNA长度的DNA标记物的荧光强度条带图中提取几种已知长度的DNA条带处迁移位置MD和DNA分子长度FL之间的关系,进而通过拟合方法得到函数关系MD=f2(FL)。
9.根据权利要求5所述的一种DNA样品中不同长度DNA的条数分布的分析方法,其特征在于,给定迁移位置处的单位质量的DNA产生的荧光强度与该迁移位置处DNA片段长度FL之间的关系是从已知DNA片段的总质量的DNA标记物的荧光强度条带图中提取几种已知总质量的DNA条带处单位质量的DNA产生的荧光强度与该迁移位置处DNA片段长度FL之间的关系,进而通过拟合方法得到函数关系
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