[发明专利]基于sanger测序的SMA检测方法

权利要求书

1.基于sanger测序的SMA检测方法，其特征在于：包括如下步骤，

a、取待检测样本DNA，明确其SMN1基因第7号外显子第480号碱基染色体位；

b、获取待检测样本DNA的SMN1基因第480号碱基位置前后的核苷酸序列；

c、利用Primer Premier 5软件，针对步骤b中获得的核苷酸序列设计sanger引物组；

d、对待检测样本DNA进行PCR扩增；

e、对d的产物进行sanger测序，得到待检测样本DNA的SMN1基因第7号外显子第480号碱基C/T比值范围区间；

f、将步骤e中的测序结果进行比对，以确定待检测样本是否为SMA携带者。

２.根据权利要求1所述的基于sanger测序的SMA检测方法，其特征在于：步骤a中，对染色体位的明确通过查阅ClinVar数据库获知。

３.根据权利要求1所述的基于sanger测序的SMA检测方法，其特征在于：

步骤b中，通过UCSC数据库，获取的核苷酸序列为待检测样本SMN1基因第480号碱基位置前后500bp的核苷酸序列。

４.根据权利要求1所述的基于sanger测序的SMA检测方法，其特征在于：步骤c中，sanger引物组为

F(正向）：5’-TGTCTTGTGAAACAAAATGCTTT-3’

R(反向）：5’-TGCTGGTCTGCCTACTAGTGATA-3’。

５.根据权利要求1所述的基于sanger测序的SMA检测方法，其特征在于：

步骤e中，通过Bio-Trace-ABIF软件得到待检测样本的SMN1基因第7号外显子第480号碱基C/T比值范围区间。

６.根据权利要求1所述的基于sanger测序的SMA检测方法，其特征在于：

步骤f中，若第480号碱基显示T单峰，则待检测样本为exon7纯合缺失的SMA患者；若第480号碱基显示CT单峰，且C/T峰高比值为0.8-1.2时，待检测样本为正常人群；若第480号碱基显示CT单峰，且C/T峰高比值为0.1-0.6时，待检测样本为exon7杂合缺失的SMA患者。

７.根据权利要求1所述的基于sanger测序的SMA检测方法，其特征在于：还包括对检测结果进行验证，所述验证方法为MLPA验证。