[发明专利]肺癌预后的预测在审
申请号: | 202110726861.8 | 申请日: | 2021-06-29 |
公开(公告)号: | CN113430268A | 公开(公告)日: | 2021-09-24 |
发明(设计)人: | 杨承刚;李雨晨;王丹 | 申请(专利权)人: | 北京泱深生物信息技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;G01N33/574;G01N33/573;G16H50/20;G16B40/00 |
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地址: | 100176 北京市大兴区*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 肺癌 预后 预测 | ||
1.检测生物标志物的试剂在制备预测肺癌预后的产品中的应用,其特征在于,所述生物标志物包括CBFA2T3、DSG2、FAM83A、HDC和/或TCN1。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述生物标志物为CBFA2T3、DSG2、FAM83A、HDC和TCN1。
3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述试剂包括通过数字成像技术、蛋白免疫技术、染料技术、核酸测序技术、核酸杂交技术、色谱技术、质谱技术检测样本中生物标志物表达水平的试剂。
4.根据权利要求3所述的应用,其特征在于,所述试剂样本包括组织、体液。
5.一种预测肺癌预后的产品,其特征在于,所述产品包括检测生物标志物的试剂,所述生物标志物包括CBFA2T3、DSG2、FAM83A、HDC和/或TCN1;
优选地,所述产品包括芯片、试剂盒;
优选地,所述试剂盒包括qPCR试剂盒、免疫印迹检测试剂盒、免疫层析检测试剂盒、流式细胞分析试剂盒、免疫组化检测试剂盒、ELISA试剂盒和电化学发光检测试剂盒;
优选地,所述试剂盒还包括用于预测肺癌预后的说明书。
6.根据权利要求5所述的产品,其特征在于,所述试剂包括与所述生物标志物基因特异性结合的引物或探针;与所述标志物蛋白特异性结合的抗体、肽、适配体或化合物。
7.一种预测肺癌预后的系统/装置,其特征在于,包括:
获取单元,用于获取待测样本中生物标志物的数据,所述生物标志物包括CBFA2T3、DSG2、FAM83A、HDC和/或TCN1;
处理单元,用于将所述生物标志物的数据输入肺癌预后预测模型中,获得待测样本肺癌进展的预测结果;
优选地,所述预后预测模型为Cox回归模型;
优选地,所述Cox回归模型为LASSOCox回归模型;
优选地,所述预后预测模型的公式为风险评分=C1*ExpCBFA2T3+C2*ExpDSG2+C3*ExpFAM83A+C4*ExpHDC+C5*Exp TCN1;
优选地,所述C1、C2、C3、C4、C5分别为-0.1643、0.1341、0.121、-0.0618、0.0473。
8.一种计算机可读存储介质,其特征在于,其存储有程序,所述程序用于执行由生物标志物CBFA2T3、DSG2、FAM83A、HDC和/或TCN1构建的肺癌预后预测模型;
优选地,所述预后预测模型为Cox回归模型;
优选地,所述Cox回归模型为LASSOCox回归模型;
优选地,所述预后预测模型的公式为风险评分=C1*ExpCBFA2T3+C2*ExpDSG2+C3*ExpFAM83A+C4*ExpHDC+C5*ExpTCN1;
优选地,所述C1、C2、C3、C4、C5分别为-0.1643、0.1341、0.121、-0.0618、0.0473。
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