[发明专利]一种从胸部CT影像中自动提取支气管树的方法和系统在审
申请号: | 202110741053.9 | 申请日: | 2021-06-30 |
公开(公告)号: | CN113628219A | 公开(公告)日: | 2021-11-09 |
发明(设计)人: | 孙加源;唐祺;谢芳芳;宋亮 | 申请(专利权)人: | 上海市胸科医院 |
主分类号: | G06T7/11 | 分类号: | G06T7/11;G06T7/187;G06T17/00 |
代理公司: | 上海市汇业律师事务所 31325 | 代理人: | 王函;余艳 |
地址: | 200052 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 胸部 ct 影像 自动 提取 支气管 方法 系统 | ||
本发明公开了一种从胸部CT影像中自动提取支气管树的方法和系统。该方法为对胸部CT影像先进行肺分割,再进行主支气管分割和外周支气管分割,最后连接主支气管分割和外周支气管分割组成整体的支气管分割,得到支气管树;其中,进行主支气管分割包括:S21、主支气管种子点选取;S22、主支气管粗分割;S23、主支气管粗分割结果优化。本发明通过先整体后局部,先进行主支气管分割,再分割外周支气管,并将其和主支气管连接来提高从胸部CT影像中提取支气管树的精度,具有良好的应用前景。
技术领域
本发明属于医疗器械领域,特别涉及一种从胸部CT影像中自动提取支气管树的方法和系统。
背景技术
肺是人体重要的呼吸器官,位于胸腔,包括左肺和右肺,其中右肺有上、中、下三个肺叶,左肺有上、下两个肺叶,各肺叶由肺裂缝分隔。肺气道由环状软骨开始,经颈部和上纵隔在正中面下行,在胸腔分成两个主支气管。肺气道进入肺内部后逐级分支形成树状结构,由气管至肺泡可分23~25级,在肺泡完成血氧交换。目前胸部CT(Computed Tomography,计算机断层扫描)影像技术可显示直径1.5毫米量级的支气管。准确提取支气管树,为准确诊断和治疗支气管扩张、慢性肺阻塞、肺肿瘤等提供影像基础。
当前有大量胸部CT支气管分割算法的专利以及论文,国际定义会议的相关讨论也非常多。参考exact09(网址http://image.diku.dk/exact/),其罗列了支气管分割常用方法,并提供了类似金标准分割数据用于评估现有算法的准确性。从exact09对15种算法的结果对比可以发现,通常情况下分割的外周支气管树越多,泄露也会越多。这是由于外周支气管管径较小,气管壁比较薄,在CT扫描过程中,由于患者的呼吸,部分容积效应以及图像重建过程误差,导致管腔边缘的对比度降低,甚至在一些位置上仅依据CT密度无法区分管腔和管壁。
在这种情况下,如何提取更多外周支气管,同时尽可能减少泄露(非支气管部分),是所有支气管分割算法的关键。
发明内容
为了解决上面提到的至少一个技术问题,本发明公开了一种从胸部CT影像中自动提取支气管树的方法,对胸部CT影像先进行肺分割,再进行主支气管分割和外周支气管分割,最后连接主支气管分割和外周支气管分割组成整体的支气管分割,得到支气管树;
其中,进行主支气管分割包括:
S21、主支气管种子点选取;
S22、主支气管粗分割;
S23、主支气管粗分割结果优化;
步骤S21主支气管种子点选取具体为:遍历肺分割图像轴状位每层中心区域像素,选取坐标z最大的像素点作为初始点;若同时存在多个坐标z最大的像素点,任取其中一个像素作为初始点;运用快速行进算法(fast marching)求得每个像素点距离初始点的距离;从初始点所在层开始,沿着z减小方向,逐层进行2D连通域分析;直到找到某一层符合如下条件:
I.有多块连通区域;
II.求取每块连通区域到初始点的距离S;S通过遍历连通区域中的像素,将它们到初始点距离累加起来,然后除以连通区域像素数目获得;其中,最大距离Smax与最小距离Smin相差大于50mm;
取条件II中最小距离Smin对应的连通区域上的所有像素点作为主支气管种子点。
进一步地,进行肺分割包括:
S11、二维肺模板图像创建:提取N个胸部CT影像在矢状位上肺面积最大层影像,得到N个矢状位肺面积最大层影像;将N个矢状位肺面积最大层影像插值到固定图像大小,创建得到模板图像;统计模板图像上每个像素属于肺的概率,该概率通过公式1计算获得:
P=像素在N个胸部CT影像中属于肺的图像数量/N 公式1;
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