[发明专利]甲状腺结节良恶性相关标志物及其应用有效
申请号: | 202110748657.6 | 申请日: | 2021-07-01 |
公开(公告)号: | CN113186278B | 公开(公告)日: | 2021-10-12 |
发明(设计)人: | 苏明扬;杨世方;马建华;郗大勇;何其晔;刘蕊 | 申请(专利权)人: | 上海鹍远生物技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12Q1/6886;C12Q1/6851 |
代理公司: | 上海专利商标事务所有限公司 31100 | 代理人: | 韦东 |
地址: | 201318 上海市*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 甲状腺 结节 恶性 相关 标志 及其 应用 | ||
1.引物分子和/或探针分子在制备诊断个体甲状腺结节良恶性的检测试剂或诊断试剂盒中的应用,其特征在于:
所述引物分子相同于、互补于或在严谨条件下杂交于目标标志物并包含至少9个连续的核苷酸;
所述探针分子与目标标志物的扩增产物在严谨条件下杂交;
其中,所述目标标志物为下述(1)-(4)项所述的基因或序列:(1)TTC34基因或基因组的TTC34序列,(2)SLC16A3基因或基因组的SLC16A3序列,(3)RARG基因或基因组的RARG序列,以及(4)选自RCOR2基因或基因组的RCOR2序列和ITPKA基因或基因组的ITPKA序列中的任意一种或全部两种。
2.如权利要求1所述的应用,其特征在于,所述目标标志物的Hg19坐标如下:
TTC34基因,chr1:2572708-2717433;
RCOR2基因,chr11:63678702-63684636;
ITPKA基因,chr15:41786456-41795364;
SLC16A3基因,chr17:80193650-80197375;
RARG基因,chr12:53604350-53626040。
3.如权利要求1所述的应用,其特征在于,所述目标标志物为所述各基因采用以下引物扩增得到的一个或多个目标区域:
TTC34基因的目标区域:SEQ ID NO:1和2所示的序列作为引物扩增得到的TTC34基因的片段;
RCOR2基因的目标区域:SEQ ID NO:3和4所示的序列作为引物扩增得到的RCOR2基因的片段;
ITPKA基因的目标区域:SEQ ID NO:5和6所示的序列作为引物扩增得到的ITPKA基因的片段;
SLC16A3基因的目标区域:SEQ ID NO:7和8所示的序列作为引物扩增得到的SLC16A3基因的片段;
RARG基因的目标区域:SEQ ID NO:9和10所示的序列作为引物扩增得到的RARG基因的片段。
4.如权利要求3所述的应用,其特征在于,所述目标区域的Hg19坐标如下:
TTC34基因的目标区域,chr1: 2706494-2706702;
RCOR2基因的目标区域,chr11: 63687060-63687339;
ITPKA基因的目标区域,chr15: 41793298-41793573;
SLC16A3基因的目标区域,chr17: 80189548-80189879;
RARG基因的目标区域,chr12: 53613026-53613303。
5.如权利要求1所述的应用,其特征在于,
所述目标标志物的引物分子分别为:
TTC34:SEQ ID NO:1和2,或与其扩增得到的片段在严谨条件下杂交的引物分子;
RCOR2:SEQ ID NO:3和4,或与其扩增得到的片段在严谨条件下杂交的引物分子;
ITPKA:SEQ ID NO:5和6,或与其扩增得到的片段在严谨条件下杂交的引物分子;
SLC16A3:SEQ ID NO:7和8,或与其扩增得到的片段在严谨条件下杂交的引物分子;
RARG:SEQ ID NO:9和10,或与其扩增得到的片段在严谨条件下杂交的引物分子;
所述与目标标志物的扩增产物在严谨条件下杂交的探针分子分别为:
TTC34:SEQ ID NO:11或与其具有至少90%相同性的序列;
RCOR2:SEQ ID NO:12或与其具有至少90%相同性的序列;
ITPKA:SEQ ID NO:13或与其具有至少90%相同性的序列;
SLC16A3:SEQ ID NO:14或与其具有至少90%相同性的序列;
RARG:SEQ ID NO:15或与其具有至少90%相同性的序列。
6.如权利要求1所述的应用,其特征在于,所述检测试剂或诊断试剂盒还包括检测内参基因ACTB的引物分子和/或探针分子。
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