[发明专利]与西瓜果皮覆纹基因ClGS共分离的分子标记及应用

说明书

本发明公开了一对与西瓜深绿色带状果皮覆纹基因ClGS共分离的分子标记及应用，属于生物技术领域。本发明的分子标记可以直接用于西瓜果皮覆纹材料的分子标记辅助育种，提高育种的选择效率，加快育种进程，另外，利用该分子标记能够在出芽期或苗期即可准确快速的鉴定出西瓜植株的果皮覆纹性状，具有检测方便、扩增产物稳定的优点。

技术领域

本发明属于分子育种技术领域，具体涉及与西瓜果皮覆纹基因ClGS共分离的分子标记及应用。

背景技术

近年来，随着人民生活水平的日益提高，对于具有营养丰富、口感独特、外观多样的优质的园艺产品的需求也越来越高。而西瓜作为一种重要的园艺作物，其在世界园艺作物中具有非常重要的地位。中国作为世界上最大的西瓜生产国和消费国，其在乡村振兴和农业产业结构优化中具有重要作用。西瓜果实外观是果实外观品质的一个重要性状，在一定程度上直接影响了消费者的购买欲望。因此在育种过程中，果实外观性状作为一种重要的经济性状，一直是西瓜品质遗传改良的一个重要方向。但是关于西瓜果皮覆纹这一性状的研究非常薄弱。通过对西瓜果皮覆纹这一性状开展精细定位，开发出与西瓜果皮覆纹性状紧密连锁的分子标记，可以大大缩短相关育种进程。

相较于大田作物，园艺作物的果实外观具有丰富的多态性。目前对这些种质资源的利用已取得了很大成就。育种家相继培育出一大批独特外观品质的优质新品种，极大地满足了消费者多样化、个性化的需求。而果皮覆纹基因的挖掘和鉴定对优质园艺种质资源的利用具有极大的推动作用，也是近年来农业科学领域的重要研究内容之一。近年来，科研人员相继在苹果、梨、番茄等主要园艺作物中发现和鉴定了多个控制果皮覆纹形成的基因。

葫芦科作物作为重要的园艺作物，其果实表皮外观性状有较大的多样性。自上世纪以来，在不同物种中，多种不同覆纹类型的材料相继被发现，研究人员通过配置不同的杂交组合及一系列的等位性检测去阐释不同类型间的遗传关系。在南瓜中，Paris通过一系列的等位性检测，发现了存在多个等位基因控制南瓜的果皮覆纹性状，且其显隐性关系为：L-I(深绿色的纯色表型)l-I^Bst(宽覆纹表型)l-I^St(中等宽度覆纹表型)l-I^iSt(间歇性覆纹表型)l-I(浅绿色的纯色表型)。此外，据报道在甜瓜中也有多种基因参与了不同模式的甜瓜果皮覆纹的形成，如：st(果皮有条纹)，sp(果皮有斑点条纹)，Rn(果皮呈网纹状)等。黄瓜的果皮覆纹类型相对较少，主要有三种。即，H(成熟黄瓜果皮网纹)，U(未成熟黄瓜果皮呈斑驳)和ist(果皮出现不规则条纹)。然而，控制这些性状形成的分子基础及相关的调控网络尚不清楚。

目前已报到存在多个基因控制不同类型的西瓜果皮覆纹的形成，例如，G(果皮呈均一深绿色)，g^W(果皮呈较宽的覆纹)，g^M(果皮呈中度宽度覆纹)，g^N(果皮呈较窄的覆纹)，g(果皮呈均一浅绿色)，sp(果皮呈斑点状)，yb(深绿色果皮呈黄斑)，ins(果皮呈不连续的条纹)等。在西瓜中，大量的自然材料完成了重测序工作，在此基础上通过采用全基因组关联分析，在6号染色体的末端检测到了一个与西瓜果皮覆纹相关的信号。此外还有多项研究认为6号染色体的末端存在控制西瓜果皮覆纹形成相关的位点。然而，目前尚未有研究报道相关基因控制西瓜果皮覆纹的形成，其调控网络也尚属空白。随着分子生物学实验手段的丰富、测序技术的普及及大量重测序数据的公布，从分子层面揭开西瓜果皮覆纹形成的机理成为可能。

发明内容

本发明的目的之一在于提供一种与西瓜果皮覆纹基因ClGS共分离的分子标记。

本发明目的之二在于提供一种上述分子标记在西瓜分子育种的应用。

本发明的另一目的在于提供一种西瓜果皮覆纹品种的判定方法。

为实现上述目的，本发明提供如下技术方案：