[发明专利]一种用于人肿瘤分级的基因组合及其用途有效

专利信息
申请号: 202110762353.5 申请日: 2021-07-06
公开(公告)号: CN113355422B 公开(公告)日: 2022-11-22
发明(设计)人: 熊耕砚;何世明;何志嵩;周利群 申请(专利权)人: 北京大学第一医院
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886
代理公司: 北京三聚阳光知识产权代理有限公司 11250 代理人: 张均莹
地址: 100034 *** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 一种 用于 肿瘤 分级 基因 组合 及其 用途
【说明书】:

发明涉及肿瘤分级检测领域,具体涉及一种用于人肿瘤分级的基因组合及其用途,所述的用于人肿瘤分级的基因组合由基因集A和基因片段集B组成,所述用于人肿瘤分级的基因组合是从北京大学第一医院的实际肾癌病例的高通量测序数据中,通过特定的配对聚类分析得来,来源于真实的数据具有更高的可靠性和可信度,可以准确针对肾癌、泛癌进行恶性程度分级和预后预测。

技术领域

本发明涉及肿瘤分级检测领域,具体涉及一种用于人肿瘤分级的基因组合及其用途。

背景技术

肾癌是常见的泌尿系统恶性肿瘤。近年来,肾癌的发病率逐年升高,占成人恶性肿瘤的2%-3%,且每年以2.5%左右的速度上升。肾癌早期缺乏典型的临床表现,出现临床症状的肾癌往往已处于晚期,肾癌的治疗是以手术为基础的综合治疗,治疗中往往需要对肾癌组织进行恶性程度分级以协助医生判断疾病的进展和预后,同时制定进一步治疗方案,Fuhrman核分级是目前应用最广泛的肾癌恶性程度分级系统。

Fuhrman核分级系统于1982年被提出,通过Fuhrman分级系统对该肿瘤的恶性程度及危险度进行分级评价。依据Fuhrman分级标准,将肾癌分为G1(高分化),G2(中高分化),G3(中分化),G4(低分化或未分化)四个层级,随着层级的增高,肾癌的恶性程度就越高,疾病治疗后出现复发、转移的风险也随之升高。然而,Fuhrman分级系统是纯病理图像分型系统,存在如下缺陷:1、需要根据病理医生个人的经验进行判断,存在一定的主观性,不同病理医生之间差别巨大;2、G2级病理图像和G3级病理图像的区分度小,将两者分级难度大。以上的缺陷容易导致疾病的恶性程度分级不准确,对疾病进展和预后判断发生误差,影响疾病的诊疗。

随着二代测序技术的成熟和推广,利用基因检测来诊断疾病的方法受到了广泛的瞩目,如通过全外显子测序,检测标记物基因的突变及拷贝数变异情况,以此诊断肿瘤或判断肿瘤的进展。此方法克服了传统的肿瘤分级中存在的主观性影响和分级难度大的缺陷,对于肿瘤的早期诊断、治疗和预后有重大的意义。然而,现存基于二代测序技术且用于肾癌恶性程度分级的基因组合和方法,均缺乏外部验证,恶性程度分级不可靠,临床无法应用,因此,亟需找到一种基于特定基因检测的新型的肿瘤恶性程度及危险度分级系统。

发明内容

因此,本发明要解决的技术问题在于提供一种用于肾癌分级的基因组合及其用途,它能够对肾癌恶性程度进行分级并可用于肾癌患者的预后预测,为了实现这一目的,本发明使用全外显子测序技术,针对特殊筛选和分组的北京大学第一医院的肾癌患者数据进行筛选,最终得到本基因组合,用于肾癌的恶性程度分级和预后预测,为临床医生和患者提供了更为准确的肾癌恶性程度信息和疾病预测信息。

本发明提供了一种用于人肿瘤分级的基因组合,所述的基因组合由基因集A和基因片段集B组成;

所述的基因集A包括:ASAH1、ASXL1、BCOR、BRAF、CALML6、CCDC136、CIDEC、COX18、CSF1R、CYP3A5、DEK、DNMT3A、EGR1、FAM71E2、FGFR1、FKBP7、FLT1、FLT3、FLT4、GLIS1、IDH2、IFITM3、IMMT、KDR、KIT、KMT2A、KNOP1、KRT76、KRT9、KRTAP10-10、KRTAP10-8、MAF、MECOM、MFRP、MLLT3、MNS1、MRTFA、MTOR、MYH11、NF1、NUP214、PDGFRA、PDGFRB、PML、PRB2、PROSER3、RAF1、RARA、RBM15、RET、REXO1、RPN1、RUNX1T1、SCYL1、SLC16A6、SRC、STAG2、TCEAL5、TET2、TMEM82、TP53、TRIM26、U2AF1、U2AF2、UGT1A1、USP35、VEGFA、WBP2NL、WDR44、ZNF20、ZNF700和ZRSR2中至少一个;

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