[发明专利]一种与绵羊体高相关的分子标记及其应用

说明书

本发明提供了一种与绵羊体高相关的分子标记及其应用。本发明通过对湖羊CAP2基因进行PCR扩增和序列分析，发现在扩增片段的第309位存在一个T/C多态性位点，进一步使用KASPar引物对1346只绵羊的多态性位点进行检测和建立最小二乘模型，对基因型与体高进行关联分析，最终确定了本发明扩增的CAP2基因片段可以作为与绵羊体高相关的分子标记。本发明的分子标记可用于选留CC纯合的绵羊进入核心群，以提高绵羊的体高性状，有助于增加经济效益。

技术领域

本发明属于分子标记制备技术领域，具体涉及CAP2基因片段作为影响绵羊体高的分子标记及其应用。

背景技术

环化酶相关蛋白(CAP)是进化过程中高度保守的蛋白，由474-551个氨基酸残基组成，通过调节肌动蛋白细胞骨架在细胞极性和发育中起重要作用(Kosmas et al.,2015)。在哺乳动物中，CAP1和CAP2是CAP的两个同源物(Matviw,Yu,Young,1992；Swiston,Hubberstey,Yu,Young,1995；Yu,Swiston,Young,1994)。CAP1在胞吞作用和细胞运动中起作用(Bertling et al.,2004),并存在于应力纤维和富肌动蛋白区域(Peche et al.,2007)。CAP1和CAP2之间的相似性约为76％，敲除小鼠的CAP2基因会导致体重下降和生存率下降(Kosmas et al.,2015)。此外，在缺乏CAP2的肌原纤维中，钙调节性发展的协同性降低(Kosmas et al.,2015)。

绵羊是我国著名的多产品种，四级发情，生长快，性成熟早，产仔数高，平均产仔数2.06(X.Feng et al.,2018)。绵羊主要分布在中国的江苏、浙江和上海。错义突变发生在编码区，导致翻译缺陷蛋白，并与许多疾病有关(Lee et al.,2008)。同义突变在非编码区域并不产生改变的蛋白质，而是改变DNA和RNA序列，有被视为沉默突变，因此很容易被忽略(Sharma et al.)。然而，同义突变可以改变mRNA的稳定性、剪接调节位点、miRNA结合位点或翻译效率，从而导致蛋白质水平或蛋白质构象的改变(SaunaKimchi-Sarfaty,2011)。本发明通过对CAP2基因进行测序和分析，探讨其不同基因型与绵羊体高之间的关联，旨在为提高绵羊体高的遗传改良方面提供基因素材，加速我国自主知识产权的快速生长型优质肉羊新品种的培育进程。

发明内容

本发明的目的在于克服现有技术的缺陷，提供一种作为与绵羊体高相关的分子标记及其应用。

本发明的分子标记从绵羊CAP2基因中扩增得到，其具体核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。通过扩增绵羊CAP2基因的DNA序列并测序，寻找CAP2基因的多态性位点，从而可以建立绵羊体高相关分子标记的检测方法，并可将该分子标记应用于快速生长型优质肉羊新品种的培育中。

具体地，本发明的技术方案如下所述：

一方面，本发明提供了一种与绵羊体高相关的分子标记，该分子标记通过对绵羊CAP2基因进行扩增而获得，具体的，该分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，即