[发明专利]一种检测斑马鱼Acsl1a基因突变的方法在审
申请号: | 202110774837.1 | 申请日: | 2021-07-08 |
公开(公告)号: | CN113416787A | 公开(公告)日: | 2021-09-21 |
发明(设计)人: | 刘思嘉;牛依萌;田菲;田得红;王贺崐元;赵凯 | 申请(专利权)人: | 中国科学院西北高原生物研究所 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6858 |
代理公司: | 成都高远知识产权代理事务所(普通合伙) 51222 | 代理人: | 张娟;肖柯岑 |
地址: | 810000 *** | 国省代码: | 青海;63 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 斑马 acsl1a 基因突变 方法 | ||
1.一种检测斑马鱼Acsl1a基因突变的方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)提取斑马鱼基因组DNA;
(2)利用引物P1和引物P2对步骤(1)提取的DNA进行PCR扩增;所述引物P1为:5’-accgtggatggcttaagggtt-3’,引物P2为:5’-gtgtcttgtggtttgctttgcca-3’;
(3)利用Hpy188I内切酶对步骤(2)的PCR扩增产物进行酶切;
(4)对步骤(3)的酶切产物进行琼脂糖凝胶电泳,分析酶切条带。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述检测Acsl1a基因突变是检测Acsl1a第7外显子TCTGA基因序列是否缺失;步骤(4)所述酶切条带包含大小为471bp的条带,则存在Acsl1a基因突变。
3.如权利要求1或2所述的方法,其特征在于,步骤(1)所述提取方法为酚-氯仿抽提法、高盐沉淀法、离心柱法、磁珠法;优选为酚-氯仿抽提法。
4.如权利要求3所述的方法,其特征在于,所述酚-氯仿抽提法包括如下步骤:将斑马鱼的尾鳍组织进行组织裂解和蛋白酶消化后,加入Tris平衡酚和氯仿混匀,离心,上清液加入异丙醇混匀后-20℃静置,离心弃液后风干。
5.如权利要求1或2所述的方法,其特征在于,步骤(2)所述PCR扩增体系为:灭菌的去离子水26.5μL;Buffer 3.5μL,dNTP 3.0μL,引物P1和引物P2各0.5μL,DNA 1μL,rTaq 0.1μL。
6.如权利要求1或2所述的方法,其特征在于,所述PCR扩增参数为:预变性94℃,5min,1循环;变性94℃,30s,退火61℃,30s,延伸72℃,60s,35循环;72℃,10min,1循环。
7.如权利要求1或2所述的方法,其特征在于,步骤(3)所述酶切反应体系为:Hpy188I10μL,PCR产物1μL,CutSmart Buffer 5μL,加灭菌去离子水至50μL。
8.如权利要求1或2所述的方法,其特征在于,步骤(3)所述酶切的参数为:35~40℃孵育4~6h,60~70℃灭活10~30min。
9.如权利要求8所述的方法,其特征在于,所述酶切参数为:37℃孵育5h,65℃灭活20min。
10.权利要求1~9任一项所述的方法鉴别斑马鱼Acsl1a基因突变体的应用。
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