[发明专利]一种控制大豆叶色相关基因紧密连锁标记与应用

说明书

本发明公开了一种控制大豆叶色相关基因紧密连锁标记与应用。属于育种和分子遗传学技术领域。核苷酸序列为SEQ ID NO.1所示。与控制大豆叶色相关基因紧密连锁分子标记H745‑5位于11号染色体。本发明利用EMS诱变ZP661筛选获得的大豆黄化突变体H745为材料，通过叶绿素含量测定及叶绿体超微结构观察进行表型鉴定，利用ZP661×H745(F₂)分离群体中的黄、绿个体构池进行BSA‑seq测序，并结合分离群体进行连锁分析确认区间；针对候选基因的变异位点开发dCAPS标记H745‑5，利用开发的dCAPS标记鉴定ZP661×H745(F2)群体获得基因型数据，鉴定了标记的准确性及可靠性。

技术领域

本发明涉及育种和分子遗传学技术领域，更具体的说是涉及一种控制大豆叶色相关基因紧密连锁标记与应用。

背景技术

大豆是全世界最重要的经济作物之一，为人类提供丰富的植物蛋白和脂肪。大豆全基因组测序完成将会促进了大豆学科功能基因组学的快速发展。

然而，复杂的基因组结构、低效率的遗传转化系统等诸多因素则限制了大豆功能基因组学研究的发展。突变体是重要基因挖掘及功能研究的重要材料。由于低效率的遗传转化系统及基因型依赖性阻碍了基于转基因平台的T-DNA插入及转座子诱变技术在大豆突变体的筛选中的应用，使人工诱变筛选突变体已成为大豆获得丰富基因组变异、开展基因功能研究的重要途径；理化诱变具有操作简单、可以产生丰富的遗传变异及不依赖遗传转化技术等特点，随着TILLING等高通量变异检测技术的出现与完善，大豆突变体在大豆基因组学研究及育种应用等方面利用日益广泛。

叶片是绿色植物进行光合作用的主要器官，黄化常引起植株生长瘦弱矮小，产量降低，严重者会致植株死亡；因此大豆叶色突变体是进行叶绿素生物合成、叶绿体发育以及光合作用调控相关基因功能研究的重要材料，而且对研究大豆光合作用、提高大豆光合效率和促进大豆的生产具有重要意义，同时在生产中杂交种真伪性鉴定过程也很重要。叶绿素生物合成或其他相关代谢途径的突变会导致叶绿素缺陷型突变体有助于我们解析叶绿素生物合成、光系统和叶绿体发育。

因此，提供一种控制大豆叶色相关基因紧密连锁标记是本领域技术人员亟需解决的问题。

发明内容

有鉴于此，本发明提供了一种控制大豆叶色相关基因紧密连锁标记与应用。

为了实现上述目的，本发明采用如下技术方案：

一种控制大豆叶色相关基因紧密连锁标记，为位于11号染色体的H745-5；所述H745-5核苷酸序列为SEQ ID NO.1所示。

本发明还提供了一种控制大豆叶色相关基因紧密连锁标记在鉴定大豆植株黄化中的应用，若所述核苷酸序列SEQ ID NO.1第179bp由G突变为A，则从苗期起即显现叶片黄化表型，盛花期植株株高较野生型植株矮小、叶片小，茎秆细；叶绿素含量测定植株上中下部叶片叶绿素含量均显著低于野生型；叶绿体超微结构与野生型相比，叶绿体基粒堆叠显著降低。

本发明还提供了一种控制大豆叶色相关基因紧密连锁标记的扩增引物对，其特征在于：所述H745-5的PCR扩增上游引物序列为5’-ATCTGGCGA GGGAGATTCTG-3’，如SEQ IDNO.2所示；所述H745-5的PCR扩增下游引物序列为5’-ACTCGTTGGCACCACCGTCCAT-3’，如SEQID NO.3所示。

本发明还提供了上述连锁标记或上述的引物对在大豆育种中的应用。

本发明还提供了上述的引物对在制备控制大豆叶色相关基因检测试剂盒中的应用。