[发明专利]PRUNE1基因检测在多发性骨髓瘤患者预后中的应用有效

专利信息
申请号: 202110794277.6 申请日: 2021-07-14
公开(公告)号: CN113512589B 公开(公告)日: 2023-03-10
发明(设计)人: 刘澎;徐佳岱;王亚文 申请(专利权)人: 复旦大学附属中山医院
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886
代理公司: 上海申汇专利代理有限公司 31001 代理人: 翁若莹
地址: 200032 *** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: prune1 基因 检测 多发性 骨髓瘤 患者 预后 中的 应用
【说明书】:

发明涉及一种PRUNE1基因检测在多发性骨髓瘤患者预后中的应用,属于生物医药技术领域。本发明提供一种检测PRUNE1基因拷贝数在伴有1q21扩增的多发性骨髓瘤患者预后中的应用,通过检测PRUNE1的拷贝数,预测患者的预后。通过对PRUNE1基因拷贝数分析,将伴有1q21gain(CKS1B gain)的MM患者的生存预后更好地分层,协助临床医生更好地判断患者的预后,以便制定更精细化的临床诊疗策略。

技术领域

本发明涉及一种PRUNE1基因检测在多发性骨髓瘤患者预后中的应用,属于生物医药技术领域。

背景技术

多发性骨髓瘤(Multiple myeloma,MM)是一种因骨髓中克隆性浆细胞或浆母细胞异常增殖并分泌大量无效单克隆抗体所致的血液系统恶性肿瘤。MM的异质性很强,这种疾病目前被认为是无法治愈的。染色体1q21拷贝数扩增(1q21Gain)是MM中最常见的细胞遗传学异常之一,尤其是在非白色人种患者群体中。据文献报道,约30-50%的初诊MM患者可检测出1q21 Gain,在复发难治MM患者中其阳性率甚至可达到70%。但是,虽然具有如此高的阳性率,1q21 Gain在MM中的预后价值地位始终存在争议,直至今日尚无定论。所以,本技术领域亟需一种对MM患者预后进行判断的方法。

发明内容

本发明的目的是为解决如何对伴有1q21 Gain的MM患者进行预后分层的技术问题。

为达到解决上述问题的目的,本发明所采取的技术方案是提供一种检测PRUNE1基因拷贝数在伴有1q21 Gain的MM患者预后中的应用,通过检测PRUNE1的拷贝数,预测患者的预后。

优选地,所述检测PRUNE1的拷贝数,是在伴有1q21 Gain的MM患者的CD138+浆细胞中进行检测。

本发明提供一种检测PRUNE1基因拷贝数在伴有1q21 Gain的MM患者预后中的应用具体应用在制备预测MM患者预后的检测试剂盒或基因探针中的应用。

相比现有技术,本发明具有如下有益效果:

本发明提供的一种检测PRUNE1基因拷贝数在伴有1q21扩增的MM患者预后中的应用,通过对PRUNE1基因拷贝数分析,可进一步将伴有1q21 gain(CKS1Bgain)的MM患者的生存预后更好地分层,协助临床医生更好地判断患者的预后,以便制定更精细化的临床诊疗策略。

附图说明

图1为单因素生存分析联合Lasso回归分析图;明确染色体1q21上的编码基因RNA表达值对伴有1q21 Gain的MM患者生存的预后意义。

将处于染色体1q21上的215个编码基因RNA表达值结合MMRF CoMMpass中伴有1q21gain患者的生存数据(总体生存期,Overall Survival,OS和无疾病进展期,ProgressionFree Survival,PFS)进行单因素生存分析后,将具有统计学意义的基因进一步进行Lasso回归分析;其中A图为13个基因对OS有显著统计学意义,B图为5个基因对PFS有显著统计学意义。(RNA表达值作为输入自变量,患者的生存值作为目标因变量。左图为交叉验证,右图为线性回归,每一条曲线代表了每一个自变量系数的变化轨迹,纵坐标是系数的值,下横坐标是log(λ),上横坐标是此时模型中非零系数的个数。)

图2为RNA表达值和DNA拷贝数之间的相关性分析图。将经过多因素Cox回归分析后挑选出的4个基因的RNA表达值与同一患者的该基因DNA拷贝数(CN,Copy number)进行Pearson相关性分析图。每个方框中的数字代表相关性系数,带有背景色的方框代表RNA表达值与同一患者的该基因DNA拷贝数有显著统计学相关性(p0.05),颜色越深p值越小。

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