[发明专利]EGFR基因突变检测试剂盒及其检测方法在审
申请号: | 202110807790.4 | 申请日: | 2021-07-16 |
公开(公告)号: | CN113881759A | 公开(公告)日: | 2022-01-04 |
发明(设计)人: | 蒋析文;黄志文;朱小亚;许旭平;张丹梦 | 申请(专利权)人: | 广州达安基因股份有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6858 | 分类号: | C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 深圳市世联合知识产权代理有限公司 44385 | 代理人: | 姜妍 |
地址: | 510000 广东省广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | egfr 基因突变 检测 试剂盒 及其 方法 | ||
1.一种EGFR基因突变检测试剂盒,其特征在于,包括:
用于检测EGFR基因突变位点所需的EGFR特异性引物、EGFR基因突变位点探针;内控基因引物和内控基因探针;
所述EGFR特异性引物,用于扩增待测血浆样本中的目标区域以得到第一扩增产物;
所述EGFR基因突变位点探针,用于在所述第一扩增产物生成过程中进行水解反应,释放第一荧光信号;
所述EGFR特异性引物及所述EGFR基因突变位点探针分别对所述EGFR基因突变位点类型进行检测;
所述内控基因引物,用于扩增所述待测血浆样本中的管家基因以得到第二扩增产物;
所述内控基因探针,用于在所述第二扩增产物生成过程中进行水解反应,释放第二荧光信号。
2.根据权利要求1所述的EGFR基因突变检测试剂盒,其特征在于,所述EGFR特异性引物包括:
EGFR基因19Del位点引物,用于与所述目标区域的19Del突变位点相结合;
EGFR基因T790M位点引物,用于与所述目标区域的T790M突变位点相结合;
EGFR基因L858R位点引物,用于与所述目标区域的L858R突变位点相结合。
3.根据权利要求2所述的EGFR基因突变检测试剂盒,其特征在于,所述EGFR基因19Del位点引物包括第一上游引物、第一下游引物和第一封闭引物;其中,第一上游引物对应的核苷酸序列包括SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5、SEQID NO:6,第一下游引物对应的核苷酸序列包括SEQ ID NO:7,第一封闭引物对应的核苷酸序列包括SEQ ID NO:18;
所述EGFR基因T790M位点引物包括第二上游引物、第二下游引物和第二封闭引物;其中,第二上游引物对应的核苷酸序列包括SEQ ID NO:8,第二下游引物对应的核苷酸序列包括SEQ ID NO:9,第二封闭引物对应的核苷酸序列包括SEQ ID NO:19;及
所述EGFR基因L858R位点引物包括第三上游引物、第三下游引物和第三封闭引物;其中,第三上游引物对应的核苷酸序列包括SEQ ID NO:10,第三下游引物对应的核苷酸序列包括SEQ ID NO:11,第三封闭引物对应的核苷酸序列包括SEQ ID NO:20。
4.根据权利要求3所述的EGFR基因突变检测试剂盒,其特征在于,所述SEQ ID NO:18、所述SEQ ID NO:19和所述SEQ ID NO:20对应的核苷酸序列的3’端分别标记有ZNA修饰。
5.根据权利要求1所述的EGFR基因突变检测试剂盒,其特征在于,所述EGFR基因突变位点探针包括:
EGFR基因19Del位点探针、EGFR基因T790M位点探针以及EGFR基因L858R位点探针。
6.根据权利要求5所述的EGFR基因突变检测试剂盒,其特征在于,所述EGFR基因19Del位点探针对应的核苷酸序列包括SEQ ID NO:14;所述EGFR基因T790M位点探针对应的核苷酸序列包括SEQ ID NO:15;所述EGFR基因L858R位点探针对应的核苷酸序列包括SEQ IDNO:16;其中,所述SEQ ID NO:14、所述SEQ ID NO:15和所述SEQ ID NO:16分别对应的核苷酸序列的5’端标记有FAM、3’端标记有Eclipse以及3’端的ZNA修饰。
7.根据权利要求1所述的EGFR基因突变检测试剂盒,其特征在于,
所述内控基因引物包括内控上游引物和内控下游引物,其中,所述内控上游引物对应的核苷酸序列包括SEQ ID NO:12,所述内控下游引物对应的核苷酸序列包括SEQ ID NO:13;
所述内控基因探针对应的核苷酸序列包括SEQ ID NO:17,其中,所述SEQ ID NO:17对应的核苷酸序列的5’端标记有CY5、3’端标记有Eclipse以及3’端的ZNA修饰。
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