[发明专利]预测IPF患者预后的8基因模型及应用

说明书

本发明涉及一种预测IPF患者预后的8基因模型，基于血液标本的基因芯片测序数据集，由基因DSC2,FAIM3,FAM102A,PF4,RGS18,S100A12,SERPINB10和TXK构建了一个与炎症和免疫反应相关的8基因模型即DFPRS评分，用于预测特发性肺纤维化患者的预后，DFPRS评分可以很好地显示IPF患者的免疫与炎症情况，早期识别IPF预后差的患者，早发现，早治疗，减少IPF患者的死亡率，减少医疗负担。

技术领域

本发明涉及医学诊断技术技术领域，具体地说是一种预测IPF患者预后的8基因模型及应用。

背景技术

特发性肺纤维化(Idiopathic pulmonary fibrosis,IPF)是一种反复急性肺损伤的复杂疾病，可导致呼吸困难加重，肺功能恶化。在美国，18-64岁人群中IPF的发病率为每年6.1/100,000。IPF患者预后较差，多在诊断后2-3年内死亡，5年生存率仅为20％。在过去的几十年里，基因和基因组技术的快速发展已经开始重塑我们对IPF的理解。因此，探讨与IPF患者预后相关的基因相关模型非常重要。越来越多的证据表明先天免疫和适应性免疫过程可以协调现有的纤维化反应，并与IPF患者的预后相关。然而，在血液中，与炎症和免疫反应相关的基因模型还没有被构建，并且这些基因模型未给出明确的参照值，对患者死亡风险进行有效划分。

发明内容

针对上述现有技术里，在血液中，与炎症和免疫反应相关的基因模型还没有被构建，并且这些基因模型未给出明确的参照值，对患者死亡风险进行有效划分等问题，本发明提供一种预测IPF患者预后的8基因模型及应用。

为解决上述技术问题，本发明采用的技术方案为：

一种预测IPF患者预后的8基因模型，所述8基因如下：DSC2,FAIM3,FAM102A,PF4,RGS18,S100A12,SERPINB10和TXK。

所述基因模型评分的计算公式如下：-(0.033982856*expression level ofDSC2-0.355507146*expression level of FAIM3-0.453477467*expression level ofFAM102A-0.219619383*expression level of PF4-0.506204609*expression level ofRGS18+0.350261192*expression level of S100A12+0.090300010*expression level ofSERPINB10-0.032171202*expression level of TXK)。

所研究对象采集的外周血单核细胞，使用基因芯片进行高通量测序，测序结果使用R语言进行处理，表达值进行log2转换。

所述基因芯片为AFFY基因芯片。

用于预测特发性肺纤维化患者的预后。

预测IPF患者预后的8基因模型的应用，包括以下过程：

1)IPF患者入院；

2)对血中单核细胞使用基因芯片进行高通量分析；

3)利用8基因模型进行评分；

4)根据截断值，即8.328对患者死亡风险进行划分；

5)高危患者特殊关注并给予更进一步的治疗。

利用8基因模型评分与8.328进行比较，低于8.328患者的免疫功能低，炎性反应增加，死亡风险大。

一种基因模型用于制备预测IPF患者预后的试剂盒中的应用。