[发明专利]基于甲基化免疫沉淀高通量测序技术的肺癌检测方法在审
申请号: | 202110815235.6 | 申请日: | 2021-07-19 |
公开(公告)号: | CN113584168A | 公开(公告)日: | 2021-11-02 |
发明(设计)人: | 胡新蕾;钟晟;严晓芹;闫子玥 | 申请(专利权)人: | 深圳泰莱生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6869;C12Q1/6806;C12N15/10;G01N33/539 |
代理公司: | 深圳市优赛朝闻专利代理事务所(普通合伙) 44454 | 代理人: | 谭育华 |
地址: | 518000 广东省深圳市罗湖*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 甲基化 免疫 沉淀 通量 技术 肺癌 检测 方法 | ||
1.基于甲基化免疫沉淀高通量测序技术的肺癌检测方法,其特征在于,方法步骤如下:
步骤1:提取血浆游离DNA(cfDNA);
步骤2:将cfDNA片段进行末端修复并补齐;
步骤3:将末端补齐的DNA与测序接头进行连接,得到连接产物;
步骤4:加入与DNA文库中游离DNA片段长度相似的未甲基化片段和具有不同程度甲基化片段,确保抗体与原始游离DNA比例恒定;
步骤5:加入标准的甲基化样本和非甲基化样本;
步骤6:热处理,使双链DNA解链,由于DNA甲基化发生在胞嘧啶5位碳原子上,通过加入5-羟甲基胞嘧啶抗体特异性结合甲基化的胞嘧啶,富集高甲基化的DNA片段;
步骤7:加入磁珠靶向捕获甲基化的DNA片段;
步骤8:使用甲基化纯化磁珠,多次洗涤去除未结合DNA片段;
步骤9:对这些通过免疫沉淀获得的甲基化片段进行PCR扩增,制备测序文库;在制备测序文库过程中包含多个纯化步骤,选择使用磁珠法进行纯化;
步骤10:对测序文库进行质量检查;
步骤11:将含有不同barcode的文库按相同摩尔浓度混匀,根据二代测序仪器使用标准方法进行上机测序,获得测序结果;
步骤12:5mC生物标志物的选择和模型构建;
步骤13:数据分析。
2.根据权利要求1所述的基于甲基化免疫沉淀高通量测序技术的肺癌检测方法,其特征在于,在步骤2中,首先将提取的cfDNA进行片段长度检测;再将筛选的cfDNA进行末端修复并补齐。
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