[发明专利]巯嘌呤用药检测方法

说明书

巯嘌呤用药检测方法，该方法可作为巯嘌呤用药指导，对使用巯嘌呤类药物的患者进行筛选，进而降低巯嘌呤类药物用药风险，提高治疗效果、降低复发率；也可以避免不必要的治疗和费用支出，更为患者争取了宝贵的治疗时间。巯嘌呤用药检测方法：一、抽提服用巯嘌呤类药物患者的白血病样本基因组DNA进行全基因组测序；二、分析全基因组测序数据，得到SNV信息和indels信息；三、判断患者是否存在Thio‑dMMR突变印记，若患者存在Thio‑dMMR突变印记，则须停止并不得采用巯嘌呤类药物治疗。

技术领域

本发明涉及一种用药检测方法。

背景技术

化疗是治疗儿童急性淋巴白血病(acute lymphoblastic leukemia，ALL)的标准方案，但治疗后肿瘤常会耐药复发。尽管现在五年生存率接近90％，但是20％左右病例仍会复发，且复发后治愈率仅20％～50％。耐药复发是造成儿童ALL治疗失败和患者死亡的重要原因。

巯嘌呤(Mercaptopurine，6-MP)属于抑制嘌呤合成途径的细胞周期特异性药物，化学结构与次黄嘌呤相似，因而能竞争性地抑制次黄嘌呤的转变过程。本品进入体内，在细胞内必须由磷酸核苷糖转移酶转变为6-巯基嘌呤核糖核苷酸后，方具有活性。适用于绒毛膜上皮癌、恶性葡萄胎、急性淋巴细胞白血病及急性非淋巴细胞白血病、慢性粒细胞性白血病的急变期；是ALL临床常用化疗药物。

ALL的不良反应有：1.较常见的为骨髓抑制，可有白细胞及血小板减少。2.肝脏损害：可致胆汁淤积出现黄疸。3.消化系统：恶心、呕吐、食欲减退、腹泻和口腔炎，但较少发生，可见于服药量过大的患者。4.高尿酸血症：多见于白血病治疗初期，严重的可发生尿酸性肾病。5.间质性肺炎及肺纤维化少见。不仅如此，临床使用过程中还发现患者的巯嘌呤治疗效果和复发率波动异常，部分采用巯嘌呤治疗的患者治疗效果差且复发率高，而其他患者的情况则恰恰相反。

发明内容

本发明提供了一种巯嘌呤用药检测方法，该方法可作为巯嘌呤用药指导，对使用巯嘌呤类药物的患者进行筛选，进而降低巯嘌呤类药物用药风险，提高治疗效果、降低复发率；也可以避免不必要的治疗和费用支出，更为患者争取了宝贵的治疗时间。

本发明巯嘌呤用药检测方法按以下步骤进行：

一、抽提服用巯嘌呤类药物患者的白血病样本基因组DNA进行全基因组测序；

二、分析全基因组测序数据，得到SNV(单核苷酸变异)信息和indels(插入或缺失)信息；

三、判断患者是否存在Thio-dMMR突变印记，

若不存在Thio-dMMR突变印记则患者可以继续使用巯嘌呤治疗，

若患者存在Thio-dMMR突变印记，则须停止并不得采用巯嘌呤类药物治疗；

其中，所述Thio-dMMR突变印记位于CpG双核苷酸位点，且NCG三核苷酸中心处C位点发生G:CA:T变异(以下简称为CT变异)。

本发明测定为停止并不得采用巯嘌呤类药物治疗的患者，若继续使用巯嘌呤类药物进行治疗，不仅白血病复发率高，而且在复发后采用长春新碱、柔红霉素和阿糖胞苷等其他药物治疗的效果依然不理想。

具体实施方式

下面结合实例对本发明作进一步的详细说明。以下实例旨在说明本发明，并不限制本发明的范围。

下述实施例中所使用的实验方法如无特殊说明均为常规方法。所用材料、试剂、方法和仪器，未经特殊说明，均为本领域常规材料、试剂、方法和仪器，本领域技术人员均可通过商业渠道获得。

具体实施方式一：本实施方式嘌呤用药检测方法按以下步骤进行：

一、抽提服用巯嘌呤类药物患者的白血病样本基因组DNA进行全基因组测序；