[发明专利]一种基于CT的整条脊柱的分割方法、系统在审
申请号: | 202110831278.3 | 申请日: | 2021-07-22 |
公开(公告)号: | CN113487591A | 公开(公告)日: | 2021-10-08 |
发明(设计)人: | 肖建如;孟子尧;盛斌;吕天予;矫健;周振华;马科威;刘铁龙 | 申请(专利权)人: | 上海嘉奥信息科技发展有限公司 |
主分类号: | G06T7/00 | 分类号: | G06T7/00;G06T7/136;G06T7/194;G06N3/04;G06N3/08 |
代理公司: | 上海段和段律师事务所 31334 | 代理人: | 李佳俊;郭国中 |
地址: | 201304 上海市浦东*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 ct 脊柱 分割 方法 系统 | ||
本发明提供了一种基于CT的整条脊柱的分割方法,包括如下步骤:步骤1:获取3D脊柱图像,对3D脊柱进行脊柱和背景分割,得到脊柱部分3D图像;步骤2:对脊柱部分3D图像进行基于切片U‑net的脊柱分割。本发明提供的一种基于CT的整条脊柱的分割方法、系统提出使用切片U‑net用于脊柱CT分割与脊柱识别,缓解数据集不足的问题,降低模型复杂度。
技术领域
本发明涉及整条脊柱分割的技术领域,具体地,涉及一种基于CT的整条脊柱的分割方法、系统。
背景技术
脊柱也被称为脊椎,是形成人体上部中心负重轴的骨骼结构。脊柱图像有着多种医学影像学模式,其中X光片、CT、MRI和PET等多种图像被用于评估脊柱解剖和诊断脊柱病理。其中,CT是当代使用最广泛的扫描技术,是评估椎骨的三维形态的空间上最精确的方式。脊柱分割是大多数后续脊柱图像分析和建模任务的基本步骤。
针对上述中的相关技术,发明人认为存在有数据集不足而导致增加模型的复杂度的问题,因此,需要提出一种技术方案以改善上述技术问题。
发明内容
针对现有技术中的缺陷,本发明的目的是提供一种基于CT的整条脊柱的分割方法、系统。
根据本发明提供的一种基于CT的整条脊柱的分割方法,包括如下步骤:
步骤1:获取3D脊柱图像,对3D脊柱进行脊柱和背景分割,得到脊柱部分3D图像;
步骤2:对脊柱部分3D图像进行基于切片U-net的脊柱分割。
优选地,所述步骤1包括:
步骤1.1:设置灰度化阈值,使用SLIC算法在横向面切片上进行脊柱的分类;
步骤1.2:使用Felzenszwalb算法在矢状面切片上进行实验。
优选地,所述步骤1.1绘制训练集中脊柱图像的灰度直方图,将阈值设置为77-140;将分割大小限制在400*260*260的立方体中,并舍弃CT扫描的左侧部分;使用腐蚀膨胀操作,进行脊柱分割效果的评估。
优选地,所述步骤1.2使用灰度化阈值方法去判断分割区域是否属于脊柱;设置阈值为72和150。
优选地,所述步骤2包括:
步骤2.1:对3D脊柱图像进行切片;
步骤2.2:使用分割网络对3D脊柱图像切片进行处理;
步骤2.3:使用融合模块将分割网络中的结果融合。
优选地,所述步骤2.1对训练集中的3D脊柱图像从横状面、冠状面、矢状面三个方向进行切片;得到横向面切片、冠状面切片、矢状面切片三组2D切片图像。
优选地,所述步骤2.2中的分割网络由三个独立的2D U-net网络组成,分别对应处理横向面切片、冠状面切片、矢状面切片;每个2D U-net都由4个下采样、4个上采样模块、1个最底层模块和跳层连接模块组成;下采样模块包括两个3*3卷积操作、ReLU线性整流函数、一个2*2最大池化操作;上采样模块包括一个2*2反卷积操作、两个3*3卷积操作、ReLU线性整流函数、操作;最底层模块包括2个3*3卷积操作;跳层连接模块连接相对应的下采样和上采用模块。
优选地,所述步骤2.3中的融合模块将分割网络中三个通道的结果融合成一个最终的结果;包括均值融合、投票和回归。
优选地,所述均值融合对步骤2.2中得到的横向面切片、冠状面切片、矢状面切片的结果进行评分,分别用Sa,Ss,Sc表示;
所述投票法用于在图像二值化后的分割结果;
所述回归法包括线性回归和逻辑回归,对于三个通道的回归看作在分割网络的输出层额外增加一个1*1的卷积层。
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