[发明专利]绵羊多角性状的基因芯片、分子探针组合、试剂盒及应用

说明书

本发明公开一种分析绵羊多角性状的基因芯片、分子探针组合、试剂盒及应用，涉及生物技术领域，本发明提供了270个体现绵羊多角性状的SNP位点组合，以及基于该位点组合形成的分子探针组合、基因芯片、试剂盒，利用本发明提供的位点组合及分子探针组合、基因芯片、试剂盒能对绵羊个体的多角性状进行分析，对早期难以度量的多角性状进行个体选择，缩短世代间隔，加速育种进程，节约大量的育种成本。

技术领域

本发明涉及生物技术领域，具体涉及生物检测技术领域，更具体的涉及绵羊多角性状分子探针组合、基因芯片、试剂盒及应用。

背景技术

绵羊是世界上最重要的经济动物之一，品种资源，而多角绵羊是其中一类珍贵的绵羊遗传资源，研究者将头上长有两只以上角的绵羊定义为多角绵羊（如图1所示），其中以四个角的表型居多，也叫四角绵羊，它仅存在于少数古老的绵羊品种中，且很多多角绵羊品种已处于濒危状态，各国都开展了相关的保种和育种工作，如建立多角羊保护协会以促进多角羊群体的保种、育种和商业交流。目前在欧洲、美洲的多角绵羊品种主要包括Icelandic羊、Manx Logthan羊和Hebridean羊等。我国也有四个多角绵羊品种，包括泗水裘皮羊、阿勒泰羊、蒙古羊、巴什拜羊。由于生产管理上的不便，使得多角绵羊个体在这些品种中的比例非常低，有的濒临灭绝。另一方面，由于这些多角绵羊具有较高的观赏价值，近些年来，作为非传统绵羊品种，多角绵羊品种培育及基础研究越来越受到人们的重视。

然而，绵羊角的表型很难在早期发现，只能待其生长到半岁至1岁才会确定。因此借住以DNA为基础的诊断间接测定多角表型成为研究者们关注的领域。Alderson等认为角的遗传是由两个位点调控的，两个位点都为隐性纯合时，则绵羊为多角表型。Icelandic绵羊的研究表明，在多角性状和两角性状这一对表型中，多角为显性遗传。对Jacob sheep和Navajo-Churro sheep两个国外多角绵羊品种研究表明，在绵羊2号染色体132Mb处存在多角表型的关联位点。对我国蒙古羊、阿勒泰羊和泗水裘皮羊进行全基因关联分析发现，在绵羊2号染色体上132.6Mb处，存在与绵羊多角性状显著相关的SNP标记。中国专利文献CN105603092A也发现位于绵羊MTX2基因下游53449bp处的多角性状的SNP标记，但是，能够决定表型的SNP通常是高度复杂的。

正如已经商业化的绵羊SNP芯片（Illumina Ovine SNP50 Beadchip（50K）、Illumina Sheep HD Genotyping Beadchip（680K）和Illumina Ovine LD（5K）），覆盖了绵羊全基因组的超过 54K 个 SNP 位点，用于遗传育种、全基因组关联分析、数量性状基因座定位、基因优选及比较基因组学等研究，尽管集合了如此众多的SNP位点。但是现有的绵羊SNP芯片由于主要依据西方品种绵羊的数据，缺乏中国绵羊品种与国外绵羊品种结合的SNP 数据，仍存在位点均匀性不足、对功能性位点和区域的体现不足、超过10%的位点在中国绵羊群体为极低频位点等诸多问题，因此设计一款适用于中国绵羊群体且能对多角性状进行快速有效检测SNP芯片，有着十分重要的意义。

发明内容

为满足我国当前绵羊品种研究和保护上对绵羊多角性状的分析需求，本发明提供了一种分析绵羊多角性状的分子探针组合、基因芯片、试剂盒及应用，利用本发明提供的SNP位点信息，能够快速准确的实现绵羊多角性状评价、品种筛选、品种鉴定、品种溯源、绵羊育种，有利于绵羊系谱的重构、种质资源保护以及种质资源改良，耗时短、成本低、市场效益广阔。

为实现本发明的技术目的，本发明提供以下技术方案：