[发明专利]分析绵羊毛用性状的基因芯片、分子探针组合、试剂盒及应用有效
申请号: | 202110834457.2 | 申请日: | 2021-07-23 |
公开(公告)号: | CN113278716B | 公开(公告)日: | 2021-11-09 |
发明(设计)人: | 李孟华;李心;罗凌云;杨继;吕锋骅 | 申请(专利权)人: | 中国农业大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11 |
代理公司: | 北京惠智天成知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 11681 | 代理人: | 周建 |
地址: | 100083 北京市海*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 分析 绵羊 性状 基因芯片 分子 探针 组合 试剂盒 应用 | ||
本发明公开一种分析绵羊毛用性状的基因芯片、分子探针组合、试剂盒及应用,涉及生物技术领域,本发明提供了分析绵羊毛用特征的2849个SNP位点组合以及基于该位点组合制成的分子探针组合、基因芯片、试剂盒,从基因水平对早期难以度量的性状进行检测,不仅能加速育种进程,节约育种成本,还能够用于绵羊品种的筛选、鉴定、绵羊系谱的重构、种质资源的保护以及种质资源的改良。
技术领域
本发明涉及生物技术领域,具体涉及绵羊检测技术领域,更具体的涉及分析绵羊毛用性状的基因芯片、分子探针组合、试剂盒及应用。
背景技术
绵羊是世界上最重要的经济动物之一,不仅可以作为食物供人类食用,还能作为奶制品的来源,此外,其毛用价值也在社会发展中发挥了重要作用。随着近年来毛织用品市场经济价值的不断走低,我国毛用为主的绵羊数量不断减少,但毛用制品的优势依然存在,为了更好的分析研究绵羊的毛用性能,获得更佳的优质的羊毛,同时也为了保护绵羊品种,已经有越来越多的科研工作者利用基因分析研究绵羊的毛用性状。
目前,分子标记技术由于其准确度高、可操作性强等优点越来越受到重视,其中基于单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)的分子标记技术应用得越来越广泛。SNP作为生物基因组中的一种遗传分子标记,在动植物遗传进化分析、重要经济形状筛选、分子育种等方面起着越来越重要的作用。基于SNP的SNP芯片是进行现代遗传育种便捷高效的工具,由于其容易实现SNP高通量、自动化检测,可以检测出基因组 DNA上每个碱基对的变化,包括插入、缺失、颠倒、转换等,已经成为非常理想的SNP检测技术,在绵羊育种领域中的运用也越来越多。
尽管已经商业化的绵羊SNP芯片(Illumina Ovine SNP50 Beadchip(50K)、Illumina Sheep HD Genotyping Beadchip(680K)和Illumina Ovine LD(5K)),覆盖了绵羊全基因组的超过 54K 个 SNP 位点,用于遗传育种、全基因组关联分析、数量性状基因座定位、基因优选及比较基因组学等研究。但是现有的绵羊SNP芯片由于主要依据西方品种绵羊的数据,缺乏中国绵羊品种与国外绵羊品种结合的 SNP 数据,仍存在位点均匀性不足、对功能性位点和区域的体现不足、超过10%的位点在中国绵羊群体为极低频位点等诸多问题,因此设计一款适用于中国绵羊群体且能对绵羊毛用性状进行快速有效检测的SNP芯片,有着十分重要的意义。
发明内容
为满足我国当前绵羊品种研究以及农业生产上对绵羊毛用的检测的需求,本发明提供了一种分析绵羊毛用的分子探针组合、基因芯片、试剂盒及应用,利用本发明提供的位点信息,能够快速准确的实现绵羊尾部脂肪沉积评价、品种筛选、品种鉴定、品种溯源、绵羊育种,有利于种质资源保护以及种质资源改良,耗时短、成本低、市场效益广阔。
为实现本发明的技术目的,本发明提供以下技术方案:
①2849个位点组合用于分析绵羊毛用性状的用途,所述2849个位点组合的物理位置信息基于绵羊 v4.0基因组序列比对确定,所述2849个位点组合的物理信息如表1所示。
表1 2849个位点组合的物理信息
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