[发明专利]一种小RNA定量检测方法在审

专利信息
申请号: 202110837219.7 申请日: 2021-07-23
公开(公告)号: CN113337585A 公开(公告)日: 2021-09-03
发明(设计)人: 刘晓雷;袁新旺;徐超;闫媛媛;刘冠宏 申请(专利权)人: 苏州英泽生物医药科技有限公司;上海圣梓茂生物科技有限公司
主分类号: C12Q1/6851 分类号: C12Q1/6851
代理公司: 苏州创元专利商标事务所有限公司 32103 代理人: 周敏;汪青
地址: 215600 江苏省苏州市张家港经*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 一种 rna 定量 检测 方法
【权利要求书】:

1.一种用于非疾病诊断和治疗目的的小RNA定量检测方法,该方法通过poly(A)加尾的小RNA逆转录得到cDNA,然后采用Taqman探针法对所述的cDNA进行实时定量PCR扩增检测得到目标小RNA的表达情况,其特征在于,用于逆转录的逆转录引物的序列组成为:5’-标签序列-Oligo dT-互补序列-3’,其中,所述的互补序列与目标小RNA 3’端碱基互补,所述的标签序列无茎环结构,所述的标签序列与待检测样品中所有序列均不互补,所述的标签序列GC含量为40%~60%,所述探针的序列与所述的标签序列的一段相同,

所述的小RNA定量检测方法用于同时检测多种目标小RNA的表达情况,不同的所述的逆转录引物的5’端的所述的标签序列不同,不同的探针使用不同的标记物。

2.根据权利要求1所述的小RNA定量检测方法,其特征在于,所述的互补序列长度为4~8个碱基,

和/或,所述的Oligo dT的长度为6~20个碱基,

和/或,所述的标签序列的长度为10~150个碱基。

3.根据权利要求1所述的小RNA定量检测方法,其特征在于,所述的标签序列的长度为15~100个碱基,所述的Oligo dT的长度为8~15个碱基,所述的互补序列的长度为4~6个碱基。

4.根据权利要求1所述的小RNA定量检测方法,其特征在于,用于所述的实时定量PCR扩增检测的反向引物的序列包括所述的标签序列的全部或部分。

5.根据权利要求1所述的小RNA定量检测方法,其特征在于,适用于所述的小RNA定量检测方法的待检测样品包括总RNA、纯化的小RNA或合成的小RNA。

6.根据权利要求1所述的小RNA定量检测方法,其特征在于,所述的小RNA包括miRNA、siRNA或ncRNA中的一种或多种。

7.根据权利要求1至6中任一项所述的小RNA定量检测方法,其特征在于,所述的小RNA定量检测方法具体包括:

(1)在poly(A)聚合酶的作用下,待检测样品中小RNA的3’端加上一段poly(A)序列,得到poly(A)加尾的小RNA;

(2)步骤(1)中所得的poly(A)加尾的小RNA在所述逆转录引物的作用下逆转录形成cDNA;

(3)采用Taqman探针法对步骤(2)中所得的cDNA进行实时定量PCR扩增检测,得到目标小RNA的表达情况。

8.根据权利要求7所述的小RNA定量检测方法,其特征在于,

所述步骤(1)的反应条件为35~40℃,20~40min;

所述步骤(2)的反应条件为37~52℃,20~40min。

9.根据权利要求7所述的小RNA定量检测方法,其特征在于,

所述步骤(1)的反应体系包括待检测样品、poly(A)聚合酶、ATP、poly(A)加尾缓冲液;

所述步骤(2)的反应体系包括经步骤(1)反应后的待检测样品、所述逆转录引物、逆转录酶、逆转录缓冲液、dATP、dTTP、dCTP、dGTP。

10.根据权利要求1至6中任一项所述的小RNA定量检测方法,其特征在于,所述的poly(A)加尾与所述的逆转录在同一个反应体系中进行,所述的小RNA定量检测方法具体包括:

(1)配制poly(A)加尾、逆转录反应体系,所述的poly(A)加尾、逆转录反应体系包括待检测样品、poly(A)聚合酶、逆转录引物、逆转录酶、逆转录缓冲液、ATP、dTTP、dCTP、dGTP、dATP;

(2)所述的加尾、逆转录反应体系于35~40℃下反应20~80min,或先于35~40℃下反应20~40min,然后于40~52℃下反应20~40min得到cDNA;

(3)采用Taqman探针法对步骤(2)中所得的cDNA进行实时定量PCR扩增检测,得到目标小RNA的表达情况。

11.一种小RNA定量检测试剂盒,其特征在于,所述的小RNA定量检测试剂盒包括逆转录反应试剂、PCR反应试剂,

所述的逆转录反应试剂中含有逆转录引物,所述的逆转录引物的序列组成为:5’-标签序列-Oligo dT-互补序列-3’,其中,所述的互补序列与所述的目标小RNA 3’端碱基互补,所述的标签序列无茎环结构,所述的标签序列与待检测样品中所有序列均不互补;所述的标签序列GC含量为40%~60%,所述的PCR反应试剂中含有正向引物、反向引物以及探针,

所述的正向引物的序列与目标小RNA逆转录后的序列互补,

所述的反向引物的序列包括所述的标签序列的全部或部分,

所述探针的序列与所述的标签序列的一段相同,

所述的小RNA定量检测方法用于同时检测多种目标小RNA的表达情况,不同的所述的逆转录引物的5’端的所述的标签序列不同,不同的探针使用不同的标记物。

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