[发明专利]一种小RNA定量检测方法在审
申请号: | 202110837219.7 | 申请日: | 2021-07-23 |
公开(公告)号: | CN113337585A | 公开(公告)日: | 2021-09-03 |
发明(设计)人: | 刘晓雷;袁新旺;徐超;闫媛媛;刘冠宏 | 申请(专利权)人: | 苏州英泽生物医药科技有限公司;上海圣梓茂生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6851 | 分类号: | C12Q1/6851 |
代理公司: | 苏州创元专利商标事务所有限公司 32103 | 代理人: | 周敏;汪青 |
地址: | 215600 江苏省苏州市张家港经*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 rna 定量 检测 方法 | ||
1.一种用于非疾病诊断和治疗目的的小RNA定量检测方法,该方法通过poly(A)加尾的小RNA逆转录得到cDNA,然后采用Taqman探针法对所述的cDNA进行实时定量PCR扩增检测得到目标小RNA的表达情况,其特征在于,用于逆转录的逆转录引物的序列组成为:5’-标签序列-Oligo dT-互补序列-3’,其中,所述的互补序列与目标小RNA 3’端碱基互补,所述的标签序列无茎环结构,所述的标签序列与待检测样品中所有序列均不互补,所述的标签序列GC含量为40%~60%,所述探针的序列与所述的标签序列的一段相同,
所述的小RNA定量检测方法用于同时检测多种目标小RNA的表达情况,不同的所述的逆转录引物的5’端的所述的标签序列不同,不同的探针使用不同的标记物。
2.根据权利要求1所述的小RNA定量检测方法,其特征在于,所述的互补序列长度为4~8个碱基,
和/或,所述的Oligo dT的长度为6~20个碱基,
和/或,所述的标签序列的长度为10~150个碱基。
3.根据权利要求1所述的小RNA定量检测方法,其特征在于,所述的标签序列的长度为15~100个碱基,所述的Oligo dT的长度为8~15个碱基,所述的互补序列的长度为4~6个碱基。
4.根据权利要求1所述的小RNA定量检测方法,其特征在于,用于所述的实时定量PCR扩增检测的反向引物的序列包括所述的标签序列的全部或部分。
5.根据权利要求1所述的小RNA定量检测方法,其特征在于,适用于所述的小RNA定量检测方法的待检测样品包括总RNA、纯化的小RNA或合成的小RNA。
6.根据权利要求1所述的小RNA定量检测方法,其特征在于,所述的小RNA包括miRNA、siRNA或ncRNA中的一种或多种。
7.根据权利要求1至6中任一项所述的小RNA定量检测方法,其特征在于,所述的小RNA定量检测方法具体包括:
(1)在poly(A)聚合酶的作用下,待检测样品中小RNA的3’端加上一段poly(A)序列,得到poly(A)加尾的小RNA;
(2)步骤(1)中所得的poly(A)加尾的小RNA在所述逆转录引物的作用下逆转录形成cDNA;
(3)采用Taqman探针法对步骤(2)中所得的cDNA进行实时定量PCR扩增检测,得到目标小RNA的表达情况。
8.根据权利要求7所述的小RNA定量检测方法,其特征在于,
所述步骤(1)的反应条件为35~40℃,20~40min;
所述步骤(2)的反应条件为37~52℃,20~40min。
9.根据权利要求7所述的小RNA定量检测方法,其特征在于,
所述步骤(1)的反应体系包括待检测样品、poly(A)聚合酶、ATP、poly(A)加尾缓冲液;
所述步骤(2)的反应体系包括经步骤(1)反应后的待检测样品、所述逆转录引物、逆转录酶、逆转录缓冲液、dATP、dTTP、dCTP、dGTP。
10.根据权利要求1至6中任一项所述的小RNA定量检测方法,其特征在于,所述的poly(A)加尾与所述的逆转录在同一个反应体系中进行,所述的小RNA定量检测方法具体包括:
(1)配制poly(A)加尾、逆转录反应体系,所述的poly(A)加尾、逆转录反应体系包括待检测样品、poly(A)聚合酶、逆转录引物、逆转录酶、逆转录缓冲液、ATP、dTTP、dCTP、dGTP、dATP;
(2)所述的加尾、逆转录反应体系于35~40℃下反应20~80min,或先于35~40℃下反应20~40min,然后于40~52℃下反应20~40min得到cDNA;
(3)采用Taqman探针法对步骤(2)中所得的cDNA进行实时定量PCR扩增检测,得到目标小RNA的表达情况。
11.一种小RNA定量检测试剂盒,其特征在于,所述的小RNA定量检测试剂盒包括逆转录反应试剂、PCR反应试剂,
所述的逆转录反应试剂中含有逆转录引物,所述的逆转录引物的序列组成为:5’-标签序列-Oligo dT-互补序列-3’,其中,所述的互补序列与所述的目标小RNA 3’端碱基互补,所述的标签序列无茎环结构,所述的标签序列与待检测样品中所有序列均不互补;所述的标签序列GC含量为40%~60%,所述的PCR反应试剂中含有正向引物、反向引物以及探针,
所述的正向引物的序列与目标小RNA逆转录后的序列互补,
所述的反向引物的序列包括所述的标签序列的全部或部分,
所述探针的序列与所述的标签序列的一段相同,
所述的小RNA定量检测方法用于同时检测多种目标小RNA的表达情况,不同的所述的逆转录引物的5’端的所述的标签序列不同,不同的探针使用不同的标记物。
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