[发明专利]一种分子图像缺键识别技术在审
申请号: | 202110844438.8 | 申请日: | 2021-07-26 |
公开(公告)号: | CN113569945A | 公开(公告)日: | 2021-10-29 |
发明(设计)人: | 裴剑锋;李合敏;徐优俊;张舰航;朱金涛 | 申请(专利权)人: | 英飞智药(苏州)科技有限公司 |
主分类号: | G06K9/62 | 分类号: | G06K9/62;G06T5/50;G06N3/04 |
代理公司: | 北京哌智科创知识产权代理事务所(普通合伙) 11745 | 代理人: | 陈培生 |
地址: | 215151 江苏省苏州*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 分子 图像 识别 技术 | ||
1.一种分子图像缺键识别技术,包括以下过程:
S1:生成化合物分子式图像:利用rdkit软件工具,把化合物分子式(smiles或者inchi字符串)生成化合物分子式对应的图像,模拟原始化合物图像的风格,在生成图像上叠加噪音,进行风格变换使其无限接近于原始图像的风格;
S2:生成图像原子、化学键标注数据集:S1中生成的图像,具有原子坐标信息,及原子之间化学键类型信息;利用这些信息,可以对图像中的原子和化学键进行标注,得到原子及化学键标注集;对该标注集,按照一定的比例进行划分,得到训练集1、测试集1和验证集1;
S3:生成环标注集:利用S1中生成的部分图像,对其中的环进行标注,得到环标注集;对改标注集,按照一定的比例进行划分,得到训练集2、测试集2和验证集2;
S4:原子、化学键检测识别模型和环检测识别模型:利用目标检测神经网络模型,在训练集1、测试卷1和验证集1上训练原子、化学键检测识别模型;在训练集2、测试集2和验证集2上训练环检测模型;
S5:生成化合物分子图:利用S4中训练的原子、化学键识别模型,对化合物图像进行检测识别,化学键作为原子之间的关系,利用识别到的化学键对原子进行连接操作,形成化合物分子图;
S6:利用rdkit软件工具进行分子图的校验并生成smiles或者inchi字符串。
2.根据权利要求1所述的一种分子图像缺键识别技术,其特征在于:利用环检测模型,对化合物图像进行检测识别,得到环的检测框以及环的类型用来推理未检测到化学键,从而引入原子间关系的推理能力。
3.根据权利要求1所述的一种分子图像缺键识别技术,其特征在于:化合物的环类型定义之后,结合环上原子、原子的化合价,以及化学先验知识,可以推理S4中原子、化学键检测识别模型输出的化学键检测结果是否存在缺失。
4.根据权利要求1所述的一种分子图像缺键识别技术,其特征在于:目标检测模型包括特征提取网络、分类网络、回归网络。
5.根据权利要求4所述的一种分子图像缺键识别技术,其特征在于:目标检测模型中的特征提取网络,可以用resnet、efficientnet卷积神经网络。
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