[发明专利]一种用于头颈部鳞状细胞癌化疗敏感性和/或化疗预后评估的环状RNA标志物及试剂盒

说明书

本发明属于生物检测技术领域，具体涉及一种用于头颈部鳞状细胞癌化疗敏感性和/或化疗预后评估的环状RNA标志物及试剂盒。本发明提供的标志物为环状RNA分子circTPST2(circ‑103188)，其表达含量与化疗药物的IC₅₀具有正相关的关系。这表明，通过检测circTPST2相对表达量，能够对化疗敏感性和/或化疗预后进行评估。本发明进一步提供了用于检测circTPST2的试剂盒。本发明能够帮助临床医生合理选择头颈部鳞状细胞癌的治疗方案，提高患者生存率，具有很高的应用价值。

技术领域

本发明属于生物检测技术领域，具体涉及一种用于头颈部鳞状细胞癌化疗敏感性和/或化疗预后评估的环状RNA标志物及试剂盒。

背景技术

头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)是临床最常见的头颈部恶性肿瘤。尽管已经做出了许多努力，HNSCC患者的存活率仍然不理想，5年生存率仅40％–50％。顺铂和5-氟尿嘧啶联合使用，或CDDP、5FU和多西他赛三者联合使用是目前HNSCC最常用的化疗方案。然而研究显示，为逃避多种化疗药物的作用，肿瘤细胞已进化出多种功能，包括药物流入过少或外流过多、药物失活或缺乏激活、药物靶标表达水平的改变、激活适应性生存反应。这使得HNSCC对化疗药物的敏感性降低，最终导致HNSCC持续生长和转移扩散。因此，探究头颈部鳞状细胞癌化疗敏感性降低的机制，发现头颈部鳞癌化疗预后的分子标记物，进而早期增强头颈部鳞状细胞癌的化疗敏感性对于改善患者化疗预后，提高其生活质量具有重要意义。遗憾的是，目前尚无有效预测及早期诊断头颈鳞癌化疗敏感性的分子标记物。

中国发明专利申请“CN108660207A用于头颈部鳞状细胞癌诊断的循环长链非编码RNA生物标志物和试剂盒及用途”提供了一种用于头颈部鳞状细胞癌诊断的RNA生物标志物。然而，该RNA生物标志物仅能够对HNSCC进行诊断，无法对头颈鳞癌化疗敏感性进行预测。

在真核细胞中，mRNA前体可以通过反向拼接，将3’段与5’端相结合，进而产生包含外显子或内含子序列的环状RNA。环状RNA的表达具有组织特异性和细胞特异性。因为环状RNA缺乏5’端帽状结构及3’端多聚腺苷酸尾部结构，目前生物学界普遍认为相比于普通线状RNA，该RNA的稳定性更佳。已有大量文献报道在不同种类的人类恶性肿瘤中,不同的环状RNA都发挥了重要作用。然而，目前尚未有环状RNA在HNSCC的化疗敏感性预测或诊断中应用的相关研究。

发明内容

针对现有技术中的缺陷，本发明提供一种用于头颈部鳞状细胞癌化疗敏感性和/或化疗预后评估的环状RNA标志物及试剂盒。目的在于：提供一种新的标志物，实现对头颈部鳞状细胞癌化疗敏感性和/或化疗预后的评估。

一种环状RNA，它是序列如SEQ ID NO.5所示的circTPST2。

本发明还提供检测上述环状RNA表达水平的试剂在预测或辅助预测头颈部鳞状细胞癌化疗敏感性的试剂盒中的用途，和/或，在预测或辅助预测头颈部鳞状细胞癌化疗预后的试剂盒中的用途。

本发明还提供预测或辅助预测头颈部鳞状细胞癌化疗敏感性和/或化疗预后的试剂盒，它包括用于特异性检测上述环状RNA的表达水平的试剂A。

优选的，所述试剂A用于特异性识别所述环状RNA逆转录得到的cDNA。

优选的，所述试剂A为引物对A，所述引物对A中，正向引物为SEQ ID NO.1所述的核苷酸序列或者与前述序列具有95％同源性的核苷酸序列，反向引物为SEQ ID NO.2所述的核苷酸序列或者与前述序列具有95％同源性的核苷酸序列。

优选的，所述引物对A中正向引物与反向引物的用量摩尔比为1:1。

优选的，还包括用于特异性检测GAPDH的试剂B。