[发明专利]一种斑马鱼荧光图像的分割方法及装置有效
申请号: | 202110882760.X | 申请日: | 2021-08-02 |
公开(公告)号: | CN113706570B | 公开(公告)日: | 2023-09-15 |
发明(设计)人: | 陈俊周;赵楠;韦艳宏 | 申请(专利权)人: | 中山大学 |
主分类号: | G06T7/174 | 分类号: | G06T7/174;G06N3/0464;G06N3/08 |
代理公司: | 广州三环专利商标代理有限公司 44202 | 代理人: | 郭浩辉;颜希文 |
地址: | 510275 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 斑马 荧光 图像 分割 方法 装置 | ||
1.一种斑马鱼荧光图像的分割方法,其特征在于,包括:
获取多通道的斑马鱼荧光图像;
将所述多通道斑马鱼荧光图像输入至斑马鱼血管分割模型中,以使所述斑马鱼血管分割模型进行分割最终输出分割结果;其中,所述斑马鱼血管分割模型用于根据ECA注意力机制对所述多通道斑马鱼荧光图像进行图像增强处理后,进行降维处理并生成单通道的斑马鱼荧光图像,继而根据所述单通道的斑马鱼荧光图像进行分割;
其中,所述斑马鱼血管分割模型包括:自适应增强部分和网络分割部分;其中,所述自适应增强部分用于根据所述ECA注意力机制对所述多通道斑马鱼荧光图像进行图像增强处理后,进行降维处理并生成所述单通道的斑马鱼荧光图像;所述网络分割部分用于根据所述单通道的斑马鱼荧光图像进行分割;
其中,所述自适应增强部分用于根据所述ECA注意力机制对所述多通道斑马鱼荧光图像进行图像增强处理后,进行降维处理并生成所述单通道的斑马鱼荧光图像,具体为:
所述自适应增强部分包括:第一卷积层、ECA层、第一跳跃连接层和第二卷积层;
其中,所述第一卷积层用于对所述多通道斑马鱼荧光图像进行升维处理并进行增加网络非线性处理之后,生成第一图像;
所述ECA层用于使用所述ECA注意力机制获取所述第一图像的重要程度,并根据所述重要程度进行图像增强处理后,生成第二图像;其中,所述第一图像和所述第二图像的维度均为第一维度;
所述第一跳跃连接层用于将所述第二图像与所述多通道斑马鱼荧光图像拼接后生成第三图像;其中,所述第三图像的维度为第二维度;
所述第二卷积层用于将所述第三图像进行降维处理,生成所述单通道的斑马鱼荧光图像;
其中,所述网络分割部分用于根据所述单通道的斑马鱼荧光图像进行分割,具体为:
所述网络分割部分包括:编码器、金字塔池化层、第二跳跃连接层和第三卷积层;
其中,所述编码器用于将所述单通道的斑马鱼荧光图像进行特征提取,得到感兴趣特征图;
所述金字塔池化层用于使用N个不同尺寸的卷积核进行池化操作得到N个池化结果后,对N个所述池化结果进行上采样,得到多个相同尺寸的采样特征图;其中,N为正整数;所述采样特征图的尺寸和所述感兴趣特征图的尺寸大小相同;
所述第二跳跃连接层用于将所述感兴趣特征图和所述采样特征图进行拼接后,生成拼接特征图;
所述第三卷积层用于对所述拼接特征图进行分割,得到分割结果。
2.根据权利要求1所述的一种斑马鱼荧光图像的分割方法,其特征在于,所述根据ECA注意力机制对所述多通道斑马鱼荧光图像进行图像增强处理后,进行降维处理并生成单通道的斑马鱼荧光图像,具体为:
对所述多通道斑马鱼荧光图像进行升维处理并进行增加网络非线性处理之后,生成第一图像;
使用ECA注意力机制获取所述第一图像的重要程度,并根据所述重要程度进行图像增强处理后,生成第二图像;其中,所述第一图像和所述第二图像的维度均为第一维度;
将所述第二图像与所述多通道斑马鱼荧光图像拼接后生成第三图像;其中,所述第三图像的维度为第二维度;
将所述第三图像进行降维处理,生成所述单通道的斑马鱼荧光图像。
3.根据权利要求2所述的一种斑马鱼荧光图像的分割方法,其特征在于,所述使用ECA注意力机制获取所述第一图像的重要程度,并根据所述重要程度进行图像增强处理后,生成第二图像,具体为:
使用所述ECA注意力机制获取所述第一图像中每个通道的重要程度,根据所述重要程度增强重要特征表达后,完成图像增强处理并生成所述第二图像。
4.根据权利要求3所述的一种斑马鱼荧光图像的分割方法,其特征在于,所述根据所述单通道的斑马鱼荧光图像进行分割,具体为:
将所述单通道的斑马鱼荧光图像进行特征提取,得到感兴趣特征图;
使用N个不同尺寸的卷积核进行池化操作得到N个池化结果后,对N个所述池化结果进行上采样,得到多个相同尺寸的采样特征图;其中,N为正整数;所述采样特征图的尺寸和所述感兴趣特征图的尺寸大小相同;
将所述感兴趣特征图和所述采样特征图进行拼接后,生成拼接特征图;
对所述拼接特征图进行分割,得到分割结果。
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