[发明专利]一种用于鉴定结核分枝杆菌复合群的SNP分子标记、PCR引物及应用

权利要求书

1.SNP分子标记在用于检测和/或鉴定结核分枝杆菌复合群中的应用，所述应用为非疾病诊断目的；

其中，所述SNP分子标记包括位于Hsp65基因上的SNP 1~SNP 8和位于rpsA基因上的SNP9~SNP 15；其中，

SNP1位于SEQ ID No. 1所示序列5’端起25位，碱基是G、C、T或A；

SNP2位于SEQ ID No. 1所示序列5’端起31位，碱基是C或G；

SNP3位于SEQ ID No. 1所示序列5’端起54位，碱基是G、C、T或A；

SNP4位于SEQ ID No. 1所示序列5’端起95位，碱基是T或C；

SNP5位于SEQ ID No. 1所示序列5’端起134位，碱基是G、A或C；

SNP6位于SEQ ID No. 1所示序列5’端起138位，碱基是C、A、G或T；

SNP7位于SEQ ID No. 1所示序列5’端起154位，碱基是C、A、G或T；

SNP8位于SEQ ID No. 1所示序列5’端起155位，碱基是G、C或A；

SNP9位于SEQ ID No. 2所示序列5’端起78位，碱基是T或C；

SNP10位于SEQ ID No. 2所示序列5’端起90位，碱基是G、A或C；

SNP11位于SEQ ID No. 2所示序列5’端起93位，碱基是G、T或C；

SNP12位于SEQ ID No. 2所示序列5’端起135位，碱基是T或C；

SNP13位于SEQ ID No. 2所示序列5’端起195位，碱基是A或G；

SNP14位于SEQ ID No. 2所示序列5’端起225位，碱基是G、T或C；

SNP15位于SEQ ID No. 2所示序列5’端起297位，碱基是G或A；

当多态性结果显示SNP 1~SNP 15对应的碱基为AGACGACATAGTAGA时，则为结核分枝杆菌复合群；

当SNP 1~SNP 15对应的碱基为GCGTAGGCTAGTAGA，则为卡内蒂分枝杆菌；

当SNP 1~SNP 15对应的碱基为TCGTCTGCCGCCGCG，则为脓肿分枝杆菌；

当SNP 1~SNP 15对应的碱基为TGCTGGACCCCCGCG，则为鸟分枝杆菌；

当SNP 1~SNP 15对应的碱基为TCTCCTGCCGTCGTG，则为龟分枝杆菌；

当SNP 1~SNP 15对应的碱基为GCGTACGCCGCCGCG，则为偶然分枝杆菌；

当SNP 1~SNP 15对应的碱基为CCGTACGCCGCCGCG，则为胞内分枝杆菌；

当SNP 1~SNP 15对应的碱基为GCGTCGGGCGCCGCG，则为堪萨斯分枝杆菌；

当SNP 1~SNP 15对应的碱基为GCGTCGTCCGCCGCG，则为海分枝杆菌；

当SNP 1~SNP 8对应的碱基为CCGTAGGC，则为戈登分枝杆菌。