[发明专利]一种自动分割脑微出血点的方法在审
申请号: | 202110891515.5 | 申请日: | 2021-08-04 |
公开(公告)号: | CN113344922A | 公开(公告)日: | 2021-09-03 |
发明(设计)人: | 边钺岩 | 申请(专利权)人: | 南京钺曦医疗科技有限公司 |
主分类号: | G06T7/00 | 分类号: | G06T7/00;G06T7/62;G06T7/66;G06K9/32;G06N3/04 |
代理公司: | 北京卓岚智财知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 11624 | 代理人: | 郭智 |
地址: | 210000 江苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 自动 分割 出血 方法 | ||
1.一种自动分割脑微出血点的方法,其特征在于,包括如下5个步骤:第一步:数据预处理,包括读取SWI图像和QSM图像;进行脑实质提取,去除脑实质以外的组织;第二步:提取微出血候选框,包括通过自适应阈值,提取候选微出血点;对候选微出血点进行形态学处理;根据体积进行候选微出血点筛选;第三步:候选微出血分类识别,包括归一化微出血点;训练分类网络;将微出血候选框中的数据输入训练好的分类网络,进行分类;对微出血候选框中的微出血体积和个数进行统计;所述第一步还包括:
S1.1:读取SWI图像和QSM图像;对于已有SWI图像和QSM图像的序列直接进行读取;对于未存在SWI图像和QSM图像的序列,读取磁敏感成像的幅值图像与相位图像,通过通用磁敏感加权计算技术,计算出SWI图像和QSM图像;
S1.2:对SWI图像和QSM图像进行各向同性重采样,使其像素大小为0.5-1毫米;
S1.3:进行脑实质提取,去除脑实质以外的组织;使用分割算法分割脑实质,分割方法包括但不限于主动轮廓方法、深度学习分割网络;所述第二步还包括:
S2.1:通过自适应阈值,提取SWI图像中的候选微出血点;通过对脑实质中的像素进行最大类间差法得到自适应的阈值,低于阈值并处于脑实质中的像素为候选出血点;
S2.2:对候选微出血点进行形态学处理;对微出血点进行形态学开操作处理,断开粘连,并消除极其微小的噪点;
S2.3:根据体积进行候选微出血点筛选;根据微出血的定义,其直径在2-10毫米之间,由球体积,为圆周率,约等于3.14,R为球的半径,可知微出血点的体积范围应该在-立方毫米之间; 筛除体积不在-立方毫米范围内的候选出血点,剩下的候选出血点为最终候选出血点;
S2.4:计算最终候选出血点的质心,以质心为中心,提取12毫米为边长的立方体为微出血点候选框。
2.根据权利要求1所述的自动分割脑微出血点的方法,其特征在于:所述第三步还包括:
S3.1:训练分类网络,首先,标记训练数据中的微出血点,并计算每个出血点的质心,a以12毫米为边长,提取相应的SWI图像和QSM图像的三维数据,作为正样本;
S3.2:然后以同样大小的选框,随机提取脑实质内非出血点的SWI图像和QSM图像三维数据,作为负样本;将SWI和QSM三维数据正负样本与对应样本标签输入网络框架,训练得出微出血分类网络模型;
S3.3:输入为SWI与QSM图像候选块,其基本结构为:顺序连接的大小为3×3×3的3D卷积核,Batch Norm层和Relu激活函数,连接另一个3×3×3的3D卷积核,Batch Norm层,Relu激活函数,将输入与最后一个Relu激活函数前的输出进行拼接;
S3.4:将微出血候选框中的数据输入训练好的分类网络,进行分类;对微出血候选框中的微出血体积和个数进行统计;统计一共有多少个被分类为微出血的候选框,作为最终的微出血点个数;以被分类为微出血的候选框中心点为种子点,进行区域生长,对得到的区域进行体积换算,得到每个微出血点的体积。
3.根据权利要求2所述的自动分割脑微出血点的方法,其特征在于:所述微出血分类网络模型整个网络为顺序连接3个基本结构与大小为2×2×2的平均池化层,最终连接1个4096单元的全连接层与1个1024单元的全连接层,其中3个基本结构的区别为卷积层包含卷积核的数量,分别为16、32与64个。
4.一种自动分割脑微出血点的存储和处理的装置,其特征在于,包括存储器和处理器;
所述存储器,用于存储计算机程序;
所述处理器,用于当执行所述计算机程序时,实现如权利要求1-3所述的自动分割脑微出血点的方法。
5.一种计算机可读存储介质,其特征在于,所述存储介质上存储有计算机程序,当所述计算机程序被处理器执行时,实现如权利要求1-3所述的自动分割脑微出血点的方法。
6.一种自动分割脑微出血点的装置,其特征在于,包括:
模块1,用于数据预处理,包括读取SWI图像和QSM图像;进行脑实质提取,去除脑实质以外的组织;
模块2,用于提取微出血候选框,包括通过自适应阈值,提取候选微出血点;对候选微出血点进行形态学处理;根据体积进行候选微出血点筛选;
模块3,用于候选微出血分类识别,包括归一化微出血点;训练分类网络;将微出血候选框中的数据输入训练好的分类网络,进行分类;对微出血候选框中的微出血体积和个数进行统计。
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