[发明专利]一种去除质谱流式数据中钆同位素通道污染的方法有效
申请号: | 202110904965.3 | 申请日: | 2021-08-07 |
公开(公告)号: | CN113588524B | 公开(公告)日: | 2022-06-07 |
发明(设计)人: | 尹巍巍;刘俊伟;陈伟 | 申请(专利权)人: | 浙江大学 |
主分类号: | G01N15/14 | 分类号: | G01N15/14;G01N27/62;G01N1/34 |
代理公司: | 杭州奥创知识产权代理有限公司 33272 | 代理人: | 赵梅 |
地址: | 310027 浙*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 去除 质谱流式 数据 同位素 通道 污染 方法 | ||
1.一种去除质谱流式数据中钆同位素通道污染的方法,其特征在于,包括如下步骤:
1)、在使用CyTOF检测时,预先设计钆同位素耦连的抗体特异性标记的生物标记物不能同时共表达于一个细胞,且至少两种钆同位素耦连抗体,至多五种钆同位素耦连抗体,其中,钆同位素选自155Gd~158Gd,160Gd;
2)、对钆同位素各通道间的污染信号强度比率RGd进行估算;
3)、对单个细胞受污染程度系数k进行估算;
4)、基于估算得到的RGd和k,计算钆同位素通道的污染信号的估计值,通过以下公式获得去除钆同位素通道污染的校正数据:
Datacorrected=max(0,Dataobserved-k*RGd)+noise
式中,Dataobserved代表经数据预处理的钆同位素通道的CyTOF数据,如果样本含有钆污染,则是去除钆污染前的钆同位素通道的CyTOF数据;Datacorrected代表去除钆污染的钆同位素通道的CyTOF校正数据;noise代表钆同位素通道的背景噪声信号。
2.根据权利要求1所述的去除质谱流式数据中钆同位素通道污染的方法,其特征在于,步骤2)利用钆同位素通道污染信号的共线性特性,估算RGd:
取Dataobserved平均信号强度前5%~10%的细胞,采用线性回归模型分别计算不同钆同位素通道污染信号的强度比率,具体以一个钆同位素通道为钆同位素基准通道,利用以下公式计算155Gd~158Gd,160Gd各通道污染信号相对于该钆同位素基准通道污染信号的强度比率
其中,每个i值代表一个钆同位素通道,i=1,2,...,5分别对应钆同位素通道155Gd~158Gd,160Gd;i=1,2,...,5分别对应钆同位素通道155Gd~158Gd,160Gd的污染信号与钆同位素基准通道污染信号的强度比率;为经数据预处理的CyTOF数据钆同位素基准通道的检测信号;b为一元线性回 归的常数项;ε为数据偏离线性的误差;分别对应经数据预处理的CyTOF数据钆同位素通道155Gd~158Gd,160Gd的检测信号;
或者步骤2)采用自然界存在的钆同位素丰度的比率对RGd进行估算。
3.根据权利要求2所述的去除质谱流式数据中钆同位素通道污染的方法,其特征在于,步骤2)利用钆同位素通道污染信号的共线性特性,估算RGd:
取Dataobserved平均信号强度前5%~10%的细胞,采用线性回归模型分别计算不同钆同位素通道污染信号的强度比率,具体以一个钆同位素通道为钆同位素基准通道,利用以下公式计算155Gd~158Gd,160Gd各通道污染信号相对于该钆同位素基准通道污染信号的强度比率
其中,每个i值代表一个钆同位素通道,i=1,2,...,5分别对应钆同位素通道155Gd~158Gd,160Gd;分别对应钆同位素通道155Gd~158Gd,160Gd的污染信号与钆同位素基准通道污染信号的强度比率;为经数据预处理的CyTOF数据钆同位素基准通道的检测信号;b为一元线性回归的常数项;ε为数据偏离线性的误差;分别对应经数据预处理的CyTOF数据钆同位素通道155Gd~158Gd,160Gd的检测信号。
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