[发明专利]水稻抽穗期调控基因OsGI的分子标记及其应用

说明书

本发明公开了一种水稻抽穗期调控基因OsGI的分子标记及其应用，通过设计OsGI基因的InDel分子标记，不存在遗传交换，准确性高；由于扩增片段酶切后存在较大的差异，可以直接用于琼脂糖电泳检测，更为方便；且属于共显性标记，可以鉴定纯合和杂合个体，缩短育种周期，提高育种效率。

技术领域

本发明属于分子遗传学领域，具体涉及一个水稻抽穗期调控基因OsGI的分子标记及其应用的分子标记及其应用。

背景技术

水稻是全世界近一半人口的主粮，同时，也是我国最重要的粮食作物。水稻的生育期(或者抽穗期)是影响水稻产量的重要因素之一。所以在育种过程中我们需要根据目标种植环境选种不同生育期的品种进行种植才能保证水稻高产稳产。

水稻生育期(或者抽穗期)是典型的数量性状，受多基因控。分子标记辅助选择是一种利用与抽穗期基因紧密连锁标记或者基因内功能标记，在后代中结合基因型和表型鉴定对目标性状进行选择的现代育种技术。

为了大大缩短水稻抽穗期的育种年限、提高育种效率，节约大量的人力与物力成本，有必要找到一种水稻抽穗期调控基因的分子标记将其应用于水稻育种中。

发明内容

基于此，本发明的目的在于提供一种水稻抽穗期调控基因OsGI的分子标记、及其正反引物与应用。具体技术方案如下：

本发明提供了一种水稻抽穗期调控基因OsGI的分子标记，所述分子标记为OsGI_InDel_255，用于扩增所述分子标记的引物的核苷酸序列如下：

OsGI_InDel_255F：5’-GTATCATCGTACAAAAGGCAGGT-3’，SEQ ID NO.1；

OsGI_InDel_255R：5’-GACGACAAGCATACAGAGACTCC-3’SEQ ID NO.2。

进一步地，所述分子标记位于水稻基因组第1号染色体。

进一步地，所述水稻抽穗期调控基因OsGI的分子标记由核苷酸序列为SEQ IDNO.1和SEQ ID NO.2的引物对在基因组位置上下游300bp内扩增得到。

本发明还提供了所述水稻抽穗期调控基因的应用。具体技术方案如下：

所述的分子标记在水稻抽穗期的检测和/或预测中的应用，和/或所述的分子标记在水稻育种中的应用。

在其中一些实施例中，所述水稻育种包括：调控水稻抽穗期育种：选择晚抽穗水稻或早抽穗水稻；和/或

在其中一些实施例中，所述水稻育种包括：鉴定水稻抽穗期调控基因OsGI的基因型，缩短水稻育种周期。

本发明还提供了一种使用水稻抽穗期调控基因OsGI的分子标记基因型鉴定及水稻育种的方法，包括以下步骤：

(1)提取供试水稻样品基因组DNA；

(2)利用核苷酸序列如SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2所示的引物对步骤1)中所提取基因组进行PCR扩增，获得扩增产物；

(3)琼脂糖检测扩增产物；

如果有328bp的单条带，则表示所述样品为早抽穗品种；如果有583bp的单条带，则表示所述样品为晚抽穗品种；如果有328bp和583bp两条带，则表示所述样品为OsGI杂合基因型。

在其中一些实施例中，所述PCR扩增的扩增体系包含：Taq酶，模板DNA，核苷酸序列如SEQ ID NO.1和SEQ IDNO.2所示的引物，PCR buffer。