[发明专利]一种原位阵列式根系表型监测系统及其工作方法有效
申请号: | 202110911319.X | 申请日: | 2021-08-10 |
公开(公告)号: | CN113643181B | 公开(公告)日: | 2022-04-19 |
发明(设计)人: | 孙国祥;魏佳音;朱鼎龙;周新竹;刘锦琳;王雪忠;蔡嘉奇 | 申请(专利权)人: | 南京农业大学 |
主分类号: | G06T3/40 | 分类号: | G06T3/40;G06T5/00;G06T5/50;G06T7/13;G06T7/136;G06T7/187;G06T7/90 |
代理公司: | 成都方圆聿联专利代理事务所(普通合伙) 51241 | 代理人: | 邓永红 |
地址: | 210095 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 原位 阵列 根系 表型 监测 系统 及其 工作 方法 | ||
1.一种原位阵列式根系表型监测系统的工作方法,其特征在于:
所述原位阵列式根系表型监测系统,包括:图像无线传输网关、按压式开关、充电孔、LED照明系统、无线摄像头模块、稳压电源模块和外壳;
所述图像无线传输网关通过Wifi连接至局域网中,实现图像无线传输;
所述按压式开关:控制原位阵列式根系表型监测系统的电路通断;
所述充电孔:用于接通电源为电池板连接;
所述LED照明系统:根窗成像系统补光系统;
所述无线摄像头模块:用于获得根系图像并通过图像无线传输网关传输;
稳压电源模块包括:蓄电池和降压板,电池用于原位阵列式根系表型监测系统的供电;降压板保证原位阵列式根系表型监测系统在工作电压内运行;
图像无线传输网关设置于外壳顶部,按压式开关、充电孔和LED照明系统设置于外壳侧面,无线摄像头模块设置于外壳的正面表面,稳压电源模块设在外壳底部内部;
蓄电池输出口依次串联按压式开关、图像无线传输网关和降压板;降压板并联无线摄像头模块、LED照明系统,并供电;
所述工作方法包括以下步骤:
S1:根系图像采集
采用ESP32-CAM模块作为根系成像系统的拍摄部分,为16个摄像头分别设定固定IP地址并通过基于Python语言的爬虫技术控制,并以此控制16个ESP32-CAM进行各个根系测量区的图像采集,获取多组不同角度和距离的长方形棋盘标定板;
S2:根系图像畸变校正
通过张正友标定法,测定各个无线摄像头的内参矩阵、外参矩阵、径向畸变和切向畸变参数;
内参矩阵为:
外参矩阵为:
其中,f为像距,dX,dY分别表示X,Y上单个像素在感光板上的物理长度,u0、v0为感光板在像素坐标系下的坐标,θ为感光板横纵边比例角度;
R表示旋转矩阵,T表示平移矢量;
进而利用图形坐标和像素坐标的转化关系:
并依据如下的径向畸变矫正公式:
xdr=x(1+k1r2+k2r4+k3r6)
ydr=y(1+k1r2+k2r4+k3r6)
以及如下的切向畸变的矫正公式:
xdt=2p1xy+p2(r2+2x2)+1
ydt=2p1(r2+2y2)+2p2xy+1
其中r2=x2+y2
式中:
u、v为理想的像素坐标,xdr,ydr,xdt,ydt分别代表径向、切向畸变后图像X、Y轴像素点的坐标,x、y为理想的无畸变坐标,k1、k2、k3、p1、p2为5个畸变系数,r为该点距成像中心的距离;
进而得到如下矫正公式:
以此利用识别标定板获得的畸变后坐标及L-M算法获得的无畸变坐标(u,v),带入上式,即可得到相应的参数k1、k2进而完成矫正;
OV2640广角摄像头的畸变校正参数依次标定,后期直接使用各个摄像头的校正参数对畸变的根系图像进行校正;
S3:根系图像预处理
对校正后的根系图像使用大小为3×3且σ=3的二维高斯平滑滤波器H与每张输入图像F卷积,用确定的邻域内像素的加权平均灰度值去替代模板中心像素点的值,进而得到输出图像G,其公式为:
式中:
i、j分别为像素大小,h(i,j)为高斯平滑滤波器,f(i,j)原图像的各个像素,g(i,j)为卷积后的各图像像素,最终形成预处理后的图像;
S4:根系图像自动化拼接,子步骤如下:
S41:使用Harris角点检测算法对根系图像拟拼接部分求取特征点;
S42:采用索引树改进的快速最近邻搜索方法,进行特征点初始匹配,索引树常用于多维空间关键数据的搜索,而快速最近邻算法能有效地减少计算量;
首先根据相似性距离建立K-D树索引,对于某一特征向量距离的计算,计算其最近邻与次近邻的比值,若这个值小于预先假设的阈值,则就认为该最近邻是较好的匹配,完成特征点对的初始匹配;再根据每个特征点Laplacian标识符的值为1还是为0来区分暗背景上的亮斑和亮背景的暗斑,对同类型的特征点进行匹配;
S43:利用投影变换模型:
把多幅图像的坐标(x1,y1)、(x2,y2)、......(x16,y16)初步映射到同一坐标系X、Y下,再采用RANSAC算法进一步去除外点,计算图像之间的变换矩阵进而完成最终的坐标变换;
S44:由于成像受光线和相机内参影响,拼接后的图像出现明显的拼接痕迹及区域亮度不同,故而使用HIS变换模型,统一亮度;将三原色光R、G、B各分量相加并取平均值得到亮度分量I,用I减去1/I与RGB各自最小分量相乘得到色调分量S,进而依据下列公式使用反余弦变换,求得饱和度分量H;
式中:R、G、B为三原色分量,H为饱和度分量;
再将变换后得到的亮度分量I,在直方图匹配法下与参考图像的I分量进行融合,得到新的融合亮度分量并代替原始的亮度分量,并同H和S分量图像一起进行IHS逆变换,最后得到RGB空间表示的融合结果;
S5:根系图像分割,子步骤如下:
S51:对用平均值法对融合图像的RGB三分量相加取平均值,完成灰度化处理;
S52:用γ=0.8的伽马变换对根系图像增强图像对比度,即将图像归一化后的每个像素点灰度值以γ=0.8次幂形式变换,得到对应的输出图像;
S53:对图像进行开运算;其基本原理为:以基准图像B的原点为坐标扫描待处理图像A的所有像素点,用基准图像B与处理图像A覆盖的二值X图像做“与”操作形成新的图像A,再与基准图像B进行“或”操作,即完成图像开运算;
S54:使用分水岭算法进行分割,再对梯度图像实施阈值化处理,减少图像的过分割,最终完成提取轮廓;
S6:根系表型参数计算,子步骤如下:
S61:用Canny边缘检测算子对作物根系的边缘进行处理,获取边缘像素点;
S62:用1表示作物根系的图像区域:用0表示背景区域;通过扫描法对根系二值图像进行扫描,计算出根系图像中像素点为1的点的个数,再进行求和处理求得总数;
S63:将像素点等于1的像素相加,得到总数根系的面积S;
S64:根系的周长值就是边缘像素点的距离长,计算周长时采用每次一个像素点的方式进行增加,表示距离为1;对角线方向运用8邻域连通法以个像素递增方式进行边缘像素点距离的计算,最终周长L为边缘上所有水平、垂直像素点相加,再加上个对角线像素点;通过将周长中各像素分别取平均值再累加方式求得周长。
2.根据权利要求1所述的一种原位阵列式根系表型监测系统的工作方法,其特征在于:S42中阈值设为0.8。
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