[发明专利]一种基于熔解曲线的多重数字核酸分析装置和分析方法在审
申请号: | 202110912584.X | 申请日: | 2021-08-10 |
公开(公告)号: | CN113699033A | 公开(公告)日: | 2021-11-26 |
发明(设计)人: | 沈峰;迂妍 | 申请(专利权)人: | 上海交通大学 |
主分类号: | C12M1/38 | 分类号: | C12M1/38;C12M1/34;C12M1/00;C12Q1/6851 |
代理公司: | 上海旭诚知识产权代理有限公司 31220 | 代理人: | 郑立 |
地址: | 200240 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 熔解 曲线 多重 数字 核酸 分析 装置 方法 | ||
1.一种基于熔解曲线的多重数字核酸分析装置,其特征在于,包括微流控芯片、平板PCR仪、荧光检测系统和处理器;所述荧光检测系统包括激发光源、滤光片及相机。
2.如权利要求1所述的多重数字核酸分析装置,其特征在于,所述微流控芯片包括滑动式微流控芯片,所述滑动式微流控芯片包括下芯片和上芯片,所述下芯片和上芯片为两块紧密接触的平板,两块所述平板间具有一层润滑油;所述下芯片和所述上芯片上分别加工有管路和孔。
3.如权利要求1所述的多重数字核酸分析装置,其特征在于,所述平板PCR仪和所述荧光检测系统集成为同一个系统。
4.一种基于熔解曲线的多重数字核酸分析方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:
步骤1、在微流控芯片上将PCR反应体系分散到大量反应微单元中,得到分散后的反应微单元,所述微反应单元的体积可以是同等大小也可以是不同大小;
步骤2、将经过步骤1分散后的微流控芯片放在平板PCR仪上,对其进行数字PCR扩增,在步骤1获得的每个独立的分散后的微反应单元中对核酸进行扩增,得到扩增产物;
步骤3、数字熔解曲线分析,对步骤2进行扩增的微反应单元进行温度控制和荧光检测,获得所述微反应单元的熔解曲线,并分析所述熔解曲线;最后根据阳性微反应单元在总微反应单元的比例、微反应单元的体积以及扩增反应效率因素,对目标核酸进行准确的定量分析。
5.如权利要求3所述的多重数字核酸分析方法,其特征在于,所述步骤1还包括分散所述PCR反应体系的方法包括微液滴、微孔或微腔室法,通过流体控制设备,根据表面物理及化学性质、离心力、表面张力、重力或剪切力多种驱动力完成;所述PCR反应体中包括核酸嵌入式荧光染料,所述核酸嵌入式荧光染料包括SybrGreen、EvaGreen或PicoGreen。
6.如权利要求3所述的多重数字核酸分析方法,其特征在于,所述步骤2还包括:所述数字PCR扩增反应可以是需要热循环的PCR核酸扩增,也可以是等温核酸扩增(isothermalamplification)的方法。
7.如权利要求3所述的多重数字核酸分析方法,其特征在于,所述步骤3中获得所述数字熔解曲线的方法为:
设置一个步进的温度梯度,从低于双链核酸解旋的温度逐渐升温到所述双链核酸解旋的温度,每度采集荧光图片,得到一系列随温度变化的荧光图片;通过监控所述芯片上每个微孔随时间变化的荧光值的变化,并将其拟合成一条光滑的曲线,可以得到所述每个微孔的所述扩增产物的所述熔解曲线;对其求一阶导数,可以得到所述熔解曲线的峰值(Tm)图。
8.如权利要求6所述的多重数字核酸分析方法,其特征在于,所述温度梯度包括小于0.25摄氏度的阶梯;所述低于双链核酸解旋的温度包括65℃;所述双链核酸解旋的温度包括95℃。
9.如权利要求3所述的多重数字核酸分析方法,其特征在于,所述步骤3还包括:.通过扩增产物或扩增引物的设计,使不同的目标核酸的扩增产物具有不同的特征熔解曲线或熔解温度;并采用熔解曲线模拟软件(uMELT)预测扩增子的所述熔解温度;在实时荧光定量PCR仪上验证所述熔解温度。
10.如权利要求3所述的多重数字核酸分析方法,其特征在于,所述步骤3中的定量分析的方法包括泊松分布法。
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