[发明专利]用于对虾肝肠孢虫荧光定量PCR检测的引物及方法在审
申请号: | 202110925920.4 | 申请日: | 2021-08-12 |
公开(公告)号: | CN113512607A | 公开(公告)日: | 2021-10-19 |
发明(设计)人: | 叶键;许婷;施礼科;姜路辛;陈凡;郭水荣;王力;蒋静;陈喆 | 申请(专利权)人: | 杭州市农业技术推广中心 |
主分类号: | C12Q1/6893 | 分类号: | C12Q1/6893;C12Q1/6851;C12Q1/06;C12N15/11 |
代理公司: | 杭州丰禾专利事务所有限公司 33214 | 代理人: | 王静 |
地址: | 310017 浙江省杭*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 对虾 肝肠 荧光 定量 pcr 检测 引物 方法 | ||
1.一种用于快速检测对虾肝肠孢虫的荧光定量PCR法的特异性引物,其特征在于,该引物包含引物EHP146F和引物EHP146R,
所述的引物EHP146F的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示;
所述的引物EHP146R的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示;
其扩增序列146bp。
2.一种用于检测对虾肝肠孢虫SWP基因的标准品试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包含SWP标准质粒以及权利要求1所述的特异性引物。
3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,该试剂盒还包括阴性质控品和阳性质控品,阴性质控品为含pMD19T空质粒的克隆菌株菌悬液,阳性质控品为SWP克隆菌株的菌悬液。
4.一种检测对虾肝肠孢虫的荧光定量PCR方法,其特征在于,所述方法采用权利要求2或3所述的标准品试剂盒,所述方法包括以下步骤:
步骤1:样本的采集及提取,幼体、仔虾及小于2cm的幼虾取完整个体,大于2cm的幼虾、亚成年虾及成虾取肝胰腺;样品采集10~50mg,采用QiagenDNAMiniKit试剂盒提取样品总DNA;
步骤2:将提取的待检样品和标准质粒置于荧光定量PCR反应体系中进行PCR扩增及荧光信号监测;所述PCR反应体系包括所述引物及Takara TB Green Premix Ex TaqTM II试剂;同时设置阳性质控品、阴性质控品对照和无模板对照;
步骤3:根据标准质粒扩增的Cq值,绘制标准曲线;
步骤4:根据标准曲线及待检样品扩增的Cq值,计算目标样品所含EHP拷贝数;其中:样品Cq35且有明显S型扩增曲线,结果为阳性,并可根据Cq值和标准曲线计算拷贝数;样本Cq本准曲且无明显S型扩增曲线,结果为阴性;阳性质控品Cq值35且有明显S型扩增曲线,同时阴性质控品和无模板对照Cq模板对且无明显S型扩增曲线,判断结果有效。阳性质控品Cq值≥35或阴性质控品和无模板对照Cq值35,判断结果无效。
5.根据权利要求4所述的检测方法,其特征在于,所述荧光定量PCR反应体系总体积为25ul,包括TB Green Premix Ex Taq II(TliRNaseH Plus)(2*)12.5ul,所述的引物EHP146F和引物EHP146R各1.25ul,待检样品DNA或标准质粒1ul,灭菌水9ul。
6.根据权利要求4所述的检测方法,其特征在于,所述荧光定量PCR扩增反应程序为95℃30s;40个循环,95℃5s,51℃30s。
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